WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Факторы транскрипции (транскрипционные факторы) — белки́, контролирующие процесс синтеза мРНК на матрице ДНК (транскрипцию) путём связывания со специфичными участками ДНК[1][2]. Транскрипционные факторы выполняют свою функцию либо самостоятельно, либо в комплексе с другими белками. Они обеспечивают снижение (репрессоры) или повышение (активаторы) константы связывания РНК-полимеразы с регуляторными последовательностями регулируемого гена[3][4][5].

Определяющая черта факторов транскрипции — наличие в их составе одного или более ДНК-связывающих доменов, которые взаимодействуют с характерными участками ДНК, расположенными в регуляторных областях генов. Другие белки, играющие ключевую роль в регуляции экспрессии генов, такие как коактиваторы, гистонацетилазы, киназы, метилазы, не имеют ДНК-связывающих доменов, и, следовательно, не могут быть причислены к транскрипционным факторам[6][7][8].

Структура комплекса TATA-связывающего белка/транскрипционного фактора TF(II)B из археи Pyrococcus woesei с ДНК по результатам рентгеноструктурного анализа. Сверху — схематичное изображение третичной структуры, снизу — молекулярной поверхности комплекса

Консервативность у различных организмов

Факторы транскрипции необходимы для регуляции экспрессии генов и обнаружены у всех живых организмов. Их количество, как абсолютное, так и удельное, возрастает с ростом размера генома[9].

В геноме человека обнаружено более 2600 белков, имеющих ДНК-связывающий домен, и большинство из них предположительно являются факторами транскрипции[10]. Следовательно, около 10 % всех генов в геноме кодируют транскрипционные факторы. Таким образом, они являются самым большим семейством белков человека[11]. Более того, активность многих генов регулируется корпоративным взаимодействием большого числа различных факторов транскрипции, что позволяет обеспечить каждому из генов уникальный способ регуляции в процессе развития организма[8].

Функции

Факторы транскрипции — одна из групп белков, обеспечивающих прочтение и интерпретацию генетической информации. Они связывают ДНК и способствуют инициации программы повышения или понижения транскрипции гена. Таким образом, они жизненно необходимы для нормального функционирования организма на всех уровнях. Ниже перечислены важнейшие из процессов, в которые вовлечены факторы транскрипции.

Регуляция базальной экспрессии генов

Фоновая транскрипционная активность обеспечивается набором ТФ, общим для всех генов. Важный класс эукариотических факторов транскрипции — GTFs (general transcription factors).[12][13] Многие из его представителей не связывают ДНК непосредственно, а входят в состав комплекса инициации транскрипции (преинициирующего комплекса), который напрямую взаимодействует с РНК-полимеразой. Наиболее распространенными GTF являются TFIIA, TFIIB, TFIID (связываются с т. н. ТАТА-боксом (элементом промотора)), TFIIE, TFIIF, и TFIIH.[14]

Помимо ТФ, необходимых для экспрессии всех генов, существуют также специфичные факторы транскрипции, обеспечивающие включение/выключение определенных генов в нужный момент.

Регуляция онтогенеза

Многие ТФ многоклеточных организмов вовлечены в обеспечение их развития.[15] Действуя в соответствии с генетической программой и/или в ответ на внешние воздействия, они инициируют или подавляют транскрипцию определенных генов, что влечет за собой изменения в клеточной морфологии, клеточную дифференциацию, морфогенез, органогенез и т. д. Например, семейство гомеобоксных ТФ критично для формирования правильной морфологии тела у организмов от дрозофилы до человека.[16][17] Мутации генов этих белков (гомеозисные мутации) у дрозофил приводят к серьёзным нарушениям в дифференцировке сегментов тела данных насекомых (например, развитие ног вместо усиков).

Другой пример данной группы ТФ — продукт гена полопределяющего региона Y (SRY, Sex-determining Region Y), который играет важную роль в детерминации пола человека.[18]

Ответ на внеклеточные сигналы

Согласованная регуляция взаимодействия клеток многоклеточного организма осуществляется путём высвобождения специальных молекул (гормонов, цитокинов и т. п.), которые вызывают сигнальный каскад в клетках-мишенях. В случае, если сигнал вызывает изменение уровня экспрессии определенных генов, конечным звеном каскада часто оказываются ТФ.[19] Эстрогеновый сигнальный путь — пример короткого каскада, включающего транскрипционный фактор рецептора эстрогена: эстроген секретируется тканями плаценты и яичника, преодолевает плазматическую мембрану реципиентных клеток, и связывается со своим рецептором в цитоплазме. Рецептор эстрогена проникает в ядро и связывает специфичный участок ДНК, изменяя регуляции транскрипции соответствующего гена.[20]

Ответ на изменение окружающей среды

ТФ — не единственные конечные звенья сигнальных каскадов, возникающих в ответ на различные внешние стимулы, но они тоже могут быть эффекторами в сигнальных каскадах, индуцируемых воздействием окружающей среды. Например, фактор теплового шока (HSF) активирует гены белков теплового шока, которые обеспечивают выживание при повышении температуры (например, шапероны)[21], фактор, индуцируемый гипоксией (HIF) — при снижении концентрации кислорода[22]; белок SREBP (sterol regulatory element binding protein) помогает поддерживать необходимое содержание липидов в клетках.[23]

Контроль клеточного цикла

Многие ТФ, особенно онкогены и онкосупрессоры, участвуют в регуляции клеточного цикла. Они определяют переход от одной фазы клеточного цикла к другой, частоту делений и интенсивность роста. Один из наиболее известных подобных ТФ — онкоген Myc, играющий важную роль в росте клеток и направлении их в апоптоз.

Регуляция

Все общебиологические процессы имеют многоуровневую регуляцию и контроль. Это верно и для ТФ — ТФ не только обеспечивают регуляцию уровня накопления белков и РНК в клетке, но и регулируют активность собственных генов (часто с помощью других ТФ). Ниже кратко описаны основные способы регуляции активности ТФ.

Общие для всех белков

Уровень накопления ТФ в клетке регулируется по той же схеме, что и у других белков за счет контроля транскрипции, деградации мРНК, трансляции, постпроцессинга белка, его внутриклеточной локализации и деградации. Возможна саморегуляция по принципу отрицательной обратной связи — ТФ репрессирует активность кодирующего его гена.

Внутриядерная локализация

У эукариотических организмов процессы транскрипции и трансляции пространственно разделены — они происходят в ядре и цитоплазме соответственно. После синтеза ТФ должны проникнуть в ядро, преодолев двойную мембрану. Многие белки, функционирующие в ядре, имеют сигнал ядерной локализации — специфичный участок полипептидной цепи, адресующий белок в ядро. Для многих ТФ транслокация является ключевым фактором в регуляции их активности.[24] Важные классы ТФ, такие как некоторые ядерные рецепторы, должны сперва связать эндогенный лиганд-агонист в цитоплазме и только потом транспортироваться в ядро.[24]

Активация

ТФ могут быть активированы/деактивированны путём воздействия на их сигнал-чувствительный домен различным образом:

  • связывание лиганда — необходимой для функционирования субстанции, не входящий в состав полипептида (например, ионов Zn2+)
  • фосфорилирование[25][26] — многие ТФ должны быть фосфорилированы для получения возможности связывать ДНК.
  • взаимодействие с другими ТФ и/или корегуляторными белками.

Доступность сайта связывания ДНК

У эукариот гены, не транскрибируемые постоянно, часто находятся в гетерохроматине (участках ДНК, плотно упакованных за счет связывания гистонов и организованных в компактные хроматиновые фибриллы). ДНК в составе гетерохроматина недоступна для многих факторов транскрипции. Для того, чтобы ТФ могли связаться с ДНК, гетерохроматин должен быть трансформирован в эухроматин, обычно путём модификаций гистонов. Также для связывания ТФ с ДНК важную роль играет свобода хроматина от нуклеосом. Хроматин свободный от нуклеосом называется открытым хроматином и значительно чаще связывает факторы транскрипции, чем связанный с нуклеосомами хроматин. Перераспределение нуклеосом осуществляют факторы ремоделирования хроматина. Сайт связывания ТФ на ДНК может быть недоступным и в случае, если он связан другим фактором транскрипции. Пары факторов транскрипции могут играть антагонистическую роль (активатор — репрессор) при регуляции активности одного гена.

Наличие других кофакторов/транскрипционных факторов

Большинство ТФ не работают в одиночку. Часто для активации транскрипции гена с его регуляторными элементами должно связаться большое количество ТФ. Связывании ТФ вызывает привлечение промежуточных белков, таких как кофакторы, что приводит к сборке преинициационного комплекса и посадке на промотор РНК-полимеразы.

Структура

ТФ являются модульными по структуре и содержат следующие домены[1]:

  • ДНК-связывающий домен (DBD) — взаимодействует со специфичными последовательностями ДНК, характерными для промоторов и энхансеров. Специфичность распознавания определенных последовательностей определяет набор генов, подверженных регуляции данным ТФ;
  • трансактивирующий домен (TAD) — содержит участки связывания других белков, например, транскрипционных корегуляторов[27] ;
  • сигналраспознающий домен (SSD) (например, лиганд-связывающий домен), который чувствителен к внешнем сигналам и отвечающим за передачу сигнала к другим компонентам транскрипционного комплекса, что вызывает повышение или понижение уровня экспрессии.

ДНК-связывающий домен

Структурно-функциональная единица (домен) факторов транскрипции, связывающая ДНК, называется ДНК-связывающим доменом. Ниже приведен список важнейших семейств ДНК-связывающих доменов/ТФ:

Семейство NCBI conserved domains База данных структурной классификации белков (SCOP) База данных InterPro
Спираль-петля-спираль (helix-loop-helix)[28] cl00228 47460 IPR001092
Лейциновая молния[29] cl02576 57959 IPR004827
C-концевые эффекторные домены составных регуляторов ответа 46894 IPR001789
GCC box cl00033 54175
Спираль-поворот-спираль (helix-turn-helix)[30] cl02600
Гомеодоменные белки — связывают гомеобокс (особый участок ДНК). Играют критическую роль в индивидуальном развитии организмов (онтогенезе).[31] cd00086 46689 IPR009057
Подобные репрессору фага лямбда 47413 IPR010982
srf-подобные cl00109 55455 IPR002100
Парный бокс[32] cl09102
winged helix 46785 IPR011991
Цинковые пальцы[33]
* многодоменные цинковые пальцы типа Cys2His2[34] pfam00096 57667 IPR007087
* Zn2/Cys6 57701
* цинковые пальцы типа Zn2/Cys8 ядерных рецепторов гормонов pfam00105 57716 IPR001628

Сайты связывания ТФ

Участки ДНК, которые взаимодействуют с факторами транскрипции, называются сайтами связывания ТФ. Взаимодействие осуществляется за счет электростатических сил, водородных связей и сил Ван-дер-Ваальса. За счет корпоративного, стерически детерминированного действия данных сил, которое определяется пространственной структурой белковой молекулы, ТФ связываться только с определенными участками ДНК. Не все нуклеотидные основания в ДНК, входящие в сайт связывания ТФ, имеют одинаковую значимость при взаимодействии с белком. Вследствие этого, ТФ обычно связывают не участок со строго определенной первичной структурой, а группу структур с близким сходством, каждую — с разной степенью сродства. Например, хотя консенсусной последовательностью сайта связывания ТАТА-связывающих белков является ТАТАААА, они могут взаимодействовать также с ТАТАТАТ и ТАТАТАА.

Вследствие того, что ТФ взаимодействуют с короткими участками ДНК гетерогенной структуры, потенциальные сайты связывания ТФ могут возникать случайно в достаточно протяженной молекуле ДНК. Маловероятно, однако, что ТФ взаимодействуют со всеми подходящими элементами в геноме.

Различные ограничения, такие как доступность сайтов и наличие кофакторов, могут способствовать направлению ТФ в нужные участки ДНК. Таким образом, затруднительно на основании последовательности генома достоверно предсказать реальное место посадки ТФ на ДНК in vivo. Дополнительная специфичность ТФ может опосредоваться наличием нескольких ДНК связывающих доменов в составе одного белка, которые взаимодействуют с двумя или более смежными последовательностями одновременно.

