WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте
Тример комплекса Фенна-Мэтьюса-Ольсона. Молекулы бактериохлорофилла a показаны зелёным, атомы магния — красным, а белок — серым. Структура из[1].

Комплекс Фенна-Мэтьюса-Ольсона (ФМО) представляет собой первый водорастворимый пигмент-белковый комплекс, трёхмерная структура которого было получена методом рентгеновской спектроскопии[2]. Это светособирающий комплекс зелёных серных бактерий, который опосредует передачу энергии возбуждения от хлоросом к встроенным в мембрану бактериальным реакционным центрам (РЦ). По своему строению — это тример. Каждый из трех мономеров содержит семь молекул бактериохлорофилла а. Они связаны через белковый скэффолд, который образует координационную связь с центральным атомом магния либо через аминокислотный остаток (главным образом гистидин), либо через водные мостики (только один бактериохлорофилл на каждом мономере).

Поскольку структура комплекса известна, возможным оказалось рассчитать на основе этой информации оптические спектры для сравнения их с экспериментальными данными[3][4]. В простейшем случае в расчёт принимается только экситонное сопряжение бактериохлорофиллов[5]. Более реалистичные модели учитывают и пигмент-белковое сопряжение[6]. Важным свойством является локальный переход энергии (позиционная энергия) бактериохлорофиллов, индивидуальный для каждой молекулы пигмента в силу её белкового окружения. Именно позиционная энергия бактериохлорофиллов определяет направление энергетического потока.

Удалось получить некоторую информацию о структуре суперкомплекса ФМО-РЦ, которая была получена с помощью электронной микроскопии[7][8] и спектров линейного дихроизма, измеренных на тримерах ФМО и комплексе ФМО-РЦ. Из этих измерений стало понятно, что возможны две ориентации ФМО относительно реакционного центра (РЦ). Ориентация в которой бактериохлорофиллы 3 и 4 расположены близко к РЦ, а бактериохлорофиллы 1 и 6 (следуя оригинальной нумерации Фенна и Мэтьюса) смотрят в сторону хлоросом способствует эффективной передачи энергии[9].

Тестовый объект

ФМО-комплекс представляет простейших из известных в природе светособирающих комплексов и, следовательно, является подходящим тест-объектом для разработки методов, которые потом могут быть перенесены на более сложные системы, такие как фотосистема I. ФМО проявляет на удивление долгую квантовую когерентность, которая играет важную роль в процессах передачи энергии[1].

Сбор света

Сбор света в процессе фотосинтеза использует как классические так и квантово-механические процессы и обладает КПД почти 100 %. В классических процессах, что бы получить энергию света фотон должен достичь реакционных центров до того, как произойдёт рассеивание энергии, то есть менее чем за одну наносекунду. Однако при фотосинтезе такого не происходит. Поскольку энергия может существовать во множестве состояний суперпозиции, она может путешествовать всеми маршрутами внутри материала одновременно. Когда фотон находит правильное назначение, суперпозиция схлопывается, делая энергию доступной. Однако это не чисто квантовый процесс, поскольку некоторые квантовые процессы замедляют движения квантованных объектов внутри материала. Например, локализация Андерсона предотвращает распространение квантовых состояний в неупорядоченных средах. Поскольку квантовое состояние ведет себя как волна, оно уязвимо для вмешательства и внешних воздействий. Ещё одной проблемой является квантовый эффект Зенона, суть которого заключаться в том, что нестабильное квантовое состояние никогда не меняется, если он непрерывно измерять/наблюдать, поскольку постоянно изменяет его, предохраняя от схлопывания[10][11].

Взаимодействие между квантовыми состояниями и окружающей средой служит своего рода измерением или наблюдением. Классическое взаимодействие с окружающей средой изменяет волнообразный характер квантового состояния настолько, что это мешает локализации Андерсона, в результате чего квантовый эффект Зенона увеличивает время жизни квантового состояния, что позволяет ему достичь реакционного центра[10].

Вычислительная техника

Проблема поиска реакционного центра в белковой матрице формально эквивалентна многим проблемам вычислительной техники. Отображение вычислительных задач на поиск энергией возбуждения реакционного центра может сделать сбор света новым типом вычислительного устройства, повышение расчетной скорости при комнатной температуре, получая 100—1000 кратной эффективность[10].

Примечания

  1. 1 2 Tronrud, D.E.; Schmid, M.F.; Matthews, B.W. (April 1986). “Structure and X-ray amino acid sequence of a bacteriochlorophyll a protein from Prosthecochloris aestuarii refined at 1.9 A resolution”. Journal of Molecular Biology. 188 (3): 443—54. DOI:10.1016/0022-2836(86)90167-1. PMID 3735428.
  2. Fenna, R. E.; Matthews, B. W. (1975). “Chlorophyll arrangement in a bacteriochlorophyll protein from Chlorobium limicola. Nature. 258 (5536): 573—7. Bibcode:1975Natur.258..573F. DOI:10.1038/258573a0.
  3. Vulto, Simone I. E.; Neerken, Sieglinde; Louwe, Robert J. W.; De Baat, Michiel A.; Amesz, Jan; Aartsma, Thijs J. (1998). “Excited-State Structure and Dynamics in FMO Antenna Complexes from Photosynthetic Green Sulfur Bacteria”. The Journal of Physical Chemistry B. 102 (51): 10630—5. DOI:10.1021/jp983003v.
  4. Wendling, Markus; Przyjalgowski, Milosz A.; Gülen, Demet; Vulto, Simone I. E.; Aartsma, Thijs J.; Van Grondelle, Rienk van; Van Amerongen, Herbert van (2002). “The quantitative relationship between structure and polarized spectroscopy in the FMO complex of Prosthecochloris aestuarii: refining experiments and simulations”. Photosynthesis Research. 71 (1—2): 99—123. DOI:10.1023/A:1014947732165. PMID 16228505.
  5. Pearlstein, Robert M. (1992). “Theory of the optical spectra of the bacteriochlorophyll a antenna protein trimer from Prosthecochloris aestuarii. Photosynthesis Research. 31 (3): 213—226. DOI:10.1007/BF00035538. PMID 24408061.
  6. Renger, Thomas; Marcus, R. A. (2002). “On the relation of protein dynamics and exciton relaxation in pigment–protein complexes: An estimation of the spectral density and a theory for the calculation of optical spectra”. The Journal of Chemical Physics. 116 (22): 9997—10019. Bibcode:2002JChPh.116.9997R. DOI:10.1063/1.1470200.
  7. Rémigy, Hervé-W; Stahlberg, Henning; Fotiadis, Dimitrios; Müller, Shirley A; Wolpensinger, Bettina; Engel, Andreas; Hauska, Günter; Tsiotis, Georgios (July 1999). “The reaction center complex from the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum: a structural analysis by scanning transmission electron microscopy”. Journal of Molecular Biology. 290 (4): 851—8. DOI:10.1006/jmbi.1999.2925. PMID 10398586.
  8. Rémigy, Hervé -W.; Hauska, Günter; Müller, Shirley A.; Tsiotis, Georgios (2002). “The reaction centre from green sulphur bacteria: progress towards structural elucidation”. Photosynthesis Research. 71 (1—2): 91—8. DOI:10.1023/A:1014963816574. PMID 16228504.
  9. Tronrud, D.E.; Schmid, M.F.; Matthews, B.W. (October 2006). “How proteins trigger excitation energy transfer in the FMO complex of green sulfur bacteria”. Biophysical Journal. 91 (8): 2778—97. Bibcode:2006BpJ....91.2778A. DOI:10.1529/biophysj.105.079483. PMC 1578489. PMID 16861264.
  10. 1 2 3 MIT. Quantum Light Harvesting Hints at Entirely New Form of Computing. Technologyreview.com (25 ноября 2013). Проверено 6 декабря 2013.
  11. Vattay, Gabor & Kauffman, Stuart A. (2013), "Evolutionary Design in Biological Quantum Computing", arΧiv:1311.4688 [cond-mat.dis-nn]

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .




Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии