WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)

PDB rendering based on 1jeq.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволXRCC5 ; KARP-1; KARP1; KU80; KUB2; Ku86; NFIV
Внешние IDOMIM: 194364 MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: XRCC5 Gene
номер EC3.6.1. EC 3.6.1.
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez752022596
EnsemblENSG00000079246ENSMUSG00000026187
UniProtP13010P27641
RefSeq (мРНК)NM_021141NM_009533
RefSeq (белок)NP_066964NP_033559
Локус (UCSC)Chr 2:
216.11 – 216.21 Mb		Chr 1:
72.31 – 72.39 Mb
Поиск в PubMed
Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Ku80 — белок, закодированный у человека геном XRCC5.[1] Вместе с белком Ku70 белок Ku80 образует гетеродимер, связывающийся с концами двунитевых разрывов в ДНК, и требуется для репарации ДНК путём негомологичного соединения концов (NHEJ). Также белок Ku требуется для V(D)J рекомбинации, которая использует путь NHEJ для создания разнообразия антиген-связывающих центров антител в иммунной системе млекопитающих.

Также Ku требуется для поддержания длины теломер и сайленсинга прителомерных генов.[2]

Ku был впервые обнаружен у пациентов с системной красной волчанкой, у которых были выявлены высокие титры антител против этого белка.[1]

Ku80 имеет несколько других названий:

  • Ku аутоантиген, белок p80 волчанки
  • субъединица 2 АТР-зависимой ДНК-хеликазы 2
  • XRCC5 (англ. X-ray repair cross-complementing 5)

Клиническое значение

Редкий микросателлитный полиморфизм данного гена связан с опухолями у пациентов с различной чувствительностью к радиоактивности.[3]

Взаимодействия

Показаны белок-белковые взаимодействия Ku80 с NCOA6,[4][5] GCN5L2,[6] Ku70,[6][7][8][9][10] АТР-зависимой хеликазой синдрома Вернера,[11][12] Тирозин-киназой 2,[13] белком c-Abl в гомологичном киназе каталитическом участке ДНК-зависимой протеинкиназы,[14][15][7] TERF2IP,[16] обратной транскриптазой теломер,[17] POU2F1[18][15] и белком PCNA.[15][19][20]