Клинические аспекты

В связи с ключевой ролью ТФ в процессе реализации наследственной информации, некоторые заболевания человека могут быт вызваны мутациями в генах ТФ. Ниже приведены некоторые наиболее изученные нарушения подобного рода:

  • Rett syndrome. Мутации в гене ТФ MeCP2 ассоциированы с синдромом Ретта, нейродегенеративным (? neurodevelopmental) заболеванием[35]
  • Диабеты. Редкая форма диабета, называемая MODY (Maturity onset diabetes of the young) может быть обусловлена мутациями в генах некоторых ТФ.[36]
  • Developmental verbal dyspraxia. (нарушение речевых функций). Мутации в гене ТФ FOXP2 ассоциированы с развитием данного заболевания, при котором человек не может производить координированных движений, необходимых для речевой функции.[37][38]
  • Аутоиммунные заболевания. Мутации в гене ТФ FOXP3 связаны с аутоимунным заболеванием IPEX (immune dysregulation polyendocrinopathy enteropathy X-linked syndrome).[38]
  • Рак. Многие факторы транскрипции являются онкогенами или онкосупрессорами, и их мутации или неправильная регуляция могут приводить к развитию рака. Например, синдром Li-Fraumeni обусловлен мутациями в гене онкосупрессора p53.[39]

Классификация

ТФ могут классифицироваться по (1) механизму действия, (2) регуляторной функции, (3) структуре ДНК-связывающего домена, а также на натуральные и (5)искусственные.

Механизм действия

По данному признаку выделяют три класса ТФ:

  • Главные факторы транскрипции (GTFs), вовлеченные в образование инициационного комплекса. Наиболее важные из них — TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, и TFIIH. Они присутствуют во всех клетках и взаимодействуют с кором промотора генов, транскрибируемых РНК-полимеразой второго класса.
  • ТФ, взаимодействующие с upstream-участками ДНК, (областями, расположенными до промотора, лежащими относительно него с другой стороны от кодирующей области гена).
  • Индуцируемые ТФ сходны с предыдущим классом, но требуют активации либо ингибирования.

Функция

  1. Конститутивные — присутствуют всегда во всех клетках — главные факторы транскрипции, Sp1, NF1, CCAAT.
  2. Активируемые (активны в определенных условиях)
    1. Участвующие в развитии организма (клетко-специфичные) — экспрессия строго контролируется, но, начав экспрессироваться, не требуют дополнительной активации — GATA, HNF, PIT-1, MyoD, Myf5, Hox, Winged Helix.
    2. Сигнал-зависимые — требуют внешнего сигнала для активации
      1. внеклеточные сигнал-зависимые — ядерные рецепторы
      2. внутриклеточные сигнал-зависимые — активируются низкомолекулярными внутриклеточными соединениями — SREBP, p53, одиночные ядерные рецепторы
      3. мембраносвязанные рецептор-зависимые — фосфорилируются киназами сигнального каскада
        1. резидентные ядерные факторы — находятся в ядре независимо от активации — CREB, AP-1, Mef2
        2. латентные цитоплазматические факторы — в неактивном состоянии локализованы в цитоплазме, после активации транспортируются в ядро — STAT, R-SMAD, NF-kB, Notch, TUBBY, NFAT.

Структурная классификация

ДНК-связывающий домен типа «лейциновая молния» в комплексе с ДНК. Вверху — схематичное изображение молекулярной поверхности, внизу — третичной структуры комплекса.
ДНК-связывающий домен типа «спираль-петля-спираль» в комплексе с ДНК. Вверху — схематичное изображение третичной структуры, внизу — молекулярной поверхности комплекса.

Факторы транскрипции классифицируют на основании сходства первичной структуры (что предполагает и сходство третичной структуры) ДНК-связывающих доменов.[40][41][42]

  • 1 Надкласс: Basic Domains (Basic-helix-loop-helix)
  • 2 Надкласс: Zinc-coordinating DNA-binding domains
    • 2.1 Класс: Cys4 zinc finger of nuclear receptor type
    • 2.2 Класс: diverse Cys4 zinc fingers
    • 2.3 Класс: Cys2His2 zinc finger domain
      • 2.3.1 Семейство: Ubiquitous factors, includes TFIIIA, Sp1
      • 2.3.2 Семейство: Developmental / cell cycle regulators; includes Krüppel
      • 2.3.4 Семейство: Large factors with NF-6B-like binding properties
    • 2.4 Класс: Cys6 cysteine-zinc cluster
    • 2.5 Класс: Zinc fingers of alternating composition
  • 3 Надкласс: Спираль-поворот-спираль
    • 3.1 Класс: Гомеодомен
      • 3.1.1 Семейство: Homeo domain only; includes Ubx
      • 3.1.2 Семейство: POU domain factors; includes Oct
      • 3.1.3 Семейство: Homeo domain with LIM region
      • 3.1.4 Семейство: homeo domain plus zinc finger motifs
    • 3.2 Класс: Paired box
      • 3.2.1 Семейство: Paired plus homeo domain
      • 3.2.2 Семейство: Paired domain only
    • 3.3 Класс: Fork head / winged helix
      • 3.3.1 Семейство: Developmental regulators; includes forkhead
      • 3.3.2 Семейство: Tissue-specific regulators
      • 3.3.3 Семейство: Cell-cycle controlling factors
      • 3.3.0 Семейство: Other regulators
    • 3.4 Класс: Heat Shock Factors
      • 3.4.1 Семейство: HSF
    • 3.5 Класс: Tryptophan clusters
    • 3.6 Класс: TEA (transcriptional enhancer factor) domain
  • 4 Надкласс: beta-Scaffold Factors with Minor Groove Contacts
    • 4.1 Класс: RHR (Rel homology region)
      • 4.1.1 Семейство: Rel/ankyrin; NF-kappaB
      • 4.1.2 Семейство: ankyrin only
      • 4.1.3 Семейство: NF-AT (Nuclear Factor of Activated T-cells) (NFATC1, NFATC2, NFATC3)
    • 4.2 Класс: STAT
      • 4.2.1 Семейство: STAT
    • 4.3 Класс: p53
      • 4.3.1 Семейство: p53
    • 4.4 Класс: MADS box
      • 4.4.1 Семейство: Regulators of differentiation; includes (Mef2)
    • 4.5 Класс: beta-Barrel alpha-helix transcription factors
    • 4.6 Класс: TATA binding proteins
      • 4.6.1 Семейство: TBP
      • 4.7.1 Семейство: SOX genes, SRY
      • 4.7.2 Семейство: TCF-1 (TCF1)
      • 4.7.3 Семейство: HMG2-related, SSRP1
      • 4.7.5 Семейство: MATA
    • 4.8 Класс: Heteromeric CCAAT factors
      • 4.8.1 Семейство: Heteromeric CCAAT factors
    • 4.9 Класс: Grainyhead
      • 4.9.1 Семейство: Grainyhead
    • 4.10 Класс: Cold-shock domain factors
      • 4.10.1 Семейство: csd
    • 4.11 Класс: Runt
      • 4.11.1 Семейство: Runt
  • 0 Надкласс: Другие факторы транскрипции
    • 0.1 Класс: Copper fist proteins
    • 0.2 Класс: HMGI(Y) (HMGA1)
      • 0.2.1 Семейство: HMGI(Y)
    • 0.3 Класс: Pocket domain
    • 0.4 Класс: E1A-like factors
    • 0.5 Класс: AP2/EREBP-related factors
      • 0.5.1 Семейство: AP2
      • 0.5.2 Семейство: EREBP
      • 0.5.3 Надсемейство: AP2/B3
        • 0.5.3.1 Семейство: ARF
        • 0.5.3.2 Семейство: ABI
        • 0.5.3.3 Семейство: RAV

Искусственные факторы транскрипции

Систему CRISPR можно адаптировать так, чтобы она действовала как транскрипционный фактор (crisprTF). Для этого CRISPR-ассоциированный белок, известный как Cas9, изменяют так, чтобы он после связывания с ДНК больше не мог её расщепить. Затем к нему добавляют сегмент, который активирует или подавляет экспрессию генов путём модуляции транскрипционного механизма клетки.[43][44][45][46] В отличие от транскрипционных факторов на базе цинковых пальцев и TAL-эффектора[en], для узнавания ДНК системе CRISPR-Cas требуется только создание соответствующей последовательности РНК-«гида», а не создание новых белковых доменов фермента, что делает его гораздо более доступным благодаря дешевизне и простоте (вплоть до того что разработан набор правил — «грамматика» — описывающих, как спроектировать синтетический транскрипционный фактор (STFS) и программа для его автоматизированного проектирования[47].)

