WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте
Предполагаемая вторичная структура элемента SECIS

SECIS-элеме́нт (от англ. selenocysteine insertion sequence — последовательность вставки селеноцистеина) — участок РНК длиной около 60 нуклеотидов, формирующий шпилькообразную структуру[1]. Этот структурный мотив[en] (набор нуклеотидов) заставляет стоп-кодон UGA кодировать селеноцистеин. Поэтому элемент SECIS является неотъемлемым элементом мРНК, кодирующих селенопротеины (белки, содержащие один или более остатков селеносодержащей аминокислоты селеноцистеина).

У бактерий элемент SECIS располагается почти сразу после кодона UGA, на который он воздействует. У архей и эукариот он находится в 3'-нетранслируемой области (англ. 3' untranslated region, 3' UTR) мРНК, и один элемент SECIS может заставить несколько UGA-кодонов кодировать селеноцистеин. У одного рода архей, Methanococcus, элемент SECIS расположен в 5'-нетранслируемой области (англ. 5' untranslated region, 5' UTR).

Элемент SECIS можно отличить по характерной последовательности нуклеотидов, то есть в нём определённые нуклеотиды занимают строго определённые места, а также характерной вторичной структуре. Вторичная структура обусловлена образованием водородных связей между комплементарными азотистыми основаниями, в результате чего формируется структура, похожая на шпильку. Эукариотический SECIS содержит неканонические пары A-G, которые редки в природе, однако чрезвычайно важны для нормального функционирования SECIS. Хотя и у эукариот, и у архей, и у бактерий SECIS имеет характерную форму шпильки, они не совмещаются друг с другом, то есть порядок расположения нуклеотидов, характерный для эукариотических SECIS, не является таковым для SECIS архей.

Было создано несколько компьютерных программ для поиска элемента SECIS в геноме, их работа основана на поиске специфических последовательностей и элементов вторичной структуры. Эти программы были использованы для поиска новых селенопротеинов[2].

Элемент SECIS обнаружен у самых разнообразных организмов из всех трёх доменов жизни, а также их вирусов[2][3][4][5][6][7][8].

Примечания

  1. ↑ Walczak, R; Westhof E, Carbon P, Krol A (1996). “A novel RNA structural motif in the selenocysteine insertion element of eukaryotic selenoprotein mRNAs”. RNA. 2 (4): 367—379. PMC 1369379. PMID 8634917. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
  2. 1 2 Lambert, A; Lescure A, Gautheret D (2002). “A survey of metazoan selenocysteine insertion sequences”. Biochimie. 84 (9): 953—959. DOI:10.1016/S0300-9084(02)01441-4. PMID 12458087. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
  3. ↑ Mix H, Lobanov AV, Gladyshev VN (2007). “SECIS elements in the coding regions of selenoprotein transcripts are functional in higher eukaryotes”. Nucleic Acids Res. 35 (2): 414—23. DOI:10.1093/nar/gkl1060. PMC 1802603. PMID 17169995.
  4. ↑ Cassago A, Rodrigues EM, Prieto EL; et al. (2006). “Identification of Leishmania selenoproteins and SECIS element”. Mol. Biochem. Parasitol. 149 (2): 128—34. DOI:10.1016/j.molbiopara.2006.05.002. PMID 16766053.
  5. ↑ Mourier T, Pain A, Barrell B, Griffiths-Jones S (2005). “A selenocysteine tRNA and SECIS element in Plasmodium falciparum”. RNA. 11 (2): 119—22. DOI:10.1261/rna.7185605. PMC 1370700. PMID 15659354.
  6. ↑ G. V. Kryukov, S. Castellano, S. V. Novoselov, A. V. Lobanov, O. Zehtab, R. Guigó, and V. N. Gladyshev (2003). “Characterization of mammalian selenoproteomes”. Science. 300 (5624): 1439—1443. DOI:10.1126/science.1083516. PMID 12775843.
  7. ↑ Gregory V. Kryukov and Vadim N. Gladyshev (2004). “The prokaryotic selenoproteome”. EMBO Rep. 5 (5): 538—543. DOI:10.1038/sj.embor.7400126. PMC 1299047. PMID 15105824.
  8. ↑ Alain Krol (2002). “Evolutionarily different RNA motifs and RNA-protein complexes to achieve selenoprotein synthesis”. Biochimie. 84 (8): 765—774. DOI:10.1016/S0300-9084(02)01405-0. PMID 12457564.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .



Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2024
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии