WikiSort.ru - Не сортированное

Синдекан 4
PDB прорисовано на основе 1ejp.
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 1EJP, 1EJQ, 1OBY, 1YBO
Идентификаторы
Символ	SDC4 ; SYND4
Внешние ID	OMIM: 600017 MGI: 1349164 HomoloGene: 31121 GeneCards: SDC4 Gene
Генная онтология Функция • fibronectin binding • protein kinase C binding • protein binding • cytoskeletal protein binding • thrombospondin receptor activity Компонент клетки • Golgi lumen • plasma membrane • integral component of plasma membrane • focal adhesion • cell surface • costamere • lysosomal lumen • membrane raft • extracellular vesicular exosome Биологический процесс • retinoid metabolic process • ureteric bud development • carbohydrate metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • phototransduction, visible light • biological_process • extracellular matrix organization • glycosaminoglycan metabolic process • chondroitin sulfate metabolic process • small molecule metabolic process • positive regulation of protein kinase activity • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of focal adhesion assembly Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	6385	20971
Ensembl	ENSG00000124145	ENSMUSG00000017009
UniProt	P31431	O35988
RefSeq (мРНК)	NM_002999	NM_011521
RefSeq (белок)	NP_002990	NP_035651
Локус (UCSC)	Chr 20: 43.95 – 43.98 Mb	Chr 2: 164.42 – 164.44 Mb
Поиск в PubMed
Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Синдекан 4 (англ. syndecan 4) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Продукт гена человека SDC4. Подобно синдекану 2 несёт на поверхности гепарансульфатные цепи.

Функции

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 4, также как синдекан 2, несёт гепарансульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом.

Взаимодействует с белками GIPC, NUDT16L1, CDCP1 и SDCBP. ^[1]

Структура

Зрелый белок состоит из 180 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 21,6 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (127 аминокислот), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 3 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей.

• 
  Структура растворимого фрагмента синдекана 4 (16-мер).
• 
  Изменение структуры растворимого фрагмента синдекана 4 в присутствии фосфатидилинозитола-4,5-дифосфата.

Тканевая специфичность

Экспрессирован на эпителиальных клетках и фибробластах.

Остеоартрит

Уровень синдекана 4 повышен при остеоартрите. В модельных экспериментах на мышах было показано, что ингибирование этого белка снижает разрушение хряща, вызванного остеоартритом.^[2]

См. также

• Синдекан 1
• Синдекан 2
• Синдекан 3

Примечания

Литература

• Oh ES, Couchman JR (April 2004). “Syndecans-2 and -4; close cousins, but not identical twins”. Mol. Cells. 17 (2): 181—7. PMID 15179029. Используется устаревший параметр |month= (справка)
• Wilcox-Adelman SA, Denhez F, Iwabuchi T, Saoncella S, Calautti E, Goetinck PF (2002). “Syndecan-4: dispensable or indispensable?”. Glycoconj. J. 19 (4–5): 305—13. DOI:10.1023/A:1025304602057. PMID 12975609.
• Bass MD, Humphries MJ (November 2002). “Cytoplasmic interactions of syndecan-4 orchestrate adhesion receptor and growth factor receptor signalling”. Biochem. J. 368 (Pt 1): 1—15. DOI:10.1042/BJ20021228. PMC 1222989. PMID 12241528. Используется устаревший параметр |month= (справка)
• Woods A, Couchman JR (October 2001). “Syndecan-4 and focal adhesion function”. Curr. Opin. Cell Biol. 13 (5): 578—83. PMID 11544026. Используется устаревший параметр |month= (справка)

Ссылки

• Клеточный матрикс. Синдекан.