Консе́нсусная после́довательность Ко́зак (последовательность Козак, англ. Kozak consensus sequence) — последовательность нуклеотидов в составе молекулы мРНК эукариот, окружающая старт-кодон и важная для инициации трансляции. Консенсусная последовательность[en] была впервые описана Мэрилин Козак[en] (англ. Marilyn Kozak) в 1986 году[1].
У эукариот старт-сайтом трансляции обычно, но не всегда, является первый кодон AUG (в зависимости от нуклеотидного контекста вокруг AUG). Консенсусная последовательность Козак, играющая важную роль в инициации трансляции у эукариот, включает 4—6 нуклеотидов, предшествующих старт-кодону, и один-два нуклеотида непосредственно после старт-кодона. У млекопитающих оптимальный контекст имеет вид gccRccaugG[1][2][3][4]; у двудольных растений оптимальным контекстом является a(A/C)aaaugG, у однодольных растений aRccaugGc[5], где кодон AUG выделен курсивом, а наиболее важные нуклеотиды в позициях —3 и +4 (+1 соответствует А в кодоне AUG) показаны заглавными буквами; R — пуриновый нуклеотид (адениновый или гуаниновый). Пуриновые нуклеотиды в позициях -3 и +4 считаются самыми важными как у растений, так и у млекопитающих[5][6], но некоторые данные указывают на то, что позиции —1 и —2 могут быть также важными у растений[7]. У дрожжей нуклеотидный контекст менее важен для распознавания стартового кодона, и его единственной характеристикой является пуриновый нуклеотид в позиции —3[1]. Наличие указанных нуклеотидов, т. е. оптимальный нуклеотидный контекст кодона AUG, коррелирует с высоким уровнем синтеза белка с соответствующей мРНК in vivo и является характеристикой так называемой «сильной» (эффективно инициирующей трансляцию) последовательности Козак[8]. Другие варианты последовательностей Козак являются «слабыми». Ген Lmx1b является примером гена со слабой последовательностью Козак[9]. В некоторых случаях нуклеотид G в положении −6 может также играть важную роль в инициации трансляции[4].
Последовательность Козак не является сайтом связывания рибосомы (англ. ribosomal binding site, RBS), в отличие от прокариотической последовательности Шайна — Дальгарно. Показано, что у млекопитающих в дискриминации между кодонами AUG в оптимальном и неоптимальном контекстах участвует эукариотический фактор инициации трансляции 1[en] (eIF1)[10]. На основании экспериментальных данных предполагается, что за узнавание пуринового нуклеотида в позиции —3 43S инициаторным комплексом ответственно взаимодействие данного нуклеотида с альфа-субъединицей eIF2, а за узнавание пурина в позиции +4, возможно, ответственно его взаимодействие с нуклеотидами А1818А—1819 в спирали 44 18S рРНК[11].
Исследования показали, что мутация G → C в положении −6 гена β-глобина человека нарушает биосинтез белка. Данная мутация была первой выявленной мутацией в последовательности Козак. Данная мутация была обнаружена у членов семьи, проживающей на юго-востоке Италии[4].
В таблице ниже приведены данные о виде консенсусной последовательности Козак у разных групп организмов.
Организм | Таксон | Консенсусная последовательность |
---|---|---|
Позвоночные | gccRccATGG[3] | |
Плодовая мушка (Drosophila spp.) | Членистоногие | cAAaATG[12] |
Дрожжи (Saccharomyces cerevisiae) | Аскомицеты | aAaAaAATGTCt[13] |
Слизевик (Dictyostelium discoideum) | Amoebozoa | aaaAAAATGRna[14] |
Инфузории | Инфузории | nTaAAAATGRct[14] |
Малярийный плазмодий (Plasmodium spp.) | Апикомплексы | taaAAAATGAan[14] |
Токсоплазма (Toxoplasma gondii) | Апикомплексы | gncAaaATGg[15] |
Трипаносомы | Кинетопластиды | nnnAnnATGnC[14] |
Растения | AACAATGGC[16] |
Эта статья входит в число добротных статей русскоязычного раздела Википедии. |
Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".
Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.
Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .