WikiSort.ru - Не сортированное

Обрабатывающий сплайсинг пре-мРНК фактор 8
	; Прорисовка основана на PDB 3E9L.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
	3E9L, 3ENB, 3LRU, 4JK7, 4JK8, 4JK9, 4JKA, 4JKB, 4JKC, 4JKD, 4JKE, 4JKF, 4JKG, 4JKH, 4KIT
Идентификаторы
Символ	PRPF8 ; HPRP8; PRP8; PRPC8; RP13; SNRNP220
Внешние ID	OMIM: 607300 MGI: 2179381 HomoloGene: 4706 GeneCards: PRPF8 Gene
Генная онтология
Функция	• protein binding; • U6 snRNA binding; • U5 snRNA binding; • poly(A) RNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • U5 snRNP; • membrane; • nuclear speck; • catalytic step 2 spliceosome;
Биологический процесс	• RNA splicing, via transesterification reactions; • mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA processing; • RNA splicing; • gene expression;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи
	Шаблон: просмотр • обсуждение • править

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Обрабатывающий сплайсинг пре-мРНК фактор 8 (англ. «Pre-mRNA-processing-splicing factor 8) — белок, который у человека кодируется геном PRPF8.^[1]^[2]

Сплайсинг пре-мРНК проходит две последовательные стадии трансэтерификации. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом как U2- так и U12- зависимых сплайсосом, и создаёт что необходимо для катализа стадии II процесса сплайсинга пре-мРНК. Он производит несколько повторов WD, которые функционируют в межбелковых взаимодействиях. Этот белок имеет некоторое сходство с дрожжевым белком Prp8. Этот ген является кандидатом для аутосомно-доминантного пигментного ретинита.^[3]

Взаимодействия

PRPF8, как было выявлено, взаимодействует с WDR57^[4]^[5] и EFTUD2.^[5]

Примечания

↑ McKie AB, McHale JC, Keen TJ, Tarttelin EE, Goliath R, van Lith-Verhoeven JJ, Greenberg J, Ramesar RS, Hoyng CB, Cremers FP, Mackey DA, Bhattacharya SS, Bird AC, Markham AF, Inglehearn CF (Jul 2001). “Mutations in the pre-mRNA splicing factor gene PRPC8 in autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP13)”. Hum Mol Genet. 10 (15): 1555—62. DOI:10.1093/hmg/10.15.1555. PMID 11468273.
↑ Luo HR, Moreau GA, Levin N, Moore MJ (Jul 1999). “The human Prp8 protein is a component of both U2- and U12-dependent spliceosomes”. RNA. 5 (7): 893—908. DOI:10.1017/S1355838299990520. PMC 1369814. PMID 10411133.
↑ Entrez Gene: PRPF8 PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae) (неопр.).
↑ Ewing, Rob M; Chu Peter, Elisma Fred, Li Hongyan, Taylor Paul, Climie Shane, McBroom-Cerajewski Linda, Robinson Mark D, O'Connor Liam, Li Michael, Taylor Rod, Dharsee Moyez, Ho Yuen, Heilbut Adrian, Moore Lynda, Zhang Shudong, Ornatsky Olga, Bukhman Yury V, Ethier Martin, Sheng Yinglun, Vasilescu Julian, Abu-Farha Mohamed, Lambert Jean-Philippe, Duewel Henry S, Stewart Ian I, Kuehl Bonnie, Hogue Kelly, Colwill Karen, Gladwish Katharine, Muskat Brenda, Kinach Robert, Adams Sally-Lin, Moran Michael F, Morin Gregg B, Topaloglou Thodoros, Figeys Daniel (2007). “Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry”. Mol. Syst. Biol. England. 3 (1): 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)
1 2 Achsel, T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp S; Lührmann R (Nov 1998). “The Human U5-220kD Protein (hPrp8) Forms a Stable RNA-Free Complex with Several U5-Specific Proteins, Including an RNA Unwindase, a Homologue of Ribosomal Elongation Factor EF-2, and a Novel WD-40 Protein”. Mol. Cell. Biol. UNITED STATES. 18 (11): 6756—66. ISSN 0270-7306. PMC 109259. PMID 9774689.

Ссылки

GeneReviews/NIH/NCBI/UW entry on Retinitis Pigmentosa Overview

Литература

Grainger RJ, Beggs JD (2005). “Prp8 protein: At the heart of the spliceosome”. RNA. 11 (5): 533—57. DOI:10.1261/rna.2220705. PMC 1370742. PMID 15840809.
Garcia-Blanco MA, Anderson GJ, Beggs J, Sharp PA (1990). “A mammalian protein of 220 kDa binds pre-mRNAs in the spliceosome: a potential homologue of the yeast PRP8 protein”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (8): 3082—6. DOI:10.1073/pnas.87.8.3082. PMC 53838. PMID 2139226.
Pinto AL, Steitz JA (1989). “The mammalian analogue of the yeast PRP8 splicing protein is present in the U4/5/6 small nuclear ribonucleoprotein particle and the spliceosome”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (22): 8742—6. DOI:10.1073/pnas.86.22.8742. PMC 298364. PMID 2479028.
Bach M, Winkelmann G, Lührmann R (1989). “20S small nuclear ribonucleoprotein U5 shows a surprisingly complex protein composition”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (16): 6038—42. DOI:10.1073/pnas.86.16.6038. PMC 297770. PMID 2527369.
Anderson GJ, Bach M, Lührmann R, Beggs JD (1990). “Conservation between yeast and man of a protein associated with U5 small nuclear ribonucleoprotein”. Nature. 342 (6251): 819—21. DOI:10.1038/342819a0. PMID 2532307.
Umen JG, Guthrie C (1996). “Prp16p, Slu7p, and Prp8p interact with the 3' splice site in two distinct stages during the second catalytic step of pre-mRNA splicing”. RNA. 1 (6): 584—97. PMC 1369303. PMID 7489518.
Goliath R; Shugart Y; Janssens P; et al. (1995). “Fine localization of the locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 17p”. Am. J. Hum. Genet. 57 (4): 962—4. PMC 1801525. PMID 7573060. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
Greenberg J, Goliath R, Beighton P, Ramesar R (1994). “A new locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa on the short arm of chromosome 17”. Hum. Mol. Genet. 3 (6): 915—8. DOI:10.1093/hmg/3.6.915. PMID 7951236.
Maruyama K, Sugano S (1994). “Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides”. Gene. 138 (1—2): 171—4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Kojis TL; Heinzmann C; Flodman P; et al. (1996). “Map refinement of locus RP13 to human chromosome 17p13.3 in a second family with autosomal dominant retinitis pigmentosa”. Am. J. Hum. Genet. 58 (2): 347—55. PMC 1914553. PMID 8571961. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
Reyes JL, Kois P, Konforti BB, Konarska MM (1996). “The canonical GU dinucleotide at the 5' splice site is recognized by p220 of the U5 snRNP within the spliceosome”. RNA. 2 (3): 213—25. PMC 1369364. PMID 8608445.
Hinz M, Moore MJ, Bindereif A (1996). “Domain analysis of human U5 RNA. Cap trimethylation, protein binding, and spliceosome assembly”. J. Biol. Chem. 271 (31): 19001—7. DOI:10.1074/jbc.271.31.19001. PMID 8702566.
Chiara MD, Palandjian L, Feld Kramer R, Reed R (1997). “Evidence that U5 snRNP recognizes the 3' splice site for catalytic step II in mammals”. EMBO J. 16 (15): 4746—59. DOI:10.1093/emboj/16.15.4746. PMC 1170101. PMID 9303319.
Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; et al. (1997). “Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library”. Gene. 200 (1—2): 149—56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
Achsel T; Ahrens K; Brahms H; et al. (1998). “The Human U5-220kD Protein (hPrp8) Forms a Stable RNA-Free Complex with Several U5-Specific Proteins, Including an RNA Unwindase, a Homologue of Ribosomal Elongation Factor EF-2, and a Novel WD-40 Protein”. Mol. Cell. Biol. 18 (11): 6756—66. PMC 109259. PMID 9774689. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
Reyes JL; Gustafson EH; Luo HR; et al. (1999). “The C-terminal region of hPrp8 interacts with the conserved GU dinucleotide at the 5' splice site”. RNA. 5 (2): 167—79. DOI:10.1017/S1355838299981785. PMC 1369749. PMID 10024169. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
Makarov EM, Makarova OV, Achsel T, Lührmann R (2000). “The human homologue of the yeast splicing factor prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein-protein interactions”. J. Mol. Biol. 298 (4): 567—75. DOI:10.1006/jmbi.2000.3685. PMID 10788320.
Le Hir H, Moore MJ, Maquat LE (2000). “Pre-mRNA splicing alters mRNP composition: evidence for stable association of proteins at exon–exon junctions”. Genes Dev. 14 (9): 1098—108. PMC 316578. PMID 10809668.
McHale JC, McKie AB, Tarttelin EE, Inglehearn CF (2000). “Expression map of human chromosome region 17p13.3, spanning the RP13 dominant retinitis pigmentosa locus, the Miller-Dieker lissencephaly syndrome (MDLS) region, and a putative tumour suppressor locus”. Cytogenet. Cell Genet. 88 (3—4): 225—9. DOI:10.1159/000015556. PMID 10828595.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2024
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[pmid11468273-1] McKie AB, McHale JC, Keen TJ, Tarttelin EE, Goliath R, van Lith-Verhoeven JJ, Greenberg J, Ramesar RS, Hoyng CB, Cremers FP, Mackey DA, Bhattacharya SS, Bird AC, Markham AF, Inglehearn CF (Jul 2001). “Mutations in the pre-mRNA splicing factor gene PRPC8 in autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP13)”. Hum Mol Genet. 10 (15): 1555—62. DOI:10.1093/hmg/10.15.1555. PMID 11468273.

