| Bradyrhizobium japonicum | |||||||||||||||
 Bradyrhizobium japonicum штамма USDA 110 на агаровой подложке | |||||||||||||||
| Научная классификация | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
промежуточные ранги
| |||||||||||||||
| Международное научное название | |||||||||||||||
| Синонимы | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| |||||||||||||||
Bradyrhizobium japonicum (лат.) — вид клубеньковых бактерий, сапрофитный азотфиксирующий симбионт сои (Glycine max). Один из самых экономически важных видов бактерий[2].
Описание
Грамотрицательная палочковидная бактерия. Как и другие виды рода Bradyrhizobium медленно растёт в культуре и подщелачивает среду без сыворотки. С 2002 года существует последовательность генома B. japonicum. Размер генома составляет 9105828 пар оснований, содержание GC последовательностей около 64,1 %[3].
B. japonicum способен разлагать катехин с образованием флороглюциновой кислоты, которая затем декарбоксилируется с образованием флороглюцина, который дегидроксилируется до резорцина. Резорцин в свою очередь гидроксилируется с образованием гидроксихинола[4].
Нитратное дыхание
B. japonicum обладает геном nosRZDFYLX, который кодирует фермент, участвующий в денитрификации. Этот фермент имеет две каталитические субъединицы — Cu-a и Cu-z (с несколькими остатками гистидина). Он запускает последовательный каскад экспресси генов, обозначаемый как 'FixJ-FixK2-FixK1', который чувствителен к концентрации кислорода. FixJ положительно регулирует FixK2, который активирует гены нитратного дыхания, а также белок FixK1. Мутанты по FixK1 не способны к нитратному дыханию из-за дефекта медьсодержащей каталитической субъединицы (Cu-z) в гене nosRZDFYLX[5].
Использование
Эта бактерия часто используется в качестве модельного организма для изучения ферментов дыхания[6]. В. japonicum штамма USDA 110, который был впервые выделен из конкреций урожая сои в штате Флорида, США, в 1957 году, широко используется для исследований в области молекулярной генетики, физиологии, экологии[7]. Это связано с тем, что штамм B. japonicum USDA110 имеет более высокий уровень азотфиксации, чем другие штаммы[7].
Примечания
- ↑ Transfer of Rhizobium japonicum Buchanan 1980 to Bradyrhizobium gen. nov., a genus of slow-growing, root nodule bacteria from leguminous plants. Int. J. Syst. Bacteriol., 1982, 32, 136-139.
- ↑ A. B. Hollis, W. E. Kloos & G. E. Elkan (1981). “DNA:DNA hybridization studies of Rhizobium japonicum and related Rhizobiaceae”. Journal of General Microbiology. 123: 215—222. DOI:10.1099/00221287-123-2-215.
- ↑ “Complete Genomic Sequence of Nitrogen-fixing Symbiotic Bacterium Bradyrhizobium japonicum USDA110”. 2002: 189—197. Неизвестный параметр
|vollum=(справка); Неизвестный параметр|Author=(предлагается|author=) (справка на английском) - ↑ Waheeta Hopper & A. Mahadevan (1997). “Degradation of catechin by Bradyrhizobium japonicum”.
- ↑ D. Nellen-Anthamatten, P. Rossi; et al. (1998). “Bradyrhizobium japonicum, FixK2, a Crucial Distributor in the FixLJ-Dependent Regulatory Cascade for Control of Genes Inducible by Low Oxygen Levels”. [Journal of Bacteriology]. 180 (19): 5251—5255.
- ↑ Westenberg, DJ Bradyrhizobium japonicum (недоступная ссылка). Missouri University of Science and Technology (2008). Проверено 11 июля 2011. Архивировано 16 сентября 2012 года.
- 1 2 [EBI] European Bioinfomatics Institute Bacteria Genomes - BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM. European Bioinfomatics Institute (2011). Проверено 12 июля 2011.
Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".
Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.
Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .