История
Исторически считалось, что в Европе обитает один вид, в Северной Америке – 2-3 вида, на территории России - 14. Попытки проведения ревизии рода на основании морфологических признаков не увенчались успехом. В ходе молекулярно-генетического анализа видов, обитающих на Дальнем Востоке и Забайкалье, на основе анализа фрагментов генов COI и 18S рДНК, а также морфологических данных, 13 видов были сведены в 3: один сугубо континентальный, и два распространены на Курильских островах, Сахалине, Камчатке и в Японии[2]. Морфологически эти виды различаются кривизной максимально выпуклого сечения створок, а также отношением ширины раковины к её максимальной высоте.
До недавнего времени также считалось, что северную часть Европы населяет только один вид рода - европейская жемчужница (Margaritifera margaritifera). В ходе подготовки полного определителя пресноводной малакофауны России русскими зоологами была проведена ревизия некоторых крупных двустворчатых моллюсков, включая раковин европейской жемчужницы из коллекции Зоологического института РАН[3]. В результате применения компараторного метода были выделены 3 морфологические формы, различающиеся по кривизне фронтального сечения створок. Выделенные формы были отнесены к трем видам: наиболее плоская раковина - M. margaritifera, наиболее выпуклая к - M. borealis (Westerlund, 1871) и промежуточная к - M. elongata (Lamarck, 1819). Согласно же исследованию И.С. Серегеевой и соавторов, M. elongata и M. borealis не являются самостоятельными видами, а наблюдаемые различия по признакам между раковинами моллюсков являются проявлением размерной изменчивости M. margaritifera[4].
Болотов с соавторами в 2013 году попытались доказать принадлежность европейских представителей рода к одному виду. В результате исследования ими был сделан вывод, что виды, заселяющие реки Северной Европы, принадлежат к единственному виду Margaritifera margaritifera[5].