WikiSort.ru - Не сортированное

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4
	; PDB представлено на примере 1mm2.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
	1MM2, 1MM3, 2EE1, 2L5U, 2L75
Идентификаторы
Символ	CHD4 ; CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA
Внешние ID	OMIM: 603277 MGI: 1344380 HomoloGene: 68175 GeneCards: CHD4 Gene
номер EC	3.6.4.12
Генная онтология
Функция	• RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II repressing transcription factor binding; • DNA binding; • ATP-dependent DNA helicase activity; • protein binding; • ATP binding; • microtubule binding; • zinc ion binding; • nucleosomal DNA binding;
Компонент клетки	• nuclear chromatin; • nucleus; • nucleoplasm; • cytoplasm; • centrosome; • membrane; • NuRD complex; • protein complex;
Биологический процесс	• ATP catabolic process; • transcription, DNA-templated; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • DNA duplex unwinding; • ATP-dependent chromatin remodeling; • spindle assembly;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи
	Шаблон: просмотр • обсуждение • править

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4 — фермент, кодируемый у человека геном CHD4.^[1]^[2]^[3]

Продукт этого гена относится к семейству геликаз SNF2/RAD54. Оно представляет собой основной компонент нуклеосомного ремоделирования и комплекса деацетилаз и играет важную роль в эпигенетической репрессии транскрипции. У пациентов с дерматомиозитом вырабатываются антитела против этого белка.^[3]

Взаимодействия

CHD4, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,^[4]^[5]^[6] гистондезацетилазой 2,^[7]^[8]^[6] MTA2,^[4] SATB1^[9] и ATR.^[8]

Примечания

↑ Seelig HP, Moosbrugger I, Ehrfeld H, Fink T, Renz M, Genth E (Nov 1995). “The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation”. Arthritis Rheum. 38 (10): 1389—99. DOI:10.1002/art.1780381006. PMID 7575689.
↑ Seelig HP, Renz M, Targoff IN, Ge Q, Frank MB (Nov 1996). “Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen”. Arthritis Rheum. 39 (10): 1769—71. DOI:10.1002/art.1780391029. PMID 8843877.
1 2 Entrez Gene: CHD4 chromodomain helicase DNA binding protein 4 (неопр.).
1 2 Yao, Ya-Li; Yang Wen-Ming (Oct 2003). “The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity”. J. Biol. Chem. United States. 278 (43): 42560—8. DOI:10.1074/jbc.M302955200. ISSN 0021-9258. PMID 12920132.
↑ Grozinger, C M; Hassig C A; Schreiber S L (Apr 1999). “Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. UNITED STATES. 96 (9): 4868—73. DOI:10.1073/pnas.96.9.4868. ISSN 0027-8424. PMC 21783. PMID 10220385.
1 2 Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L (Oct 1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. ENGLAND. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. ISSN 0028-0836. PMID 9804427.
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin (Feb 2003). “A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes”. J. Biol. Chem. United States. 278 (9): 7234—9. DOI:10.1074/jbc.M208992200. ISSN 0021-9258. PMID 12493763.
1 2 Schmidt, D R; Schreiber S L (Nov 1999). “Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4”. Biochemistry. UNITED STATES. 38 (44): 14711—7. DOI:10.1021/bi991614n. ISSN 0006-2960. PMID 10545197.
↑ Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (Oct 2002). “SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances”. Nature. England. 419 (6907): 641—5. DOI:10.1038/nature01084. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)

Литература

Denslow SA, Wade PA (2007). “The human Mi-2/NuRD complex and gene regulation”. Oncogene. 26 (37): 5433—8. DOI:10.1038/sj.onc.1210611. PMID 17694084.
Ge Q, Nilasena DS, O'Brien CA; et al. (1995). “Molecular analysis of a major antigenic region of the 240-kD protein of Mi-2 autoantigen”. J. Clin. Invest. 96 (4): 1730—7. DOI:10.1172/JCI118218. PMC 185809. PMID 7560064.
Woodage T, Basrai MA, Baxevanis AD; et al. (1997). “Characterization of the CHD family of proteins”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (21): 11472—7. DOI:10.1073/pnas.94.21.11472. PMC 23509. PMID 9326634.
Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP; et al. (1998). “The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities”. Cell. 95 (2): 279—89. DOI:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. PMID 9790534.
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR; et al. (1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. PMID 9804427.
Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H; et al. (1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.
Schmidt DR, Schreiber SL (1999). “Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4”. Biochemistry. 38 (44): 14711—7. DOI:10.1021/bi991614n. PMID 10545197.
Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR; et al. (2001). “Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1”. J. Biol. Chem. 276 (9): 6817—24. DOI:10.1074/jbc.M007372200. PMID 11102443.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH; et al. (2002). “Directed proteomic analysis of the human nucleolus”. Curr. Biol. 12 (1): 1—11. DOI:10.1016/S0960-9822(01)00650-9. PMID 11790298.
Koipally J, Georgopoulos K (2002). “A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros”. J. Biol. Chem. 277 (31): 27697—705. DOI:10.1074/jbc.M201694200. PMID 12015313.
Saito M, Ishikawa F (2002). “The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2”. J. Biol. Chem. 277 (38): 35434—9. DOI:10.1074/jbc.M203455200. PMID 12124384.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH; et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hakimi MA, Dong Y, Lane WS; et al. (2003). “A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes”. J. Biol. Chem. 278 (9): 7234—9. DOI:10.1074/jbc.M208992200. PMID 12493763.
Kwan AH, Gell DA, Verger A; et al. (2004). “Engineering a protein scaffold from a PHD finger”. Structure. 11 (7): 803—13. DOI:10.1016/S0969-2126(03)00122-9. PMID 12842043.
Shimono Y, Murakami H, Kawai K; et al. (2004). “Mi-2 beta associates with BRG1 and RET finger protein at the distinct regions with transcriptional activating and repressing abilities”. J. Biol. Chem. 278 (51): 51638—45. DOI:10.1074/jbc.M309198200. PMID 14530259.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T; et al. (2004). “Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40—5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
Williams CJ, Naito T, Arco PG; et al. (2004). “The chromatin remodeler Mi-2beta is required for CD4 expression and T cell development”. Immunity. 20 (6): 719—33. DOI:10.1016/j.immuni.2004.05.005. PMID 15189737.
Lehner B, Sanderson CM (2004). “A protein interaction framework for human mRNA degradation”. Genome Res. 14 (7): 1315—23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[pmid7575689-1] Seelig HP, Moosbrugger I, Ehrfeld H, Fink T, Renz M, Genth E (Nov 1995). “The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation”. Arthritis Rheum. 38 (10): 1389—99. DOI:10.1002/art.1780381006. PMID 7575689.

[pmid8843877-2] Seelig HP, Renz M, Targoff IN, Ge Q, Frank MB (Nov 1996). “Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen”. Arthritis Rheum. 39 (10): 1769—71. DOI:10.1002/art.1780391029. PMID 8843877.

[entrez-3] 1 2 Entrez Gene: CHD4 chromodomain helicase DNA binding protein 4 (неопр.).

[pmid12920132-4] 1 2 Yao, Ya-Li; Yang Wen-Ming (Oct 2003). “The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity”. J. Biol. Chem. United States. 278 (43): 42560—8. DOI:10.1074/jbc.M302955200. ISSN 0021-9258. PMID 12920132.

[pmid10220385-5] Grozinger, C M; Hassig C A; Schreiber S L (Apr 1999). “Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. UNITED STATES. 96 (9): 4868—73. DOI:10.1073/pnas.96.9.4868. ISSN 0027-8424. PMC 21783. PMID 10220385.

[pmid9804427-6] 1 2 Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L (Oct 1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. ENGLAND. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. ISSN 0028-0836. PMID 9804427.

[pmid12493763-7] Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin (Feb 2003). “A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes”. J. Biol. Chem. United States. 278 (9): 7234—9. DOI:10.1074/jbc.M208992200. ISSN 0021-9258. PMID 12493763.

[pmid10545197-8] 1 2 Schmidt, D R; Schreiber S L (Nov 1999). “Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4”. Biochemistry. UNITED STATES. 38 (44): 14711—7. DOI:10.1021/bi991614n. ISSN 0006-2960. PMID 10545197.

[pmid12374985-9] Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (Oct 2002). “SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances”. Nature. England. 419 (6907): 641—5. DOI:10.1038/nature01084. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)