Примечания

  1. 1 2 Latchman DS (1997). “Transcription factors: an overview”. Int. J. Biochem. Cell Biol. 29 (12): 1305—12. DOI:10.1016/S1357-2725(97)00085-X. PMID 9570129.
  2. ↑ Karin M (1990). “Too many transcription factors: positive and negative interactions”. New Biol. 2 (2): 126—31. PMID 2128034.
  3. ↑ Roeder RG (1996). “The role of general initiation factors in transcription by RNA polymerase II”. Trends Biochem. Sci. 21 (9): 327—35. DOI:10.1016/0968-0004(96)10050-5. PMID 8870495.
  4. ↑ Nikolov DB, Burley SK (1997). “RNA polymerase II transcription initiation: a structural view”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (1): 15—22. DOI:10.1073/pnas.94.1.15. PMID 8990153.
  5. ↑ Lee TI, Young RA (2000). “Transcription of eukaryotic protein-coding genes”. Annu. Rev. Genet. 34: 77—137. DOI:10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.
  6. ↑ Mitchell PJ, Tjian R (1989). “Transcriptional regulation in mammalian cells by sequence-specific DNA binding proteins”. Science. 245 (4916): 371–8. DOI:10.1126/science.2667136. PMID 2667136.
  7. ↑ Ptashne M, Gann A (1997). “Transcriptional activation by recruitment”. Nature. 386 (6625): 569–77. DOI:10.1038/386569a0. PMID 9121580.
  8. 1 2 Brivanlou AH, Darnell JE (2002). “Signal transduction and the control of gene expression”. Science. 295 (5556): 813–8. DOI:10.1126/science.1066355. PMID 11823631.
  9. ↑ van Nimwegen E (2003). “Scaling laws in the functional content of genomes”. Trends Genet. 19 (9): 479—84. DOI:10.1016/S0168-9525(03)00203-8. PMID 12957540.
  10. ↑ Babu MM, Luscombe NM, Aravind L, Gerstein M, Teichmann SA (2004). “Structure and evolution of transcriptional regulatory networks”. Curr. Opin. Struct. Biol. 14 (3): 283—91. DOI:10.1016/j.sbi.2004.05.004. PMID 15193307.
  11. ↑ Lambert S, Jolma A, Campitelli L, Pratyush Z, Das K, Yin Y, Albu M, Chen X, Taipae J, Hughes T, Weirauch M (2018). "The Human Transcription Factors". Cell. 172 (4): 650–665. DOI:10.1016/j.cell.2018.01.029.
  12. ↑ Reese JC (April 2003). “Basal transcription factors”. Current opinion in genetics & development. 13 (2): 114—8. DOI:10.1016/S0959-437X(03)00013-3. PMID 12672487. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  13. ↑ Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (2003). “The RNA polymerase II elongation complex”. Annual review of biochemistry. 72: 693—715. DOI:10.1146/annurev.biochem.72.121801.161551. PMID 12676794.
  14. ↑ Thomas MC, Chiang CM (2006). “The general transcription machinery and general cofactors”. Critical reviews in biochemistry and molecular biology. 41 (3): 105—78. PMID 16858867.
  15. ↑ Lobe CG (1992). “Transcription factors and mammalian development”. Current topics in developmental biology. 27: 351—83. PMID 1424766.
  16. ↑ Lemons D, McGinnis W (September 2006). “Genomic evolution of Hox gene clusters”. Science (New York, N.Y.). 313 (5795): 1918—22. DOI:10.1126/science.1132040. PMID 17008523. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  17. ↑ Moens CB, Selleri L (March 2006). “Hox cofactors in vertebrate development”. Developmental biology. 291 (2): 193—206. DOI:10.1016/j.ydbio.2005.10.032. PMID 16515781. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  18. ↑ Ottolenghi C, Uda M, Crisponi L, Omari S, Cao A, Forabosco A, Schlessinger D (January 2007). “Determination and stability of sex”. BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. 29 (1): 15—25. DOI:10.1002/bies.20515. PMID 17187356. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  19. ↑ Pawson T (1993). “Signal transduction--a conserved pathway from the membrane to the nucleus”. Developmental genetics. 14 (5): 333—8. DOI:10.1002/dvg.1020140502. PMID 8293575.
  20. ↑ Osborne CK, Schiff R, Fuqua SA, Shou J (December 2001). “Estrogen receptor: current understanding of its activation and modulation”. Clin. Cancer Res. 7 (12 Suppl): 4338s—4342s, discussion 4411s–4412s. PMID 11916222. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  21. ↑ Shamovsky I, Nudler E (March 2008). “New insights into the mechanism of heat shock response activation”. Cell. Mol. Life Sci. 65 (6): 855—61. DOI:10.1007/s00018-008-7458-y. PMID 18239856. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  22. ↑ Benizri E, Ginouvès A, Berra E (April 2008). “The magic of the hypoxia-signaling cascade”. Cell. Mol. Life Sci. 65 (7–8): 1133—49. DOI:10.1007/s00018-008-7472-0. PMID 18202826. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  23. ↑ Weber LW, Boll M, Stampfl A (November 2004). “Maintaining cholesterol homeostasis: sterol regulatory element-binding proteins”. World J. Gastroenterol. 10 (21): 3081—7. PMID 15457548. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  24. 1 2 Whiteside ST, Goodbourn S (April 1993). “Signal transduction and nuclear targeting: regulation of transcription factor activity by subcellular localisation”. Journal of cell science. 104 ( Pt 4): 949—55. PMID 8314906. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  25. ↑ Bohmann D (November 1990). “Transcription factor phosphorylation: a link between signal transduction and the regulation of gene expression”. Cancer cells (Cold Spring Harbor, N.Y. : 1989). 2 (11): 337—44. PMID 2149275. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  26. ↑ Weigel NL, Moore NL (2007). “Steroid Receptor Phosphorylation: A Key Modulator of Multiple Receptor Functions”. PMID 17536004.
  27. ↑ Wärnmark A, Treuter E, Wright AP, Gustafsson J-Å (2003). “Activation functions 1 and 2 of nuclear receptors: molecular strategies for transcriptional activation”. Mol. Endocrinol. 17 (10): 1901—9. DOI:10.1210/me.2002-0384. PMID 12893880.
  28. ↑ Littlewood TD, Evan GI (1995). “Transcription factors 2: helix-loop-helix”. Protein profile. 2 (6): 621—702. PMID 7553065.
  29. ↑ Vinson C, Myakishev M, Acharya A, Mir AA, Moll JR, Bonovich M (September 2002). “Classification of human B-ZIP proteins based on dimerization properties”. Molecular and cellular biology. 22 (18): 6321—35. DOI:10.1128/MCB.22.18.6321-6335.2002. PMC 135624. PMID 12192032. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  30. ↑ Wintjens R, Rooman M (September 1996). “Structural classification of HTH DNA-binding domains and protein-DNA interaction modes”. Journal of molecular biology. 262 (2): 294—313. DOI:10.1006/jmbi.1996.0514. PMID 8831795. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  31. ↑ Gehring WJ, Affolter M, Bürglin T (1994). “Homeodomain proteins”. Annual review of biochemistry. 63: 487—526. DOI:10.1146/annurev.bi.63.070194.002415. PMID 7979246.
  32. ↑ Dahl E, Koseki H, Balling R (September 1997). “Pax genes and organogenesis”. BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. 19 (9): 755—65. DOI:10.1002/bies.950190905. PMID 9297966. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  33. ↑ Laity JH, Lee BM, Wright PE (February 2001). “Zinc finger proteins: new insights into structural and functional diversity”. Current opinion in structural biology. 11 (1): 39—46. DOI:10.1016/S0959-440X(00)00167-6. PMID 11179890. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  34. ↑ Wolfe SA, Nekludova L, Pabo CO (2000). “DNA recognition by Cys2His2 zinc finger proteins”. Annual review of biophysics and biomolecular structure. 29: 183—212. DOI:10.1146/annurev.biophys.29.1.183. PMID 10940247.
  35. ↑ Fichou Y, Nectoux J, Bahi-Buisson N, Rosas-Vargas H, Girard B, Chelly J, Bienvenu T. (Nov 2008). “The first missense mutation causing Rett syndrome specifically affecting the MeCP2_e1 isoform”. Neurogenetics. PMID 19034540. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  36. ↑ Al-Quobaili F, Montenarh M. (2008). “Pancreatic duodenal homeobox factor-1 and diabetes mellitus type 2 (review)”. Int J Mol Med. 21(4): 399–404. PMID 18360684.
  37. ↑ Lai CS, Fisher SE, Hurst JA, Vargha-Khadem F, Monaco AP. (2001). “A forkhead-domain gene is mutated in a severe speech and language disorder”. Nature. 413(6855): 519–523. PMID 11586359.
  38. 1 2 Banerjee-Basu S, Baxevanis AD (2004). “Structural analysis of disease-causing mutations in the P-subfamily of forkhead transcription factors”. Proteins. 54(4): 639–647. PMID 14997560.
  39. ↑ Ariffin H, Martel-Planche G, Daud SS, Ibrahim K, Hainaut P. (2008). “Li-Fraumeni syndrome in a Malaysian kindred”. Cancer Genet Cytogenet. 186(1): 49–53. PMID 18786442.
  40. ↑ Stegmaier P, Kel AE, Wingender E (2004). “Systematic DNA-binding domain classification of transcription factors”. Genome informatics. International Conference on Genome Informatics. 15 (2): 276—86. PMID 15706513.
  41. ↑ Matys V, Kel-Margoulis OV, Fricke E, Liebich I, Land S, Barre-Dirrie A, Reuter I, Chekmenev D, Krull M, Hornischer K, Voss N, Stegmaier P, Lewicki-Potapov B, Saxel H, Kel AE, Wingender E (2006). “TRANSFAC and its module TRANSCompel: transcriptional gene regulation in eukaryotes”. Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D108—10. DOI:10.1093/nar/gkj143. PMID 16381825.
  42. ↑ TRANSFAC® database. Проверено 5 августа 2007. Архивировано 22 марта 2012 года.
  43. ↑ Lei S. Qi, Matthew H. Larson, Luke A. Gilbert, Jennifer A. Doudna, Jonathan S. Weissman, Adam P. Arkin, Wendell A. Lim.(2013) Repurposing CRISPR as an RNA-Guided Platform for Sequence-Specific Control of Gene Expression. Cell, 152 (5): 1173-1183 DOI:10.1016/j.cell.2013.02.022
  44. ↑ Fahim Farzadfard, Samuel D. Perli, Timothy K. Lu.(2013) Tunable and Multi-Functional Eukaryotic Transcription Factors Based on CRISPR/Cas. ACS Synthetic Biology, 130826155600004 DOI:10.1021/sb400081r
  45. ↑ Gilbert, L. A., Larson, M. H., Morsut, L., et al. & Qi, L. S. (2013) . CRISPR-Mediated Modular RNA-Guided Regulation of Transcription in Eukaryotes. Cell, 154(2), 442-451 DOI:10.1016/j.cell.2013.06.044
  46. ↑ Perez-Pinera, P., Kocak, D. D., Vockley, C. M., et al. & Gersbach, C. A. (2013). RNA-guided gene activation by CRISPR-Cas9-based transcription factors. Nature methods, 10(10), 973-976. DOI:10.1038/nmeth.2600
  47. ↑ Purcell, O., Peccoud, J., & Lu, T. K. (2013). Rule-based design of synthetic transcription factors in eukaryotes. ACS Synthetic Biology. DOI:10.1021/sb400134k

См. также

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .



Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2024
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии