WikiSort.ru - Не сортированное

Гистондеацетилаза 2
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 3MAX, 4LXZ, 4LY1
Идентификаторы
Символ	HDAC2 ; HD2; RPD3; YAF1
Внешние ID	OMIM: 605164 MGI: 1097691 HomoloGene: 68187 ChEMBL: 1937 GeneCards: HDAC2 Gene
номер EC	3.5.1.98
Генная онтология Функция • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding • core promoter binding • RNA polymerase II repressing transcription factor binding • chromatin binding • sequence-specific DNA binding transcription factor activity • histone deacetylase activity • protein binding • transcription factor binding • deacetylase activity • enzyme binding • heat shock protein binding • nucleosomal DNA binding • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • protein deacetylase activity • sequence-specific DNA binding • poly(A) RNA binding • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific) • NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific) • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K18 specific) Компонент клетки • nuclear chromatin • heterochromatin • nucleus • nucleoplasm • replication fork • transcription factor complex • cytoplasm • Sin3 complex • NuRD complex • ESC/E(Z) complex • protein complex Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • chromatin remodeling • maintenance of chromatin silencing • transcription, DNA-templated • blood coagulation • positive regulation of cell proliferation • epidermal cell differentiation • positive regulation of receptor biosynthetic process • negative regulation of neuron projection development • dendrite development • histone deacetylation • hippocampus development • circadian regulation of gene expression • positive regulation of collagen biosynthetic process • cellular response to heat • response to cocaine • odontogenesis of dentin-containing tooth • response to drug • embryonic digit morphogenesis • ATP-dependent chromatin remodeling • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity • negative regulation of MHC class II biosynthetic process • negative regulation of cell cycle • positive regulation of proteolysis • negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • positive regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity • regulation of protein kinase B signaling • cardiac muscle cell development • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation • regulation of sarcomere organization • hair follicle placode formation • eyelid development in camera-type eye • fungiform papilla formation • histone H3 deacetylation • histone H4 deacetylation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of protein deacetylation • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	3066	15182
Ensembl	ENSG00000196591	ENSMUSG00000019777
UniProt	Q92769	P70288
RefSeq (мРНК)	NM_001527	NM_008229
RefSeq (белок)	NP_001518	NP_032255
Локус (UCSC)	Chr 6: 114.25 – 114.33 Mb	Chr 10: 36.97 – 37 Mb
Поиск в PubMed
Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Гистондеацетилаза 2  — фермент из семейства деацетилаз гистонов, кодируемый у человека геном HDAC2 .^[1]

Функция

Продукт гена HDAC2 относится к семейству деацетилаз гистонов. Гистондеацетилазы работают в составе крупных мультибелковых комплексов и отвечают за деацетилирование остатков лизина на N-концевой области кóровых гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Этот белок также формирует комплексы транскрипционных репрессоров, связываясь с различными белками, в том числе YY1, одним из фактором транскрипции млекопитающих. Гистондеацетилаза 2 играет важную роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и в развитии.^[2]

Взаимодействия

Гистондезацетилаза 2 взаимодействует с:

• ATR,^[3]
• BUB3,^[4]
• CDC20,^[4]
• CDH1,^[4]
• CHD3,^[5][6][7]
• CHD4,^[5][6][3]
• DNMT1,^[8]
• EED,^[9]
• EZH2^[9]
• FKBP3,^[10]
• GATA4,^[11]
• GTF2I,^[5][12]
• HDAC10,^[13]
• HDAC1,^{[5][6][14][15][9][13][16][17][18][19][20][21][22]}
• HMG20B,^[5][15]
• HSPA4,^[16]
• HCF1,^[23]
• MTA1,^[5][14][24]
• MTA2,^[5][14][20]
• MXD1,^[25][26]
• Mad1,^[4]
• MBD2,^[20][27][28]
• PHF21A,^[5][15][29]
• PPP1R8,^[30]
• RBBP4,^{[5][6][31][32]}
• RCOR1,^[15][33]
• RELA,^[34][35]
• Белок ретинобластомы,^[36]
• SAP30,^[20][37][38]
• SIN3A,^{[5][6][31][32][25][39][40]}
• SMARCA5,^[7]
• SNW1,^[41]
• SUV39H1,^[42]
• Sp1,^[32][43][44]
• Sp3,^[43][44]
• TOP2B,^[45]
• YY1.^[46][47][48]

Примечания

Литература