WikiSort.ru - Не сортированное

Матриксная металлопротеиназа 16
PDB rendering based on 1rm8.
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 1RM8
Идентификаторы
Символ	MMP16 ; C8orf57; MMP-X2; MT-MMP2; MT-MMP3; MT3-MMP
Внешние ID	OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 ChEMBL: 2200 GeneCards: MMP16 Gene
номер EC	3.4.24.-
Генная онтология Функция • metalloendopeptidase activity • calcium ion binding • enzyme activator activity • zinc ion binding Компонент клетки • proteinaceous extracellular matrix • Golgi lumen • plasma membrane • integral component of plasma membrane • cell surface Биологический процесс • proteolysis • extracellular matrix disassembly • extracellular matrix organization • collagen catabolic process • positive regulation of catalytic activity Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	4325	17389
Ensembl	ENSG00000156103	ENSMUSG00000028226
UniProt	P51512	Q9WTR0
RefSeq (мРНК)	NM_005941	NM_019724
RefSeq (белок)	NP_005932	NP_062698
Локус (UCSC)	Chr 8: 89.04 – 89.34 Mb	Chr 4: 17.85 – 18.12 Mb
Поиск в PubMed
Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Матриксная металлопротеиназа 16 (англ. matrix metallopeptidase 16, MMP16) — мембранная эндопептидаза подсемейства матриксных металлопротеиназ, кодируется геном человека MMP16.

Функция

MMP16 расщепляет различные компоненты внеклеточного матрикса, включая коллаген III типа и фибронектин. Активирует прожелатиназу A. Участвует в перестройке сосудов.

Взаимодействует с CSPG4 через хондроитинсульфат-гликозаминогликановую цепь последнего.

Структура

Синтезированный белок состоит из 607 аминокислот. После отщепления сигнального пептида и пропептида эндопептидазой фурином зрелый белок включает 488 аминокислот. Состоит из N-концевого внеклеточного участка (445 аминокислот), единственного трансмембранного фрагмента и короткого (22 аминокислоты) цитозольного участка. Внеклеточный участок включает 4 гемопексин-подобных доменов, цистеиновый переключатель, 4 участка связывания цинка и каталитический центр, 1 участок N-гликозилирования и 1 участок фосфорилирования (по тирозину-52).^[1]

Тканевая специфичность

MMP15 экспрессируется в сердце, мозге, плаценте, яичниках и тонком кишечнике. Короткая изоформа синтезируется в яичниках.

См. также

• Матриксная металлопротеиназа

Примечания

Библиография

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH; et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Jung M, Römer A, Keyszer G; et al. (2003). “mRNA expression of the five membrane-type matrix metalloproteinases MT1-MT5 in human prostatic cell lines and their down-regulation in human malignant prostatic tissue”. Prostate. 55 (2): 89—98. DOI:10.1002/pros.10194. PMID 12661033.
• Takino T, Koshikawa N, Miyamori H; et al. (2003). “Cleavage of metastasis suppressor gene product KiSS-1 protein/metastin by matrix metalloproteinases”. Oncogene. 22 (30): 4617—26. DOI:10.1038/sj.onc.1206542. PMID 12879005.
• Rozanov DV, Hahn-Dantona E, Strickland DK, Strongin AY (2004). “The low density lipoprotein receptor-related protein LRP is regulated by membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) proteolysis in malignant cells”. J. Biol. Chem. 279 (6): 4260—8. DOI:10.1074/jbc.M311569200. PMID 14645246.
• Lang R, Braun M, Sounni NE; et al. (2004). “Crystal structure of the catalytic domain of MMP-16/MT3-MMP: characterization of MT-MMP specific features”. J. Mol. Biol. 336 (1): 213—25. DOI:10.1016/j.jmb.2003.12.022. PMID 14741217.
• Shofuda T, Shofuda K, Ferri N; et al. (2004). “Cleavage of focal adhesion kinase in vascular smooth muscle cells overexpressing membrane-type matrix metalloproteinases”. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 24 (5): 839—44. DOI:10.1161/01.ATV.0000126680.78500.4c. PMID 15044209.
• Wang SC, Lien HC, Xia W; et al. (2004). “Binding at and transactivation of the COX-2 promoter by nuclear tyrosine kinase receptor ErbB-2”. Cancer Cell. 6 (3): 251—61. DOI:10.1016/j.ccr.2004.07.012. PMID 15380516.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA; et al. (2004). “The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)”. Genome Res. 14 (10B): 2121—7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y; et al. (2006). “Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes”. Genome Res. 16 (1): 55—65. DOI:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.