WikiSort.ru - Не сортированное

Корепрессор ядерных рецепторов 2
PDB представлено на основе 1xc5.
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 1KKQ, 1R2B, 1XC5, 2GPV, 2L5G, 2LTP, 2ODD, 2RT5, 3R29, 3R2A, 4A69
Идентификаторы
Символ	NCOR2 ; CTG26; N-CoR2; SMAP270; SMRT; SMRTE; SMRTE-tau; TNRC14; TRAC; TRAC-1; TRAC1
Внешние ID	OMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 ChEMBL: 5949 GeneCards: NCOR2 Gene
Генная онтология Функция • DNA binding • chromatin binding • transcription corepressor activity • Notch binding • protein binding • histone deacetylase binding • protein N-terminus binding Компонент клетки • nucleus • nucleoplasm • nucleolus • membrane • nuclear matrix • nuclear body • transcriptional repressor complex Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Notch signaling pathway • gene expression • cellular lipid metabolic process • small molecule metabolic process • regulation of cellular ketone metabolic process by negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	9612	20602
Ensembl	ENSG00000196498	ENSMUSG00000029478
UniProt	Q9Y618	Q9WU42
RefSeq (мРНК)	NM_001077261	NM_001253904
RefSeq (белок)	NP_001070729	NP_001240833
Локус (UCSC)	Chr 12: 124.81 – 125.05 Mb	Chr 5: 125.02 – 125.18 Mb
Поиск в PubMed
Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Корепрессор ядерных рецепторов 2 (NCOR2) — транскрипционный корегуляторный белок, содержащий несколько доменов, взаимодействующих с ядерными рецепторами. Кроме того, NCOR2 способствует доставке гистондезацетилаз в промоторные области ДНК. В связи с этим считается, что NCOR2 помогает ядерным рецепторам в подавлении экспрессии целевых генов^[1][2]. По другому NCOR2 называется посредником сайленсинга для рецепторов витамина А и рецепторов гормонов щитовидной железы ( SMRT )^[1] или T₃ рецептор-ассоциированного кофактора 1 ( TRAC-1 )^[2].

Функция

NCOR2/SMRT - белк корегуляции транскрипции, который содержит несколько модулирующих функциональных областей, в том числе, несколько реперессирующих доменов, а также два или три C-концевых домена, взаимодействующих с ядерными рецепторами^[1]. NCOR2/SMRT служит корепрессором для множества транскрипционных факторов. В этой связи, NCOR2/SMRT функционирует как платформа, содействующая связыванию гистондезацетилаз с промоторами ДНК и факторами транскрипции Sin3A с последующим образованием мультисубъединичного репрессорного комплекса^[3].

Открытие

SMRT изначально клонирован и охарактеризован в лаборатории д-ра Рональда М. Эванс (англ. Ronald M. Evans) в Институте биологических исследований Солка^[1]. В более раннем исследовании этой молекулы с аналогичными выводами этот белок обозначался как TRAC-1^[2].

Взаимодействия

NCOR2 взаимодействует с:

• NR3C4,^[4][5][6]
• BCL6,^[7][8][9]
• C-Fos,^[10]
• C-jun,^[10]
• HDAC1,^[11][12]
• HDAC3,^{[12][13][14][15][16][17][18]}
• HDAC4,^[17][19]
• HDAC5,^[19]
• HDAC10,^[11]
• MeCP2,^[20]
• NR4A1,^[21]
• POU2F1,^[22]
• PPARD,^[23]
• PGR,^[24]
• PML,^[25][26]
• RBPJ,^[27][28]
• RELA,^[10][29]
• RUNX1T1,^[30][31]
• RARA,^[32][33]
• SIN3A,^[13][19]
• SNW1,^[34][35]
• SPEN,^[36]
• SRF,^[10]
• TBL1X,^{[13][14][15][16]}
• THRB,^[37][38][39]
• VDR, [^[38][40] и
• ZBTB16^[7][30][33].

Примечания

Литература