Примечания

  1. 1 2 Entrez Gene: XRCC6 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 (Ku autoantigen, 70kDa).
  2. ↑ Boulton SJ, Jackson SP (March 1998). “Components of the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing”. EMBO J. 17 (6): 1819—28. DOI:10.1093/emboj/17.6.1819. PMC 1170529. PMID 9501103. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  3. ↑ Entrez Gene: XRCC5 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining; Ku autoantigen, 80kDa).
  4. ↑ Ko, L; Cardona G R, Chin W W (May. 2000). “Thyroid hormone receptor-binding protein, an LXXLL motif-containing protein, functions as a general coactivator”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. UNITED STATES. 97 (11): 6212—7. ISSN 0027-8424. PMID 10823961. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  5. ↑ Ko, Lan; Chin William W (Mar. 2003). “Nuclear receptor coactivator thyroid hormone receptor-binding protein (TRBP) interacts with and stimulates its associated DNA-dependent protein kinase”. J. Biol. Chem. United States. 278 (13): 11471—9. DOI:10.1074/jbc.M209723200. ISSN 0021-9258. PMID 12519782. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  6. 1 2 Barlev, N A; Poltoratsky V, Owen-Hughes T, Ying C, Liu L, Workman J L, Berger S L (Mar. 1998). “Repression of GCN5 histone acetyltransferase activity via bromodomain-mediated binding and phosphorylation by the Ku-DNA-dependent protein kinase complex”. Mol. Cell. Biol. UNITED STATES. 18 (3): 1349—58. ISSN 0270-7306. PMID 9488450. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  7. 1 2 Gell, D; Jackson S P (Sep. 1999). “Mapping of protein-protein interactions within the DNA-dependent protein kinase complex”. Nucleic Acids Res. ENGLAND. 27 (17): 3494—502. PMID 10446239. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  8. ↑ Yang, C R; Yeh S, Leskov K, Odegaard E, Hsu H L, Chang C, Kinsella T J, Chen D J, Boothman D A (May. 1999). “Isolation of Ku70-binding proteins (KUBs)”. Nucleic Acids Res. ENGLAND. 27 (10): 2165—74. ISSN 0305-1048. PMID 10219089. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  9. ↑ Singleton, B K; Torres-Arzayus M I, Rottinghaus S T, Taccioli G E, Jeggo P A (May. 1999). “The C terminus of Ku80 activates the DNA-dependent protein kinase catalytic subunit”. Mol. Cell. Biol. UNITED STATES. 19 (5): 3267—77. ISSN 0270-7306. PMID 10207052. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  10. ↑ Song, K; Jung D, Jung Y, Lee S G, Lee I (Sep. 2000). “Interaction of human Ku70 with TRF2”. FEBS Lett. NETHERLANDS. 481 (1): 81—5. ISSN 0014-5793. PMID 10984620. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  11. ↑ Karmakar, Parimal; Snowden Carey M, Ramsden Dale A, Bohr Vilhelm A (Aug. 2002). “Ku heterodimer binds to both ends of the Werner protein and functional interaction occurs at the Werner N-terminus”. Nucleic Acids Res. England. 30 (16): 3583—91. PMID 12177300. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  12. ↑ Li, B; Comai L (Sep. 2000). “Functional interaction between Ku and the werner syndrome protein in DNA end processing”. J. Biol. Chem. UNITED STATES. 275 (37): 28349—52. DOI:10.1074/jbc.C000289200. ISSN 0021-9258. PMID 10880505. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  13. ↑ Adam, L; Bandyopadhyay D, Kumar R (Jan. 2000). “Interferon-alpha signaling promotes nucleus-to-cytoplasmic redistribution of p95Vav, and formation of a multisubunit complex involving Vav, Ku80, and Tyk2”. Biochem. Biophys. Res. Commun. UNITED STATES. 267 (3): 692—6. DOI:10.1006/bbrc.1999.1978. ISSN 0006-291X. PMID 10673353. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  14. ↑ Jin, S; Kharbanda S, Mayer B, Kufe D, Weaver D T (Oct. 1997). “Binding of Ku and c-Abl at the kinase homology region of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit”. J. Biol. Chem. UNITED STATES. 272 (40): 24763—6. ISSN 0021-9258. PMID 9312071. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  15. 1 2 3 Matheos, Diamanto; Ruiz Marcia T, Price Gerald B, Zannis-Hadjopoulos Maria (Oct. 2002). “Ku antigen, an origin-specific binding protein that associates with replication proteins, is required for mammalian DNA replication”. Biochim. Biophys. Acta. Netherlands. 1578 (1–3): 59—72. ISSN 0006-3002. PMID 12393188. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  16. ↑ O'Connor, Matthew S; Safari Amin, Liu Dan, Qin Jun, Songyang Zhou (Jul. 2004). “The human Rap1 protein complex and modulation of telomere length”. J. Biol. Chem. United States. 279 (27): 28585—91. DOI:10.1074/jbc.M312913200. ISSN 0021-9258. PMID 15100233. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  17. ↑ Chai, Weihang; Ford Lance P, Lenertz Lisa, Wright Woodring E, Shay Jerry W (Dec. 2002). “Human Ku70/80 associates physically with telomerase through interaction with hTERT”. J. Biol. Chem. United States. 277 (49): 47242—7. DOI:10.1074/jbc.M208542200. ISSN 0021-9258. PMID 12377759. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  18. ↑ Schild-Poulter, C; Pope L, Giffin W, Kochan J C, Ngsee J K, Traykova-Andonova M, Haché R J (May. 2001). “The binding of Ku antigen to homeodomain proteins promotes their phosphorylation by DNA-dependent protein kinase”. J. Biol. Chem. United States. 276 (20): 16848—56. DOI:10.1074/jbc.M100768200. ISSN 0021-9258. PMID 11279128. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  19. ↑ Ohta, Satoshi; Shiomi Yasushi, Sugimoto Katsunori, Obuse Chikashi, Tsurimoto Toshiki (Oct. 2002). “A proteomics approach to identify proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding proteins in human cell lysates. Identification of the human CHL12/RFCs2-5 complex as a novel PCNA-binding protein”. J. Biol. Chem. United States. 277 (43): 40362—7. DOI:10.1074/jbc.M206194200. ISSN 0021-9258. PMID 12171929. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)
  20. ↑ Balajee, A S; Geard C R (Mar. 2001). “Chromatin-bound PCNA complex formation triggered by DNA damage occurs independent of the ATM gene product in human cells”. Nucleic Acids Res. England. 29 (6): 1341—51. PMID 11239001. Используется устаревший параметр |month= (справка); Неизвестный параметр |quotes= (справка); Проверьте дату в |month= (справка на английском)

Литература

  • Koike M (2003). “Dimerization, translocation and localization of Ku70 and Ku80 proteins”. J. Radiat. Res. 43 (3): 223—36. DOI:10.1269/jrr.43.223. PMID 12518983.
  • Chen DJ, Park MS, Campbell E; et al. (1992). “Assignment of a human DNA double-strand break repair gene (XRCC5) to chromosome 2”. Genomics. 13 (4): 1088—94. DOI:10.1016/0888-7543(92)90023-L. PMID 1505945.
  • Wedrychowski A, Henzel W, Huston L; et al. (1992). “Identification of proteins binding to interferon-inducible transcriptional enhancers in hematopoietic cells”. J. Biol. Chem. 267 (7): 4533—40. PMID 1537839.
  • Jeggo PA, Hafezparast M, Thompson AF; et al. (1992). “Localization of a DNA repair gene (XRCC5) involved in double-strand-break rejoining to human chromosome 2”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89 (14): 6423—7. DOI:10.1073/pnas.89.14.6423. PMID 1631138.
  • Knuth MW, Gunderson SI, Thompson NE; et al. (1990). “Purification and characterization of proximal sequence element-binding protein 1, a transcription activating protein related to Ku and TREF that binds the proximal sequence element of the human U1 promoter”. J. Biol. Chem. 265 (29): 17911—20. PMID 2211668.
  • Stuiver MH, Coenjaerts FE, van der Vliet PC (1990). “The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV, a protein forming multimeric protein-DNA complexes”. J. Exp. Med. 172 (4): 1049—54. DOI:10.1084/jem.172.4.1049. PMID 2212941.
  • Mimori T, Ohosone Y, Hama N; et al. (1990). “Isolation and characterization of cDNA encoding the 80-kDa subunit protein of the human autoantigen Ku (p70/p80) recognized by autoantibodies from patients with scleroderma-polymyositis overlap syndrome”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (5): 1777—81. DOI:10.1073/pnas.87.5.1777. PMID 2308937.
  • Yaneva M, Wen J, Ayala A, Cook R (1989). “cDNA-derived amino acid sequence of the 86-kDa subunit of the Ku antigen”. J. Biol. Chem. 264 (23): 13407—11. PMID 2760028.
  • Genersch E, Eckerskorn C, Lottspeich F; et al. (1995). “Purification of the sequence-specific transcription factor CTCBF, involved in the control of human collagen IV genes: subunits with homology to Ku antigen”. Embo J. 14 (4): 791—800. PMID 7882982.
  • Tuteja N, Tuteja R, Ochem A; et al. (1994). “Human DNA helicase II: a novel DNA unwinding enzyme identified as the Ku autoantigen”. Embo J. 13 (20): 4991—5001. PMID 7957065.
  • Le Romancer M, Reyl-Desmars F, Cherifi Y; et al. (1994). “The 86-kDa subunit of autoantigen Ku is a somatostatin receptor regulating protein phosphatase-2A activity”. J. Biol. Chem. 269 (26): 17464—8. PMID 8021251.
  • Cao QP, Pitt S, Leszyk J, Baril EF (1994). “DNA-dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen”. Biochemistry. 33 (28): 8548—57. DOI:10.1021/bi00194a021. PMID 8031790.
  • Taccioli GE, Gottlieb TM, Blunt T; et al. (1994). “Ku80: product of the XRCC5 gene and its role in DNA repair and V(D)J recombination”. Science. 265 (5177): 1442—5. DOI:10.1126/science.8073286. PMID 8073286.
  • Chen DJ, Marrone BL, Nguyen T; et al. (1994). “Regional assignment of a human DNA repair gene (XRCC5) to 2q35 by X-ray hybrid mapping”. Genomics. 21 (2): 423—7. DOI:10.1006/geno.1994.1287. PMID 8088837.
  • Maruyama K, Sugano S (1994). “Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides”. Gene. 138 (1–2): 171—4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
  • Kaczmarski W, Khan SA (1993). “Lupus autoantigen Ku protein binds HIV-1 TAR RNA in vitro”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 196 (2): 935—42. DOI:10.1006/bbrc.1993.2339. PMID 8240370.
  • Blunt T, Taccioli GE, Priestley A; et al. (1996). “A YAC contig encompassing the XRCC5 (Ku80) DNA repair gene and complementation of defective cells by YAC protoplast fusion”. Genomics. 30 (2): 320—8. DOI:10.1006/geno.1995.9871. PMID 8586433.
  • Warriar N, Pagé N, Govindan MV (1996). “Expression of human glucocorticoid receptor gene and interaction of nuclear proteins with the transcriptional control element”. J. Biol. Chem. 271 (31): 18662—71. DOI:10.1074/jbc.271.31.18662. PMID 8702520.
  • Myung K, He DM, Lee SE, Hendrickson EA (1997). “KARP-1: a novel leucine zipper protein expressed from the Ku86 autoantigen locus is implicated in the control of DNA-dependent protein kinase activity”. Embo J. 16 (11): 3172—84. DOI:10.1093/emboj/16.11.3172. PMID 9214634.
  • Jin S, Kharbanda S, Mayer B; et al. (1997). “Binding of Ku and c-Abl at the kinase homology region of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit”. J. Biol. Chem. 272 (40): 24763—6. DOI:10.1074/jbc.272.40.24763. PMID 9312071.
Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Вы можете помочь проекту, дополнив её.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .



Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии