WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Искусственная бактериальная хромосома (англ. bacterial artificial chromosome, BAC) — векторная система на основе F-плазмиды E. coli, участков cos фага лямбда и loxP фага Р1, используемая для клонирования длинных (150—350^[1] тыс. п.н.) последовательностей ДНК^[2]^[3]^[4]. F-плазмида кодирует гены, регулирующие репликацию и контролирующие копийность (1—2 молекулы на клетку). По участку loxP плазмидная ДНК может быть расщеплена белком Cre фага Р1, по cos-участку — соответствующим ферментом фага лямбда. Схожая векторная система под названием PAC (англ. p1-derived artificial chromosome) была сделана на основе бактериальной P1-плазмиды из ДНК фага P1.

Искусственные бактериальные хромосомы часто используются для секвенирования геномов организмов в различных проектах, например в проекте Геном человека. Короткий фрагмент ДНК исследуемого организма вставляется в хромосому, а затем амплифицируется и секвенируется. После этого прочитанные последовательности выравниваются in silico в результате чего получается полная последовательность генома организма. Сейчас такой подход был вытеснен более быстрыми и менее трудоёмкими методами секвенирования, например методом дробовика или методами секвенирования нового поколения.

Генетические компоненты

repE: регулирует репликацию и количество копий плазмиды.
parA и parB: для распределения ДНК F-плазмиды в дочерние клетки во время деления и стабильного поддержания хромосомы.
Селективный маркёр: часто ген устойчивости к антибиотикам; в некоторых также содержится lacZ в месте клонирование гена, что позволяет проводить бело-голубую селекцию.
T7 и Sp6: фаговые промоторы для транскрипции вставленных генов.

См. также

Искусственная человеческая хромосома^[en]
Искусственная дрожжевая хромосома^[en]
Фосмида^[en]
Космида

Примечания

↑ Stone NE, Fan J-B, Willour V, Pennacchio LA, Warrington JA, Hu A, Chapelle A, Lehesjoki A-E, Cox DR, Myers RM (1996). “Construction of a 750-kb bacterial clone contig and restriction map in the region of human chromosome 21 containing the progressive myoclonus epilepsy gene”. Genome Research. 6 (3): 218—225. DOI:10.1101/gr.6.3.218. PMID 8963899.
↑ O'Connor M, Peifer M, Bender W (1989). “Construction of large DNA segments in Escherichia coli”. Science. 244 (4910): 1307—1312. DOI:10.1126/science.2660262. PMID 2660262.
↑ Shizuya H, Birren B, Kim U-J, Mancino V, Slepak T, Tachiiri Y, Simon M (1992). “Cloning and stable maintenance of 300-kilobase-pair fragments of human DNA in Escherichia coli using an F-factor-based vector”. Proc Natl Acad Sci USA. 89 (18): 8794—8797. DOI:10.1073/pnas.89.18.8794. PMC 50007. PMID 1528894.
↑ Shizuya, H; Kouros-Mehr Hosein (2001). “The development and applications of the bacterial artificial chromosome cloning system” (PDF). Keio J Med. 50 (1): 26—30. DOI:10.2302/kjm.50.26. PMID 11296661.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2024
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[Stone1996-1] Stone NE, Fan J-B, Willour V, Pennacchio LA, Warrington JA, Hu A, Chapelle A, Lehesjoki A-E, Cox DR, Myers RM (1996). “Construction of a 750-kb bacterial clone contig and restriction map in the region of human chromosome 21 containing the progressive myoclonus epilepsy gene”. Genome Research. 6 (3): 218—225. DOI:10.1101/gr.6.3.218. PMID 8963899.

[OConnor1989-2] O'Connor M, Peifer M, Bender W (1989). “Construction of large DNA segments in Escherichia coli”. Science. 244 (4910): 1307—1312. DOI:10.1126/science.2660262. PMID 2660262.

[Shizuya1992-3] Shizuya H, Birren B, Kim U-J, Mancino V, Slepak T, Tachiiri Y, Simon M (1992). “Cloning and stable maintenance of 300-kilobase-pair fragments of human DNA in Escherichia coli using an F-factor-based vector”. Proc Natl Acad Sci USA. 89 (18): 8794—8797. DOI:10.1073/pnas.89.18.8794. PMC 50007. PMID 1528894.

[4] Shizuya, H; Kouros-Mehr Hosein (2001). “The development and applications of the bacterial artificial chromosome cloning system” (PDF). Keio J Med. 50 (1): 26—30. DOI:10.2302/kjm.50.26. PMID 11296661.