WikiSort.ru - Не сортированное

	Cedratvirus
Научная классификация
Домен:	Вирусы[1]
Семейство:	Pithoviridae
Род:	Cedratvirus
Международное научное название
	Cedratvirus
Виды
	Cedratvirus A11; Cedratvirus getuliensis; Cedratvirus lausannensis;
Группа по Балтимору
	I: дцДНК-вирусы

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Cedratvirus (лат.) — род гигантских вирусов из семейства Pithoviridae, имеющий вирионы яйцевидной формы. Cedratvirus отличается от других вирусов наличием двуслойных покровов^[2].

Первый представитель рода Cedratvirus A11 описан в 2016 году при совместной культивации амёб Acanthamoeba castellanii с различными образцами окружающей среды, взятыми из Алжира^[2].

По состоянию на ноябрь 2018 года род Cedratvirus не зарегистрирован в базе данных Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV)^[3].

Описание

Вирионы Cedratvirus достигают в длину от 1 до 1,2 мкм и до 0,5 мкм в диаметре. По форме вирионы яйцевидные и похожи на вирионы Pithovirus sibericum, кроме того, они имеют двуслойные покровы. Толщина покровов вириона различна в разные стадии инфекционного цикла. На ранних этапах инфекции наружный слой имеет толщину 40 ± 5 нм, а позднее утолщается до 55 ± 5 нм. Такие изменения могут быть вызваны интернализацией вирусных частиц в фагосомах и вакуолях амёбы, а также постепенным разрушением вирионов после выхода вирусной ДНК в цитоплазму клетки. Как и у P. sibericum, ДНК выходит в цитоплазму через особое отверстие в капсиде^[2].

Геном Cedratvirus представлен двуцепочечной кольцевой молекулой ДНК, состоящей из 589068 пар оснований (п. о.). GC-состав генома равен 42,6 %. Несмотря на морфологическую схожесть вирионов с вирионами Pithovirus, геном Cedratvirus короче, чем у P. sibericum и P. massiliensis, на 21 и 97 тысячу п. о. соответственно. В геноме Cedratvirus не выявлено палиндромных^[en] повторяющихся последовательностей, однако обнаружено 27 возможных областей повторов. В геноме Cedratvirus закодировано 574 предсказанных белков, что больше, чем у вирусов рода Pithovirus. Генов тРНК в геноме не обнаружено. Для 177 белков Cedratvirus в базах данных не удалось найти гомологов. 258 его белков гомологичны белкам других вирусов, 108 — белкам эукариот и лишь 31 — белкам прокариот. Среди вирусных белков 84,1 % гомологов принадлежат Pithovirus. Белки-гомологи эукариотического происхождения принадлежат зелёной водоросли Micromonas pusilla, амёбе-хозяину A. castellanii и бурой водоросли Ectocarpus siliculosus^[en]. Из тех генов Cedratvirus, которые удалось аннотировать, многие задействованы в уникальных для гигантских вирусов процессах: например, были найдены гены биосинтеза ароматических аминокислот^[en] и ген D-3-фосфоглицератдегидрогеназы^[en]. Также выявлены две копии гена рибонуклеазы III и один дальний гомолог гена рибонуклеазы H^[en]^[2].

Жизненный цикл

Инфекционный цикл Cedratvirus начинается стандартно для гигантских вирусов: вирионы фагоцитируются амёбой, попадают в фагосомы и далее вакуоли, после слияния внутренней вирусной мембраны и мембраны вакуоли вирусная ДНК выходит в цитоплазму. В выходе ДНК задействован, по-видимому, только один слой двуслойного капсида. В цитоплазме также выявляется некоторое количество пустых вирусных частиц, не содержащих ДНК. Через 4 часа после заражения в цитоплазме клетки появляется вирусная фабрика. Через два—четыре часа в них выявляются зрелые вирионы, хотя образование новых частиц не останавливается. Через 10 часов после заражения культуры некоторые клетки разрываются, высвобождая вирусные частицы, а через 24 часа после заражения наступает полный лизис культуры^[2].

Филогения и родственные связи

Считается, что ближайшими родственниками Cedratvirus являются Pithovirus sibericum и Pithovirus massiliensis, поэтому предварительно оба рода относят к семейству Pithoviridae^[2]. В 2017 году было объявлено об открытии ещё одного представителя Cedratvirus — Cedratvirus lausannensis, который также близок к Pithovirus. Он был обнаружен в образце воды для полива растений во Франции^[4]. В 2018 году был описан ещё один представитель рода — Cedratvirus getuliensis, который был обнаружен в Бразилии^[5]. Филогенетический анализ 2018 года показал, что бразильский вирус образует отдельную эволюционную ветвь в роде Cedratvirus^[6].

Примечания

↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
1 2 3 4 5 6 Andreani J., Aherfi S., Bou Khalil J. Y., Di Pinto F., Bitam I., Raoult D., Colson P., La Scola B. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, is a Distant Relative of Pithoviruses. (англ.) // Viruses. — 2016. — 3 November (vol. 8, no. 11). — DOI:10.3390/v8110300. — PMID 27827884. [исправить]
↑ Search Cedratvirus in ICTV database (неопр.). Проверено 11 ноября 2018.
↑ Bertelli C., Mueller L., Thomas V., Pillonel T., Jacquier N., Greub G. Cedratvirus lausannensis - digging into Pithoviridae diversity. (англ.) // Environmental Microbiology. — 2017. — October (vol. 19, no. 10). — P. 4022—4034. — DOI:10.1111/1462-2920.13813. — PMID 28618143. [исправить]
↑ Silva LKDS, Andrade ACDSP, Dornas F. P., Rodrigues RAL, Arantes T., Kroon E. G., Bonjardim C. A., Abrahão J. S. Cedratvirus getuliensis replication cycle: an in-depth morphological analysis. (англ.) // Scientific Reports. — 2018. — 5 March (vol. 8, no. 1). — P. 4000—4000. — DOI:10.1038/s41598-018-22398-3. — PMID 29507337. [исправить]
↑ Rodrigues RAL, Andreani J., Andrade ACDSP, Machado T. B., Abdi S., Levasseur A., Abrahão J. S., La Scola B. Morphologic and Genomic Analyses of New Isolates Reveal a Second Lineage of Cedratviruses. (англ.) // Journal Of Virology. — 2018. — 1 July (vol. 92, no. 13). — DOI:10.1128/JVI.00372-18. — PMID 29695424. [исправить]

Ссылки

Cedratvirus A11 (англ.) на сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). (Проверено 21 ноября 2018).
Cedratvirus lausannensis (англ.) на сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). (Проверено 21 ноября 2018).

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[1] Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).

[first-2] 1 2 3 4 5 6 Andreani J., Aherfi S., Bou Khalil J. Y., Di Pinto F., Bitam I., Raoult D., Colson P., La Scola B. Cedratvirus, a Double-Cork Structured Giant Virus, is a Distant Relative of Pithoviruses. (англ.) // Viruses. — 2016. — 3 November (vol. 8, no. 11). — DOI:10.3390/v8110300. — PMID 27827884. [исправить]

[3] Search Cedratvirus in ICTV database (неопр.). Проверено 11 ноября 2018.

[4] Bertelli C., Mueller L., Thomas V., Pillonel T., Jacquier N., Greub G. Cedratvirus lausannensis - digging into Pithoviridae diversity. (англ.) // Environmental Microbiology. — 2017. — October (vol. 19, no. 10). — P. 4022—4034. — DOI:10.1111/1462-2920.13813. — PMID 28618143. [исправить]

[:1-5] Silva LKDS, Andrade ACDSP, Dornas F. P., Rodrigues RAL, Arantes T., Kroon E. G., Bonjardim C. A., Abrahão J. S. Cedratvirus getuliensis replication cycle: an in-depth morphological analysis. (англ.) // Scientific Reports. — 2018. — 5 March (vol. 8, no. 1). — P. 4000—4000. — DOI:10.1038/s41598-018-22398-3. — PMID 29507337. [исправить]

[6] Rodrigues RAL, Andreani J., Andrade ACDSP, Machado T. B., Abdi S., Levasseur A., Abrahão J. S., La Scola B. Morphologic and Genomic Analyses of New Isolates Reveal a Second Lineage of Cedratviruses. (англ.) // Journal Of Virology. — 2018. — 1 July (vol. 92, no. 13). — DOI:10.1128/JVI.00372-18. — PMID 29695424. [исправить]