WikiSort.ru - Не сортированное

Белок, ассоциированный с Sin3A, 30kDa
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
	2KDP
Идентификаторы
Символ	SAP30
Внешние ID	OMIM: 603378 MGI: 1929129 HomoloGene: 2869 GeneCards: SAP30 Gene
Генная онтология
Функция	• DNA binding; • transcription corepressor activity; • protein binding; • metal ion binding;
Компонент клетки	• histone deacetylase complex;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • skeletal muscle cell differentiation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи
	Шаблон: просмотр • обсуждение • править

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Белок, ассоциированный с Sin3A, 30 кДа, известный также как SAP30, — белок, кодируемый у человека геном SAP30^[1].

Функция

Ацетилирование гистонов играет ключевую роль в регуляции экспрессии эукариотических генов. Ацетилирование и деацетилирование гистонов катализируют мультисубъединичные комплексы. Белок, кодируемый этим геном — составляющая комплекса гистондеацетилазы, который включает в себя SIN3A, SAP18, HDAC1, HDAC2, RbAp46, RbAp48 и другие полипептиды. Этот комплекс принимает активное участие в деацетилировании основных гистонов октамеров, но бездействует при деацетилировании нуклеосомных гистонов. Псевдоген этого гена находится на хромосоме 3^[1].

Млекопитающие имеют один паралог SAP30, названный SAP30-подобным (SAP30L), доступные последовательности которого на 70 % идентичны с SAP30^[2]. SAP30 и SAP30L вместе составляют хорошо сохранившееся семейство белков SAP30. SAP30L также взаимодействует с несколькими компонентами корепрессора комплекса Sin3A и вызывает репрессию транскрипции с помощью рекрутирования Sin3A и гистондеацетилаз^[3].

Белки семейства SAP30 имеют функциональную ядерную локализацию сигнала и они могут передавать сигнал Sin3A к ядру^[3]. Белки SAP30 имеют независимый контакт последовательностей с ДНК, их N-терминальнвй цинкозависимой модуль и их кислый центральный регион вносит свой вклад в взаимодействия гистонов и нуклеосом. ДНК-связывание белков SAP30 регулируется ядерной сигнализацией липидов, фосфоинозитидов (PI)^[4]. Белки SAP30 предоставляют первый пример, в котором ДНК и PI, кажется, стоят во взаимно антагонистических взаимоотношениях в части их взаимодействия с белками цинкового пальца и, таким образом, иллюстрируют молекулярный механизм, как эти липиды могут способствовать регуляции генов^[4]^[5].

Взаимодействия

SAP30, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1^[6]^[7]^[8]^[9]^[10]^[11], гистондеацетилазой 2^[7]^[8]^[11], SIN3A^[7]^[8]^[10]^[11]^[12]^[13], RBBP7^[7]^[8]^[11], корепрессором ядерных рецепторов 1^[13]^[14], RBBP4^[7]^[8]^[11], ING1^[11] и YY1^[6].

Примечания

1 2 Entrez Gene: SAP30 Sin3A-associated protein, 30kDa (неопр.).
↑ Lindfors K, Viiri KM, Niittynen M, Heinonen TY, Mäki M, Kainulainen H (December 2003). “TGF-beta induces the expression of SAP30L, a novel nuclear protein”. BMC Genomics. 4: 53. DOI:10.1186/1471-2164-4-53. PMC 319701. PMID 14680513.
1 2 Viiri KM, Korkeamäki H, Kukkonen MK, Nieminen LK, Lindfors K, Peterson P, Mäki M, Kainulainen H, Lohi O (2006). “SAP30L interacts with members of the Sin3A corepressor complex and targets Sin3A to the nucleolus”. Nucleic Acids Res. 34 (11): 3288—98. DOI:10.1093/nar/gkl401. PMC 1500868. PMID 16820529.
1 2 Viiri KM, Jänis J, Siggers T, Heinonen TY, Valjakka J, Bulyk ML, Mäki M, Lohi O (January 2009). “DNA-binding and -bending activities of SAP30L and SAP30 are mediated by a zinc-dependent module and monophosphoinositides”. Mol. Cell. Biol. 29 (2): 342—56. DOI:10.1128/MCB.01213-08. PMC 2612513. PMID 19015240.
↑ TamPub
1 2 Huang, Nu En; Lin Ching Hui; Lin Young Sun; Yu Winston C Y (June 2003). “Modulation of YY1 activity by SAP30”. Biochem. Biophys. Res. Commun. United States. 306 (1): 267—75. DOI:10.1016/S0006-291X(03)00966-5. ISSN 0006-291X. PMID 12788099.
1 2 3 4 5 Zhang, Y; Sun Z W; Iratni R; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Hampsey M; Reinberg D (June 1998). “SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex”. Mol. Cell. UNITED STATES. 1 (7): 1021—31. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. ISSN 1097-2765. PMID 9651585.
1 2 3 4 5 Zhang, Y; Ng H H; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Bird A; Reinberg D (August 1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. UNITED STATES. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. ISSN 0890-9369. PMC 316920. PMID 10444591.
↑ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar (August 2004). “HBP1 and Mad1 repressors bind the Sin3 corepressor PAH2 domain with opposite helical orientations”. Nat. Struct. Mol. Biol. United States. 11 (8): 738—46. DOI:10.1038/nsmb798. ISSN 1545-9993. PMID 15235594.
1 2 Yochum, G S; Ayer D E (July 2001). “Pf1, a novel PHD zinc finger protein that links the TLE corepressor to the mSin3A-histone deacetylase complex”. Mol. Cell. Biol. United States. 21 (13): 4110—8. DOI:10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001. ISSN 0270-7306. PMC 87072. PMID 11390640.
1 2 3 4 5 6 Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D (February 2002). “Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1)”. Mol. Cell. Biol. United States. 22 (3): 835—48. DOI:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. ISSN 0270-7306. PMC 133546. PMID 11784859.
↑ Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E (May 2003). “Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex”. Mol. Cell. Biol. United States. 23 (10): 3456—67. DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. ISSN 0270-7306. PMC 164750. PMID 12724404.
1 2 Laherty, C D; Billin A N, Lavinsky R M, Yochum G S, Bush A C, Sun J M, Mullen T M, Davie J R, Rose D W, Glass C K, Rosenfeld M G, Ayer D E, Eisenman R N (July 1998). “SAP30, a component of the mSin3 corepressor complex involved in N-CoR-mediated repression by specific transcription factors”. Mol. Cell. UNITED STATES. 2 (1): 33—42. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80111-2. ISSN 1097-2765. PMID 9702189. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
↑ Underhill, C; Qutob M S; Yee S P; Torchia J (Dec 2000). “A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1”. J. Biol. Chem. UNITED STATES. 275 (51): 40463—70. DOI:10.1074/jbc.M007864200. ISSN 0021-9258. PMID 11013263.

Литература

Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN (1995). “Mad-Max transcriptional repression is mediated by ternary complex formation with mammalian homologs of yeast repressor Sin3”. Cell. 80 (5): 767—76. DOI:10.1016/0092-8674(95)90355-0. PMID 7889570.
Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H; et al. (1997). “Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex”. Cell. 89 (3): 357—64. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80216-0. PMID 9150135.
Zhang Y, Sun ZW, Iratni R; et al. (1998). “SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex”. Mol. Cell. 1 (7): 1021—31. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. PMID 9651585.
Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM; et al. (1998). “SAP30, a component of the mSin3 corepressor complex involved in N-CoR-mediated repression by specific transcription factors”. Mol. Cell. 2 (1): 33—42. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80111-2. PMID 9702189.
Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP; et al. (1998). “The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities”. Cell. 95 (2): 279—89. DOI:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. PMID 9790534.
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR; et al. (1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. PMID 9804427.
Hsieh JJ, Zhou S, Chen L; et al. (1999). “CIR, a corepressor linking the DNA binding factor CBF1 to the histone deacetylase complex”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (1): 23—8. DOI:10.1073/pnas.96.1.23. PMC 15086. PMID 9874765.
Boutell JM, Thomas P, Neal JW; et al. (2000). “Aberrant interactions of transcriptional repressor proteins with the Huntington's disease gene product, huntingtin”. Hum. Mol. Genet. 8 (9): 1647—55. DOI:10.1093/hmg/8.9.1647. PMID 10441327.
Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H; et al. (1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.
Krithivas A, Young DB, Liao G; et al. (2000). “Human herpesvirus 8 LANA interacts with proteins of the mSin3 corepressor complex and negatively regulates Epstein-Barr virus gene expression in dually infected PEL cells”. J. Virol. 74 (20): 9637—45. DOI:10.1128/JVI.74.20.9637-9645.2000. PMC 112396. PMID 11000236.
Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (2001). “A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1”. J. Biol. Chem. 275 (51): 40463—70. DOI:10.1074/jbc.M007864200. PMID 11013263.
Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR; et al. (2001). “Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1”. J. Biol. Chem. 276 (9): 6817—24. DOI:10.1074/jbc.M007372200. PMID 11102443.
Skowyra D, Zeremski M, Neznanov N; et al. (2001). “Differential association of products of alternative transcripts of the candidate tumor suppressor ING1 with the mSin3/HDAC1 transcriptional corepressor complex”. J. Biol. Chem. 276 (12): 8734—9. DOI:10.1074/jbc.M007664200. PMID 11118440.
Yochum GS, Ayer DE (2001). “Pf1, a novel PHD zinc finger protein that links the TLE corepressor to the mSin3A-histone deacetylase complex”. Mol. Cell. Biol. 21 (13): 4110—8. DOI:10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001. PMC 87072. PMID 11390640.
Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H; et al. (2002). “Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1)”. Mol. Cell. Biol. 22 (3): 835—48. DOI:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. PMC 133546. PMID 11784859.
Saito M, Ishikawa F (2002). “The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2”. J. Biol. Chem. 277 (38): 35434—9. DOI:10.1074/jbc.M203455200. PMID 12124384.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH; et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Wysocka J, Myers MP, Laherty CD; et al. (2003). “Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1”. Genes Dev. 17 (7): 896—911. DOI:10.1101/gad.252103. PMC 196026. PMID 12670868.
Huang NE, Lin CH, Lin YS, Yu WC (2003). “Modulation of YY1 activity by SAP30”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306 (1): 267—75. DOI:10.1016/S0006-291X(03)00966-5. PMID 12788099.
Sironi E, Cerri A, Tomasini D; et al. (2004). “Loss of heterozygosity on chromosome 4q32-35 in sporadic basal cell carcinomas: evidence for the involvement of p33ING2/ING1L and SAP30 genes”. J. Cutan. Pathol. 31 (4): 318—22. DOI:10.1111/j.0303-6987.2004.0187.x. PMID 15005689.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[entrez-1] 1 2 Entrez Gene: SAP30 Sin3A-associated protein, 30kDa (неопр.).

[pmid14680513-2] Lindfors K, Viiri KM, Niittynen M, Heinonen TY, Mäki M, Kainulainen H (December 2003). “TGF-beta induces the expression of SAP30L, a novel nuclear protein”. BMC Genomics. 4: 53. DOI:10.1186/1471-2164-4-53. PMC 319701. PMID 14680513.

[pmid16820529-3] 1 2 Viiri KM, Korkeamäki H, Kukkonen MK, Nieminen LK, Lindfors K, Peterson P, Mäki M, Kainulainen H, Lohi O (2006). “SAP30L interacts with members of the Sin3A corepressor complex and targets Sin3A to the nucleolus”. Nucleic Acids Res. 34 (11): 3288—98. DOI:10.1093/nar/gkl401. PMC 1500868. PMID 16820529.

[pmid19015240-4] 1 2 Viiri KM, Jänis J, Siggers T, Heinonen TY, Valjakka J, Bulyk ML, Mäki M, Lohi O (January 2009). “DNA-binding and -bending activities of SAP30L and SAP30 are mediated by a zinc-dependent module and monophosphoinositides”. Mol. Cell. Biol. 29 (2): 342—56. DOI:10.1128/MCB.01213-08. PMC 2612513. PMID 19015240.

[5] TamPub

[pmid12788099-6] 1 2 Huang, Nu En; Lin Ching Hui; Lin Young Sun; Yu Winston C Y (June 2003). “Modulation of YY1 activity by SAP30”. Biochem. Biophys. Res. Commun. United States. 306 (1): 267—75. DOI:10.1016/S0006-291X(03)00966-5. ISSN 0006-291X. PMID 12788099.

[pmid9651585-7] 1 2 3 4 5 Zhang, Y; Sun Z W; Iratni R; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Hampsey M; Reinberg D (June 1998). “SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex”. Mol. Cell. UNITED STATES. 1 (7): 1021—31. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. ISSN 1097-2765. PMID 9651585.

[pmid10444591-8] 1 2 3 4 5 Zhang, Y; Ng H H; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Bird A; Reinberg D (August 1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. UNITED STATES. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. ISSN 0890-9369. PMC 316920. PMID 10444591.

[pmid15235594-9] Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar (August 2004). “HBP1 and Mad1 repressors bind the Sin3 corepressor PAH2 domain with opposite helical orientations”. Nat. Struct. Mol. Biol. United States. 11 (8): 738—46. DOI:10.1038/nsmb798. ISSN 1545-9993. PMID 15235594.

[pmid11390640-10] 1 2 Yochum, G S; Ayer D E (July 2001). “Pf1, a novel PHD zinc finger protein that links the TLE corepressor to the mSin3A-histone deacetylase complex”. Mol. Cell. Biol. United States. 21 (13): 4110—8. DOI:10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001. ISSN 0270-7306. PMC 87072. PMID 11390640.

[pmid11784859-11] 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D (February 2002). “Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1)”. Mol. Cell. Biol. United States. 22 (3): 835—48. DOI:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. ISSN 0270-7306. PMC 133546. PMID 11784859.

[pmid12724404-12] Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E (May 2003). “Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex”. Mol. Cell. Biol. United States. 23 (10): 3456—67. DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. ISSN 0270-7306. PMC 164750. PMID 12724404.

[pmid9702189-13] 1 2 Laherty, C D; Billin A N, Lavinsky R M, Yochum G S, Bush A C, Sun J M, Mullen T M, Davie J R, Rose D W, Glass C K, Rosenfeld M G, Ayer D E, Eisenman R N (July 1998). “SAP30, a component of the mSin3 corepressor complex involved in N-CoR-mediated repression by specific transcription factors”. Mol. Cell. UNITED STATES. 2 (1): 33—42. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80111-2. ISSN 1097-2765. PMID 9702189. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)

[pmid11013263-14] Underhill, C; Qutob M S; Yee S P; Torchia J (Dec 2000). “A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1”. J. Biol. Chem. UNITED STATES. 275 (51): 40463—70. DOI:10.1074/jbc.M007864200. ISSN 0021-9258. PMID 11013263.