WikiSort.ru - Не сортированное

SATB гомеобокс 1
	; PDB представлено на примере 1yse.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
	1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO
Идентификаторы
Символ	SATB1
Внешние ID	OMIM: 602075 MGI: 105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: SATB1 Gene
Генная онтология
Функция	• chromatin binding; • double-stranded DNA binding; • sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • protein binding; • sequence-specific DNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • nuclear heterochromatin; • nuclear matrix; • PML body;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • chromatin organization; • chromatin remodeling; • transcription, DNA-templated; • apoptotic process; • cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis; • epidermis development; • viral process; • histone methylation; • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; • activated T cell proliferation; • reflex;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи
	Шаблон: просмотр • обсуждение • править

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

ATB1 (специальный богатый АТ связывающий последовательности белок 1) — белок, кодируемый у человека геном SATB1^[1].

Функция

SATB1, глобальный организатор хроматина и фактор транскрипции, возник как ключевой фактор более высокого порядка интеграции архитектуры хроматина с генной регуляцией^[2]. Недавние исследования разгадали роль SATB1 в организации цикличности хроматина и его динамичный характер реакции на физиологические стимулы^[3]. На уровне генома, SATB1 по-видимому, играет важную роль в организации транскрипционно уравновешенного хроматина. SATB1 организует локус MHC class-I в различных петлях хроматина, связывая MAR ядерных матриц при фиксированных расстояниях. Сайленсинг SATB1 имитирует эффекты IFN-γ^[en] обработки на петле хроматина архитектуры локуса MHC class I^[en] и изменения экспрессии генов в локусе. SATB1, как также было выявлено, может вызвать рост опухоли рака молочной железы и метастазирования путём изменения экспрессии большого числа генов.

Взаимодействия

SATB1, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1^[4], SMARCA5^[4], MTA2^[4], CHD4^[4], CUTL1^[5], POLR2J^[6] и BAZ1A^[4].

Примечания

↑ Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1 (неопр.).
↑ Pavan Kumar P, Purbey PK, Sinha CK, Notani D, Limaye A, Jayani RS, Galande S (April 2006). “Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo”. Mol. Cell. 22 (2): 231—43. DOI:10.1016/j.molcel.2006.03.010. PMID 16630892.
↑ Galande S, Purbey PK, Notani D, Kumar PP (October 2007). “The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1”. Curr. Opin. Genet. Dev. 17 (5): 408—14. DOI:10.1016/j.gde.2007.08.003. PMID 17913490.
1 2 3 4 5 Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (October 2002). “SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances”. Nature. England. 419 (6907): 641—5. DOI:10.1038/nature01084. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
↑ Liu, J; Barnett A; Neufeld E J; Dudley J P (July 1999). “Homeoproteins CDP and SATB1 Interact: Potential for Tissue-Specific Regulation”. Mol. Cell. Biol. UNITED STATES. 19 (7): 4918—26. ISSN 0270-7306. PMC 84297. PMID 10373541.
↑ Durrin, Linda K; Krontiris Theodore G (June 2002). “The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11”. Genomics. United States. 79 (6): 809—17. DOI:10.1006/geno.2002.6772. ISSN 0888-7543. PMID 12036295.

Литература

Dickinson LA, Joh T, Kohwi Y, Kohwi-Shigematsu T (1992). “A tissue-specific MAR/SAR DNA-binding protein with unusual binding site recognition”. Cell. 70 (4): 631—45. DOI:10.1016/0092-8674(92)90432-C. PMID 1505028.
Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA; et al. (1995). “Isolation of novel and known genes from a human fetal cochlear cDNA library using subtractive hybridization and differential screening”. Genomics. 23 (1): 42—50. DOI:10.1006/geno.1994.1457. PMID 7829101.
Nakagomi K, Kohwi Y, Dickinson LA, Kohwi-Shigematsu T (1994). “A novel DNA-binding motif in the nuclear matrix attachment DNA-binding protein SATB1”. Mol. Cell. Biol. 14 (3): 1852—60. PMC 358543. PMID 8114718.
Xu L, Deng HX, Xia JH; et al. (1997). “Assignment of SATB1 to human chromosome band 3p23 by in situ hybridization”. Cytogenet. Cell Genet. 77 (3—4): 205—6. DOI:10.1159/000134577. PMID 9284917.
Reddy PH, Stockburger E, Gillevet P, Tagle DA (1998). “Mapping and characterization of novel (CAG)n repeat cDNAs from adult human brain derived by the oligo capture method”. Genomics. 46 (2): 174—82. DOI:10.1006/geno.1997.5044. PMID 9417904.
Escalier D, Allenet B, Badrichani A, Garchon HJ (1999). “High level expression of the Xlr nuclear protein in immature thymocytes and colocalization with the matrix-associated region-binding SATB1 protein”. J. Immunol. 162 (1): 292—8. PMID 9886398.
Liu J, Barnett A, Neufeld EJ, Dudley JP (1999). “Homeoproteins CDP and SATB1 Interact: Potential for Tissue-Specific Regulation”. Mol. Cell. Biol. 19 (7): 4918—26. PMC 84297. PMID 10373541.
Galande S, Dickinson LA, Mian IS; et al. (2001). “SATB1 Cleavage by Caspase 6 Disrupts PDZ Domain-Mediated Dimerization, Causing Detachment from Chromatin Early in T-Cell Apoptosis”. Mol. Cell. Biol. 21 (16): 5591—604. DOI:10.1128/MCB.21.16.5591-5604.2001. PMC 87280. PMID 11463840.
Kieffer LJ, Greally JM, Landres I; et al. (2002). “Identification of a candidate regulatory region in the human CD8 gene complex by colocalization of DNase I hypersensitive sites and matrix attachment regions which bind SATB1 and GATA-3”. J. Immunol. 168 (8): 3915—22. DOI:10.4049/jimmunol.168.8.3915. PMID 11937547.
Durrin LK, Krontiris TG (2002). “The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11”. Genomics. 79 (6): 809—17. DOI:10.1006/geno.2002.6772. PMID 12036295.
Yasui D, Miyano M, Cai S; et al. (2002). “SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances”. Nature. 419 (6907): 641—5. DOI:10.1038/nature01084. PMID 12374985.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH; et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Cai S, Han HJ, Kohwi-Shigematsu T (2003). “Tissue-specific nuclear architecture and gene expression regulated by SATB1”. Nat. Genet. 34 (1): 42—51. DOI:10.1038/ng1146. PMID 12692553.
Fujii Y, Kumatori A, Nakamura M (2004). “SATB1 makes a complex with p300 and represses gp91(phox) promoter activity”. Microbiol. Immunol. 47 (10): 803—11. DOI:10.1111/j.1348-0421.2003.tb03438.x. PMID 14605447.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA; et al. (2004). “The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)”. Genome Res. 14 (10B): 2121—7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Gocke CB, Yu H, Kang J (2005). “Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates”. J. Biol. Chem. 280 (6): 5004—12. DOI:10.1074/jbc.M411718200. PMID 15561718.
Wen J, Huang S, Rogers H; et al. (2005). “SATB1 family protein expressed during early erythroid differentiation modifies globin gene expression”. Blood. 105 (8): 3330—9. DOI:10.1182/blood-2004-08-2988. PMID 15618465.
Seo J, Lozano MM, Dudley JP (2005). “Nuclear matrix binding regulates SATB1-mediated transcriptional repression”. J. Biol. Chem. 280 (26): 24600—9. DOI:10.1074/jbc.M414076200. PMID 15851481.
Nakayama Y, Mian IS, Kohwi-Shigematsu T, Ogawa T (2006). “A nuclear targeting determinant for SATB1, a genome organizer in the T cell lineage”. Cell Cycle. 4 (8): 1099—106. PMID 15970696.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T; et al. (2005). “Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network”. Nature. 437 (7062): 1173—8. DOI:10.1038/nature04209. PMID 16189514.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[entrez-1] Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1 (неопр.).

[pmid16630892-2] Pavan Kumar P, Purbey PK, Sinha CK, Notani D, Limaye A, Jayani RS, Galande S (April 2006). “Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo”. Mol. Cell. 22 (2): 231—43. DOI:10.1016/j.molcel.2006.03.010. PMID 16630892.

[pmid17913490-3] Galande S, Purbey PK, Notani D, Kumar PP (October 2007). “The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1”. Curr. Opin. Genet. Dev. 17 (5): 408—14. DOI:10.1016/j.gde.2007.08.003. PMID 17913490.

[pmid12374985-4] 1 2 3 4 5 Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (October 2002). “SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances”. Nature. England. 419 (6907): 641—5. DOI:10.1038/nature01084. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)

[pmid10373541-5] Liu, J; Barnett A; Neufeld E J; Dudley J P (July 1999). “Homeoproteins CDP and SATB1 Interact: Potential for Tissue-Specific Regulation”. Mol. Cell. Biol. UNITED STATES. 19 (7): 4918—26. ISSN 0270-7306. PMC 84297. PMID 10373541.

[pmid12036295-6] Durrin, Linda K; Krontiris Theodore G (June 2002). “The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11”. Genomics. United States. 79 (6): 809—17. DOI:10.1006/geno.2002.6772. ISSN 0888-7543. PMID 12036295.