WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте
Pacmanvirus
Научная классификация
Международное научное название

Pacmanvirus

Группа по Балтимору

I: дцДНК-вирусы


Поиск изображений
на Викискладе

Pacmanvirus (лат.), также известный как Pacmanvirus A23 — гигантский вирус, который морфологически и генетически близок к двум другим гигантским вирусам, Faustovirus и Kaumoebavirus, а также вирусам семейства Asfarviridae[en]. Свое название эти вирусы получили за форму капсида, наблюдаемую при негативном окрашивании в электронный микроскоп: он похож на главного героя одноименной видеоигры Pac-Man[2].

Вирус был обнаружен в 2017 году при совместной культивации амёб Acanthamoeba castellanii с различными образцами окружающей среды, взятыми из Алжира[3].

По состоянию на ноябрь 2018 года род Pacmanvirus не зарегистрирован в базе данных Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV)[4].

Описание

Капсид Pacmanvirus имеет икосаэдрическую, но слегка неправильную форму (которой и обязан своим названием) и достигает около 175 нм в размерах, причём внутренняя мембрана вируса повторяет геометрию капсида. Геном Pacmanvirus представлен двуцепочечной молекулой ДНК, состоящей из 395405 пар оснований (п. о.). GC-состав генома достигает около 33,6 %, что ниже, чем у родственных ему вирусов. Вероятнее всего, геномная ДНК имеет не кольцевую, а линейную форму. В геноме Pacmanvirus полностью отсутствуют большие повторы или инвертированные участки. В геноме был обнаружен один ген тРНК — ген изолейциновой тРНК, хотя родственные вирусы не содержат генов тРНК. Согласно данным биоинформатического анализа, геном Pacmanvirus содержит 465 предсказанных генов. 135 из них родственны генам других вирусов, 45 — генам эукариот, 41 — генам прокариот (38 генам бактерий и 3 генам архей). По данным анализа репертуара генов ближайшим родственником Pacmanvirus является гигантский вирус Faustovirus: они имеют 84 общих гена. С Kaumoebavirus Pacmanvirus роднят 9 генов, 11 генов — с гигантскими вирусами рода Marseillevirus[en], 9 генов — с мимивирусами[en] и лишь 2 с вирусами семейства Asfarviridae. 3 гена похожи на гены Acanthamoeba castellanii, а 4 — на гены слизевика Dictyostelium[en]. 244 генов не имеют известных гомологов, и только лишь 155 генов имеют функциональную аннотацию[en][3].

Жизненный цикл

По сравнению с мимивирусом Pacmanvirus размножается в клетках амёбы Acanthamoeba castellanii чрезвычайно быстро. Первые повреждённые клетки начинают появляться через 6 часов после заражения, а ещё через два часа происходит полный лизис клеток амёбы. Уже спустя 15 минут после контакта вируса и амёбы вирусные частицы выявляются в фагоцитозных вакуолях, а потом и в цитоплазме клетки, причём открытия капсида не наблюдается. Скорее всего, в цитоплазме вирусы взаимодействуют с митохондриями, но слияния мембран[en] не происходит. Выход ДНК из капсидов пронаблюдать не удалось, хотя в цитоплазме выявлялись пустые капсиды. Через 3 часа после заражения в клетках амёб появляются хорошо оформленные вирусные фабрики, однако новосформированные вирионы становятся различимы только через 4 часа после заражения. Через 6 часов клетка амёбы становится заполнена вирусными частицами, которые иногда даже формируют скопления правильной геометрической формы во всей клетке или некоторых её частях на периферии вирусной фабрики. Наконец, через 8 часов после проникновения вируса в клетку наступает лизис последней[3].

Филогения и родственные связи

Согласно филогенетическому дереву, построенному на основании последовательности генов семейства[en] ДНК-полимеразы B, Pacmanvirus, Kaumoebavirus, Faustovirus и Asfarviridae формируют монофилетическую кладу. По-видимому, эти вирусы имели общего предка. По архитектуре капсида Faustovirus наиболее близок к Pacmanvirus[3].

Примечания

  1. ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. ↑ Colson Philippe, La Scola Bernard, Raoult Didier. Giant Viruses of Amoebae: A Journey Through Innovative Research and Paradigm Changes (англ.) // Annual Review of Virology. — 2017. — 29 September (vol. 4, no. 1). — P. 61—85. — ISSN 2327-056X. — DOI:10.1146/annurev-virology-101416-041816. [исправить]
  3. 1 2 3 4 Andreani J., Khalil J. Y. B., Sevvana M., Benamar S., Di Pinto F., Bitam I., Colson P., Klose T., Rossmann M. G., Raoult D., La Scola B. Pacmanvirus, a New Giant Icosahedral Virus at the Crossroads between Asfarviridae and Faustoviruses. (англ.) // Journal Of Virology. — 2017. — 15 July (vol. 91, no. 14). — DOI:10.1128/JVI.00212-17. — PMID 28446673. [исправить]
  4. ↑ Search Pacmanvirus in ICTV database. Проверено 11 ноября 2018.

Ссылки

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .



Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии