WikiSort.ru - Не сортированное

Синдекан 1
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 4GVC, 4GVD
Идентификаторы
Символ	SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan
Внешние ID	OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: SDC1 Gene
Генная онтология Функция • glycoprotein binding • protein binding • protein C-terminus binding • cytoskeletal protein binding Компонент клетки • cytoplasm • Golgi lumen • plasma membrane • integral component of plasma membrane • focal adhesion • external side of plasma membrane • lysosomal lumen • protein complex • extracellular vesicular exosome Биологический процесс • retinoid metabolic process • ureteric bud development • carbohydrate metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • inflammatory response • phototransduction, visible light • response to toxic substance • extracellular matrix organization • glycosaminoglycan metabolic process • chondroitin sulfate metabolic process • wound healing • lipoprotein metabolic process • odontogenesis • response to hydrogen peroxide • small molecule metabolic process • myoblast development • response to glucocorticoid • response to cAMP • response to calcium ion • striated muscle cell development • Sertoli cell development • canonical Wnt signaling pathway Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	6382	20969
Ensembl	ENSG00000115884	ENSMUSG00000020592
UniProt	P18827	P18828
RefSeq (мРНК)	NM_001006946	NM_011519
RefSeq (белок)	NP_001006947	NP_035649
Локус (UCSC)	Chr 2: 20.4 – 20.43 Mb	Chr 12: 8.77 – 8.79 Mb
Поиск в PubMed
Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1.

Функции

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.^[1]

Структура

Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1.

Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживления раны.

Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин.

Применение

Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток^[2], если известно, что клетки произошли из клеток крови.^[3]

См. также

• Синдеканы
• Синдекан 2

Примечания

Литература

• Teng YH, Aquino RS, Park PW (January 2012). “Molecular functions of syndecan-1 in disease”. Matrix Biol. 31 (1): 3—16. DOI:10.1016/j.matbio.2011.10.001. PMID 22033227. Используется устаревший параметр |month= (справка)
• Katz BZ (June 2010). “Adhesion molecules--The lifelines of multiple myeloma cells”. Semin. Cancer Biol. 20 (3): 186—95. DOI:10.1016/j.semcancer.2010.04.003. PMID 20416379. Используется устаревший параметр |month= (справка)
• Bass MD, Morgan MR, Humphries MJ (March 2009). “Syndecans shed their reputation as inert molecules”. Sci Signal. 2 (64): pe18. DOI:10.1126/scisignal.264pe18. PMC 3328204. PMID 19336838. Используется устаревший параметр |month= (справка)

Ссылки

• Клеточный матрикс. Синдекан.