[pmid10411133-2] Luo HR, Moreau GA, Levin N, Moore MJ (Jul 1999). “The human Prp8 protein is a component of both U2- and U12-dependent spliceosomes”. RNA. 5 (7): 893—908. DOI:10.1017/S1355838299990520. PMC 1369814. PMID 10411133.

[entrez-3] Entrez Gene: PRPF8 PRP8 pre-mRNA processing factor 8 homolog (S. cerevisiae) (неопр.).

[pmid17353931-4] Ewing, Rob M; Chu Peter, Elisma Fred, Li Hongyan, Taylor Paul, Climie Shane, McBroom-Cerajewski Linda, Robinson Mark D, O'Connor Liam, Li Michael, Taylor Rod, Dharsee Moyez, Ho Yuen, Heilbut Adrian, Moore Lynda, Zhang Shudong, Ornatsky Olga, Bukhman Yury V, Ethier Martin, Sheng Yinglun, Vasilescu Julian, Abu-Farha Mohamed, Lambert Jean-Philippe, Duewel Henry S, Stewart Ian I, Kuehl Bonnie, Hogue Kelly, Colwill Karen, Gladwish Katharine, Muskat Brenda, Kinach Robert, Adams Sally-Lin, Moran Michael F, Morin Gregg B, Topaloglou Thodoros, Figeys Daniel (2007). “Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry”. Mol. Syst. Biol. England. 3 (1): 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)

[pmid9774689-5] 1 2 Achsel, T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp S; Lührmann R (Nov 1998). “The Human U5-220kD Protein (hPrp8) Forms a Stable RNA-Free Complex with Several U5-Specific Proteins, Including an RNA Unwindase, a Homologue of Ribosomal Elongation Factor EF-2, and a Novel WD-40 Protein”. Mol. Cell. Biol. UNITED STATES. 18 (11): 6756—66. ISSN 0270-7306. PMC 109259. PMID 9774689.