WikiSort.ru - Не сортированное

CLEC4M
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH
Идентификаторы
Символы	CLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M
Внешние IDs	MGI: 2157942 HomoloGene: 129771 GeneCards: 10332
Генная онтология Функции • peptide antigen binding • virus receptor activity • связывание с ионом металла • calcium-dependent protein binding • mannose binding • virion binding • ICAM-3 receptor activity • связывание углеводов • signaling receptor activity • связывание с белками плазмы Компонент клетки • цитоплазма • часть мембраны • мембрана • клеточная мембрана • часть клеточной мембраны • внеклеточная область • host cell Биологический процесс • leukocyte cell-cell adhesion • cell-cell recognition • intracellular transport of virus • intracellular signal transduction • antigen processing and presentation • Эндоцитоз • adaptive immune response • immune system process • viral replication • peptide antigen transport • modulation by virus of host morphology or physiology • врождённый иммунный ответ • вирусный процесс • virion attachment to host cell • Viral entry Источники:Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10332	170786
Ensembl	ENSG00000104938	ENSMUSG00000031494
UniProt	Q9H2X3	Q91ZX1
RefSeq (мРНК)	NM_001144904 NM_001144905 NM_001144906 NM_001144907 NM_001144908 NM_001144909 NM_001144910 NM_001144911 NM_014257 NM_214675 NM_214676	NM_133238
RefSeq (белок)	NP_001138376 NP_001138377 NP_001138378 NP_001138379 NP_001138380 NP_001138381 NP_001138382 NP_001138383 NP_055072	NP_573501
Локус (UCSC)	Chr 19: 7.76 – 7.77 Mb	Chr 8: 3.74 – 3.75 Mb
Поиск PubMed
Викиданные
Просмотр/Править (Человек)		Просмотр/Править (Мышь)

CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M, лектин С-типа домен семейство 4 член M; CD299), или L-SIGN, — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CLEC4M^[1].

Функции

Белок является мембранным белком 2-го типа. На 77% гомологичен белку CD209. Оба белка связывают белок клеточной адгезии ICAM-3 и вирусный белок HIV-1 gp120. Взаимодействие с HIV-1 gp120 повышает инфекцию вирусом T-лимфоцитов. Обнаружены множественные варианты белка из-за альтернативного сплайсинга. Ген CLEC4M находится на 19p13.3 в кластере с CD209 и CD23/FCER2^[2].

Относится к рецепторам опознавания паттерна, участвует в периферийном иммунном ответе в печени. Может опосредовать эндоцитоз патогенов, ведущего к последующей деградации патогена в лизосомах. Рецептор ICAM3 и, возможно, маннозо-подобных углеводов.

Примечания

Литература

• Baribaud F, Doms RW, Pöhlmann S (2006). “The role of DC-SIGN and DC-SIGNR in HIV and Ebola virus infection: can potential therapeutics block virus transmission and dissemination?”. Expert Opin. Ther. Targets. 6 (4): 423—31. DOI:10.1517/14728222.6.4.423. PMID 12223058.
• Becker Y (2004). “HIV-1 gp120 binding to dendritic cell receptors mobilize the virus to the lymph nodes, but the induced IL-4 synthesis by FcepsilonRI+ hematopoietic cells damages the adaptive immunity--a review, hypothesis, and implications”. Virus Genes. 29 (1): 147—65. DOI:10.1023/B:VIRU.0000032797.43537.d3. PMID 15215692.
• Lalor PF, Lai WK, Curbishley SM, et al. (2006). “Human hepatic sinusoidal endothelial cells can be distinguished by expression of phenotypic markers related to their specialised functions in vivo”. World J. Gastroenterol. 12 (34): 5429—39. DOI:10.3748/wjg.v12.i34.5429. PMID 17006978.
• Curtis BM, Scharnowske S, Watson AJ (1992). “Sequence and expression of a membrane-associated C-type lectin that exhibits CD4-independent binding of human immunodeficiency virus envelope glycoprotein gp120”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89 (17): 8356—60. DOI:10.1073/pnas.89.17.8356. PMC 49917. PMID 1518869.
• Gattegno L, Ramdani A, Jouault T, et al. (1992). “Lectin-carbohydrate interactions and infectivity of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)”. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 8 (1): 27—37. DOI:10.1089/aid.1992.8.27. PMID 1736938.
• Soilleux EJ, Barten R, Trowsdale J (2000). “DC-SIGN; a related gene, DC-SIGNR; and CD23 form a cluster on 19p13”. J. Immunol. 165 (6): 2937—42. DOI:10.4049/jimmunol.165.6.2937. PMID 10975799.
• Pöhlmann S, Soilleux EJ, Baribaud F, et al. (2001). “DC-SIGNR, a DC-SIGN homologue expressed in endothelial cells, binds to human and simian immunodeficiency viruses and activates infection in trans”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (5): 2670—5. DOI:10.1073/pnas.051631398. PMC 30196. PMID 11226297.
• Bashirova AA, Geijtenbeek TB, van Duijnhoven GC, et al. (2001). “A dendritic cell-specific intercellular adhesion molecule 3-grabbing nonintegrin (DC-SIGN)-related protein is highly expressed on human liver sinusoidal endothelial cells and promotes HIV-1 infection”. J. Exp. Med. 193 (6): 671—8. DOI:10.1084/jem.193.6.671. PMC 2193415. PMID 11257134.
• Mummidi S, Catano G, Lam L, et al. (2001). “Extensive repertoire of membrane-bound and soluble dendritic cell-specific ICAM-3-grabbing nonintegrin 1 (DC-SIGN1) and DC-SIGN2 isoforms. Inter-individual variation in expression of DC-SIGN transcripts”. J. Biol. Chem. 276 (35): 33196—212. DOI:10.1074/jbc.M009807200. PMID 11337487.
• Mitchell DA, Fadden AJ, Drickamer K (2001). “A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands”. J. Biol. Chem. 276 (31): 28939—45. DOI:10.1074/jbc.M104565200. PMID 11384997.
• Feinberg H, Mitchell DA, Drickamer K, Weis WI (2002). “Structural basis for selective recognition of oligosaccharides by DC-SIGN and DC-SIGNR”. Science. 294 (5549): 2163—6. DOI:10.1126/science.1066371. PMID 11739956.
• Alvarez CP, Lasala F, Carrillo J, et al. (2002). “C-type lectins DC-SIGN and L-SIGN mediate cellular entry by Ebola virus in cis and in trans”. J. Virol. 76 (13): 6841—4. DOI:10.1128/JVI.76.13.6841-6844.2002. PMC 136246. PMID 12050398.
• Soilleux EJ, Morris LS, Rushbrook S, et al. (2002). “Expression of human immunodeficiency virus (HIV)-binding lectin DC-SIGNR: Consequences for HIV infection and immunity”. Hum. Pathol. 33 (6): 652—9. DOI:10.1053/hupa.2002.124036. PMID 12152166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Lin G, Simmons G, Pöhlmann S, et al. (2003). “Differential N-linked glycosylation of human immunodeficiency virus and Ebola virus envelope glycoproteins modulates interactions with DC-SIGN and DC-SIGNR”. J. Virol. 77 (2): 1337—46. DOI:10.1128/JVI.77.2.1337-1346.2003. PMC 140807. PMID 12502850.
• Pöhlmann S, Zhang J, Baribaud F, et al. (2003). “Hepatitis C virus glycoproteins interact with DC-SIGN and DC-SIGNR”. J. Virol. 77 (7): 4070—80. DOI:10.1128/JVI.77.7.4070-4080.2003. PMC 150620. PMID 12634366.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). “Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40—5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Engering A, van Vliet SJ, Hebeda K, et al. (2004). “Dynamic populations of dendritic cell-specific ICAM-3 grabbing nonintegrin-positive immature dendritic cells and liver/lymph node-specific ICAM-3 grabbing nonintegrin-positive endothelial cells in the outer zones of the paracortex of human lymph nodes”. Am. J. Pathol. 164 (5): 1587—95. DOI:10.1016/S0002-9440(10)63717-0. PMC 1615649. PMID 15111305.