WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Факторы, индуцируемые гипоксией, также HIFs (сокр. от англ. Hypoxia-inducible factors) — группа транскрипционных факторов, которая реагируют на уменьшение количества кислорода в клетках или на гипоксию[1][2].

Структура

Большинство, если не все, аэробные виды живых существ экспрессируют высококонсервативный транскрипционный комплекс HIF-1, который является гетеродимером, состоящим из альфа- и бета-субъединиц, причём последний представляет собой конститутивно-экспрессированный ядерный транслокатор рецептора AHR (ARNT)[3][4]. HIF-1 относится к подсемейству PER-ARNT-SIM (PAS) базового семейства транскрипционных факторов, основанного на мотиве спираль-петля-спираль (bHLH). Альфа и бета-субъединица сходны по структуре и обе содержат следующие домены[5][6][7]:

  • N-конец — домен bHLH для связывания ДНК
  • центральный регион — домен Per-ARNT-Sim (PAS), который облегчает гетеродимеризацию
  • С-конец — укомплектовка (рекрутинг) транскрипционных корегуляторных белков.
Фактор, индуцируемый гипоксией-1

Структура комплекса HIF-1α-pVHL-ElonginB-ElonginC .[8]
Идентификаторы
Символ HIF-1
Pfam PF11413
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
Область трансактивации С-конца HIF-1α

Структура HIF-1α.[9]
Идентификаторы
Символ HIF-1a_CTAD
Pfam PF08778
InterPro IPR014887
SCOP 1l3e
SUPERFAMILY 1l3e
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель

Члены семейства

В таблице указаны члены семейства HIF человека:

название ген белок
HIF-1α HIF1A Фактор, индуцируемый гипоксией 1, альфа-субъединица
HIF-1β ARNT Ядерный транслокатор AHR
HIF-2α EPAS1 эндотелиальный белок домена PAS1
HIF-2β ARNT2 Ядерный транслокатор 2 рецептора AHR
HIF-3α HIF3A Фактор, индуцируемый гипоксией 3, альфа-субъединица
HIF-3β ARNTL Ядерный транслокатор 3 рецептора AHR

Выполняемые функции

Каскад сигнализации HIF опосредует влияние гипоксии, состояния низкой концентрации кислорода, воздействующей клетку. Гипоксия часто препятствует дифференцировке клеток. Однако гипоксия способствует образованию кровеносных сосудов и имеет важное значение для формирования сосудистой системы у эмбрионов и злокачественных опухолей. Гипоксия в ранах также способствует миграции кератиноцитов и восстановлению эпителия[10].

В целом, HIFs имеют жизненно важное значение для развития. У млекопитающих удаление генов HIF-1 приводит к перинатальной смерти. Было показано, что HIF-1 имеет жизненно важное значение для выживания хондроцитов, позволяя клеткам адаптироваться к условиям с низким содержанием кислорода при эндохондриальной оссицификации в костях. HIF играет центральную роль в регуляции метаболизма человека[11].

Механизм действия

Альфа-субъединицы HIF гидроксилируются в консервативных остатках пролина с помощью HIF-пролилгидроксилаз, она позволяет их распознавать и убиквитинировать посредством VHL убиквитин-E3-лигазы, которая маркикрует их для быстрой деградации протеасомами[12]. Это происходит только в нормоксических условиях. В гипоксических условиях ингибитор HIF-пролилгидроксилазы ингибируется, поскольку он использует кислород в качестве косубстрата (сопутствующего субстрата)[13].

Ингибирование переноса электрона в комплексе сукцинатдегидрогеназы из-за мутаций в генах SDHB или SDHD может вызвать накопление сукцината, который ингибирует пролиферацию гидроксилазы HIF, тем самым стабилизируя HIF-1α. Такое состояние называется псевдогипоксией.

HIF-1, стабилизированный гипоксическими состояниями, активирует несколько генов, которое способствует выживанию в условиях низкой концентрации кислорода. К ним относятся гликолизные ферменты, которые позволяют синтезировать АТФ независимым от кислорода образом и фактором роста эндотелия сосудов (VEGF), который способствует ангиогенезу. HIF-1 действует путём связывания с HIF-чувствительными элементами (HREs) в промоторах, которые содержат последовательность NCGTG (где N является либо A, либо G).

Было показано, что белок антагонизирующиая А-киназа мышц (mAKAP) организовал убиквитин-E3-лигазу, влияя на стабильность и позиционирование HIF-1 внутри его места действия в ядре. Истощение mAKAP или нарушение его нацеливания на перинуклеарную (в кардиомиоцитах) область изменяет стабильность HIF-1 и транскрипционную активацию генов, связанных с гипоксией. Таким образом, «компартментализация» чувствительных к кислороду сигнальных компонентов может влиять на гипоксический отклик[14].

Передовые знания о молекулярных регуляторных механизмах активности HIF1 в гипоксических условиях резко контрастируют с нехваткой информации о механистических и функциональных аспектах, влияющих на регуляцию HIF1, опосредованной NF-κB, в нормоксических условиях. Тем не менее, стабилизация HIF-1α также обнаруживается в негипоксических условиях через неизвестный до недавнего времени механизм. Было показано, что NF-κB (ядерный фактор κB) является прямым модулятором экспрессии HIF-1α в присутствии нормального давления кислорода. Исследования миРНК (малые интерферирующие РНК) для отдельных членов NF-κB выявили дифференциальные эффекты на уровни мРНК HIF-1α, это указывает на то, что NF-κB может регулировать экспрессию базального HIF-1α. Наконец, было показано, что, когда эндогенный NF-κB индуцируется обработкой TNF-α (фактор некроза опухолей α), уровни HIF-1α также изменяются зависимым от NF-κB[15]. HIF-1 и HIF-2 имеют разные физиологические роли. HIF-2 регулирует продукцию эритропоэтина во взрослой жизни[16].

Примечания

  1. Smith TG, Robbins PA, Ratcliffe PJ (May 2008). “The human side of hypoxia-inducible factor”. British Journal of Haematology. 141 (3): 325—34. DOI:10.1111/j.1365-2141.2008.07029.x. PMC 2408651. PMID 18410568.
  2. Wilkins SE, Abboud MI, Hancock RL, Schofield CJ (April 2016). “Targeting Protein-Protein Interactions in the HIF System”. ChemMedChem [англ.]. 11 (8): 773—86. DOI:10.1002/cmdc.201600012. PMC 4848768. PMID 26997519.
  3. Wang GL, Jiang BH, Rue EA, Semenza GL (June 1995). “Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 92 (12): 5510—4. DOI:10.1073/pnas.92.12.5510. PMC 41725. PMID 7539918.
  4. Jiang BH, Rue E, Wang GL, Roe R, Semenza GL (July 1996). “Dimerization, DNA binding, and transactivation properties of hypoxia-inducible factor 1”. The Journal of Biological Chemistry. 271 (30): 17771—8. DOI:10.1074/jbc.271.30.17771. PMID 8663540.
  5. Zhulin IB, Taylor BL, Dixon R (September 1997). “PAS domain S-boxes in Archaea, Bacteria and sensors for oxygen and redox”. Trends in Biochemical Sciences. 22 (9): 331—3. DOI:10.1016/S0968-0004(97)01110-9. PMID 9301332.
  6. Ponting CP, Aravind L (November 1997). “PAS: a multifunctional domain family comes to light”. Current Biology. 7 (11): R674–7. DOI:10.1016/S0960-9822(06)00352-6. PMID 9382818.
  7. Yang J, Zhang L, Erbel PJ, Gardner KH, Ding K, Garcia JA, Bruick RK (October 2005). “Functions of the Per/ARNT/Sim domains of the hypoxia-inducible factor”. The Journal of Biological Chemistry. 280 (43): 36047—54. DOI:10.1074/jbc.M501755200. PMID 16129688.
  8. Min JH, Yang H, Ivan M, Gertler F, Kaelin WG, Pavletich NP (June 2002). “Structure of an HIF-1alpha -pVHL complex: hydroxyproline recognition in signaling”. Science. 296 (5574): 1886—9. DOI:10.1126/science.1073440. PMID 12004076.
  9. Freedman SJ, Sun ZY, Poy F, Kung AL, Livingston DM, Wagner G, Eck MJ (April 2002). “Structural basis for recruitment of CBP/p300 by hypoxia-inducible factor-1 alpha”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (8): 5367—72. DOI:10.1073/pnas.082117899. PMC 122775. PMID 11959990.
  10. Benizri E, Ginouvès A, Berra E (April 2008). “The magic of the hypoxia-signaling cascade”. Cellular and Molecular Life Sciences. 65 (7—8): 1133—49. DOI:10.1007/s00018-008-7472-0. PMID 18202826.
  11. Formenti F, Constantin-Teodosiu D, Emmanuel Y, Cheeseman J, Dorrington KL, Edwards LM, Humphreys SM, Lappin TR, McMullin MF, McNamara CJ, Mills W, Murphy JA, O'Connor DF, Percy MJ, Ratcliffe PJ, Smith TG, Treacy M, Frayn KN, Greenhaff PL, Karpe F, Clarke K, Robbins PA (July 2010). “Regulation of human metabolism by hypoxia-inducible factor”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (28): 12722—7. DOI:10.1073/pnas.1002339107. PMC 2906567. PMID 20616028.
  12. Maxwell PH, Wiesener MS, Chang GW, Clifford SC, Vaux EC, Cockman ME, Wykoff CC, Pugh CW, Maher ER, Ratcliffe PJ (May 1999). “The tumour suppressor protein VHL targets hypoxia-inducible factors for oxygen-dependent proteolysis”. Nature. 399 (6733): 271—5. DOI:10.1038/20459. PMID 10353251.
  13. Semenza GL (August 2004). “Hydroxylation of HIF-1: oxygen sensing at the molecular level”. Physiology. 19 (4): 176—82. DOI:10.1152/physiol.00001.2004. PMID 15304631.
  14. Wong W, Goehring AS, Kapiloff MS, Langeberg LK, Scott JD (December 2008). “mAKAP compartmentalizes oxygen-dependent control of HIF-1alpha”. Science Signaling. 1 (51): ra18. DOI:10.1126/scisignal.2000026. PMC 2828263. PMID 19109240.
  15. van Uden P, Kenneth NS, Rocha S (June 2008). “Regulation of hypoxia-inducible factor-1alpha by NF-kappaB”. The Biochemical Journal. 412 (3): 477—84. DOI:10.1042/BJ20080476. PMC 2474706. PMID 18393939.
  16. Haase VH (July 2010). “Hypoxic regulation of erythropoiesis and iron metabolism”. American Journal of Physiology. Renal Physiology. 299 (1): F1–13. DOI:10.1152/ajprenal.00174.2010. PMC 2904169. PMID 20444740.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .




Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2024
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии