WikiSort.ru - Не сортированное

Белок метил-CpG связывающего домена 3
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
	2MB7
Идентификаторы
Символ	MBD3
Внешние ID	OMIM: 603573 MGI: 1333812 HomoloGene: 2917 GeneCards: MBD3 Gene
Генная онтология
Функция	• RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • protein binding; • methyl-CpG binding; • nucleosomal DNA binding;
Компонент клетки	• nuclear chromatin; • heterochromatin; • cytoplasm; • NuRD complex; • protein complex;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • in utero embryonic development; • methylation-dependent chromatin silencing; • transcription, DNA-templated; • tissue development; • histone acetylation; • ATP-dependent chromatin remodeling;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи
	Шаблон: просмотр • обсуждение • править

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Белок метил-CpG-связывающего домена 3 — белок, кодируемый у человека геном MBD3^[1]^[2]^[3].

Функция

Метилирование ДНК является основной модификацией генома эукариот и играет важную роль в развитии млекопитающих. Белки человека MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 и MBD4 относятся к семейству ядерных белков, объединённых по признаку наличия метил-CpG связывающего домена^[en]. Однако, в отличие от других членов семейства, MBD3 не способен связываться с метилированной ДНК, но вместо этого связывается с гидроксиметилированной ДНК . Первичная структура MBD3 на 71 % и 94 % идентична структуре MBD2 (изоформа1) и мышиному Mbd3. MBD3 является субъединицей мультисубъединичного комплекса NuRD, способный модифицировать нуклеосомы и обладающего гистондеацетилазной активностью. MBD3 опосредует связывания метастаз-ассоциироованного белка 2 (MTA2) с ядром гистондеацетилазного комплекса^[3].

MBD3 также содержит домен спиральной катушки (coiled-coil), общий для всех трех известных изоформ MBD3. Именно домен спиральной катушки, а не MBD домен, помогает поддерживать плюрипотентность эмбриональных стволовых клеток, направляя поликомб репрессорный комплекс 2 (PRC2) на подмножества генов, связанных с развитием и органогенезом, тем самым поддерживая их стабильную репрессию^[4].

Взаимодействия

MBD3,как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

↑ Hendrich B, Bird A (Nov 1998). “Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins”. Mol Cell Biol. 18 (11): 6538—47. PMC 109239. PMID 9774669.
↑ Hendrich B, Abbott C, McQueen H, Chambers D, Cross S, Bird A (Sep 1999). “Genomic structure and chromosomal mapping of the murine and human Mbd1, Mbd2, Mbd3, and Mbd4 genes”. Mamm Genome. 10 (9): 906—12. DOI:10.1007/s003359901112. PMID 10441743.
1 2 Entrez Gene: MBD3 methyl-CpG binding domain protein 3 (неопр.).
↑ Hirasaki, M., Ueda, A., Asaka, M. N., Uranishi, K., Suzuki, A., Kohda, M., ... & Koseki, H. (2018). Identification of the Coiled‐Coil Domain as an Essential Mbd3 Element for Preserving Lineage Commitment Potential of Embryonic Stem Cells. STEM CELLS. DOI:10.1002/stem.2849
1 2 3 Sakai H, Urano T, Ookata K, Kim MH, Hirai Y, Saito M, Nojima Y, Ishikawa F (2002). “MBD3 and HDAC1, two components of the NuRD complex, are localized at Aurora-A-positive centrosomes in M phase”. J. Biol. Chem. 277 (50): 48714—23. DOI:10.1074/jbc.M208461200. PMID 12354758.
↑ Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (2002). “Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3”. J. Biol. Chem. 277 (43): 40958—66. DOI:10.1074/jbc.M207467200. PMID 12183469.
↑ Feng Q, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Zhang Y (2002). “Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex”. Mol. Cell. Biol. 22 (2): 536—46. DOI:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. PMC 139742. PMID 11756549.
1 2 3 Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.
1 2 Saito M, Ishikawa F (2002). “The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2”. J. Biol. Chem. 277 (38): 35434—9. DOI:10.1074/jbc.M203455200. PMID 12124384.
↑ Jiang CL, Jin SG, Pfeifer GP (2004). “MBD3L1 is a transcriptional repressor that interacts with methyl-CpG-binding protein 2 (MBD2) and components of the NuRD complex”. J. Biol. Chem. 279 (50): 52456—64. DOI:10.1074/jbc.M409149200. PMID 15456747.

Литература

Shen L, Zhang Y (2013). “5-Hydroxymethylcytosine: generation, fate, and genomic distribution”. Current Opinion in Cell Biology. 25 (3): 289—96. DOI:10.1016/j.ceb.2013.02.017. PMID 23498661.
Abbott WM, Mellor A, Edwards Y, Feizi T (1989). “Soluble bovine galactose-binding lectin. cDNA cloning reveals the complete amino acid sequence and an antigenic relationship with the major encephalitogenic domain of myelin basic protein”. Biochem. J. 259 (1): 283—90. PMC 1138502. PMID 2470348.
Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (1998). “The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities”. Cell. 95 (2): 279—89. DOI:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. PMID 9790534.
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. PMID 9804427.
Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.
Wade PA, Gegonne A, Jones PL, Ballestar E, Aubry F, Wolffe AP (1999). “Mi-2 complex couples DNA methylation to chromatin remodelling and histone deacetylation”. Nat. Genet. 23 (1): 62—6. DOI:10.1038/12664. PMID 10471500.
Tatematsu KI, Yamazaki T, Ishikawa F (2000). “MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase”. Genes Cells. 5 (8): 677—88. DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x. PMID 10947852.
Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (2001). “Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1”. J. Biol. Chem. 276 (9): 6817—24. DOI:10.1074/jbc.M007372200. PMID 11102443.
Shi Y, Downes M, Xie W, Kao HY, Ordentlich P, Tsai CC, Hon M, Evans RM (2001). “Sharp, an inducible cofactor that integrates nuclear receptor repression and activation”. Genes Dev. 15 (9): 1140—51. DOI:10.1101/gad.871201. PMC 312688. PMID 11331609.
Feng Q, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Zhang Y (2002). “Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex”. Mol. Cell. Biol. 22 (2): 536—46. DOI:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. PMC 139742. PMID 11756549.
Schlegel J, Güneysu S, Mennel HD (2002). “Expression of the genes of methyl-binding domain proteins in human gliomas”. Oncol. Rep. 9 (2): 393—5. DOI:10.3892/or.9.2.393. PMID 11836615.
Saito M, Ishikawa F (2002). “The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2”. J. Biol. Chem. 277 (38): 35434—9. DOI:10.1074/jbc.M203455200. PMID 12124384.
Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (2002). “Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3”. J. Biol. Chem. 277 (43): 40958—66. DOI:10.1074/jbc.M207467200. PMID 12183469.
Sakai H, Urano T, Ookata K, Kim MH, Hirai Y, Saito M, Nojima Y, Ishikawa F (2003). “MBD3 and HDAC1, two components of the NuRD complex, are localized at Aurora-A-positive centrosomes in M phase”. J. Biol. Chem. 277 (50): 48714—23. DOI:10.1074/jbc.M208461200. PMID 12354758.
Fujita N, Jaye DL, Kajita M, Geigerman C, Moreno CS, Wade PA (2003). “MTA3, a Mi-2/NuRD complex subunit, regulates an invasive growth pathway in breast cancer”. Cell. 113 (2): 207—19. DOI:10.1016/S0092-8674(03)00234-4. PMID 12705869.
Fujita N, Jaye DL, Geigerman C, Akyildiz A, Mooney MR, Boss JM, Wade PA (2004). “MTA3 and the Mi-2/NuRD complex regulate cell fate during B lymphocyte differentiation”. Cell. 119 (1): 75—86. DOI:10.1016/j.cell.2004.09.014. PMID 15454082.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[pmid9774669-1] Hendrich B, Bird A (Nov 1998). “Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins”. Mol Cell Biol. 18 (11): 6538—47. PMC 109239. PMID 9774669.

[pmid10441743-2] Hendrich B, Abbott C, McQueen H, Chambers D, Cross S, Bird A (Sep 1999). “Genomic structure and chromosomal mapping of the murine and human Mbd1, Mbd2, Mbd3, and Mbd4 genes”. Mamm Genome. 10 (9): 906—12. DOI:10.1007/s003359901112. PMID 10441743.

[entrez-3] 1 2 Entrez Gene: MBD3 methyl-CpG binding domain protein 3 (неопр.).

[4] Hirasaki, M., Ueda, A., Asaka, M. N., Uranishi, K., Suzuki, A., Kohda, M., ... & Koseki, H. (2018). Identification of the Coiled‐Coil Domain as an Essential Mbd3 Element for Preserving Lineage Commitment Potential of Embryonic Stem Cells. STEM CELLS. DOI:10.1002/stem.2849

[pmid12354758-5] 1 2 3 Sakai H, Urano T, Ookata K, Kim MH, Hirai Y, Saito M, Nojima Y, Ishikawa F (2002). “MBD3 and HDAC1, two components of the NuRD complex, are localized at Aurora-A-positive centrosomes in M phase”. J. Biol. Chem. 277 (50): 48714—23. DOI:10.1074/jbc.M208461200. PMID 12354758.

[pmid12183469-6] Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (2002). “Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3”. J. Biol. Chem. 277 (43): 40958—66. DOI:10.1074/jbc.M207467200. PMID 12183469.

[pmid11756549-7] Feng Q, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Zhang Y (2002). “Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex”. Mol. Cell. Biol. 22 (2): 536—46. DOI:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. PMC 139742. PMID 11756549.

[pmid10444591-8] 1 2 3 Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.

[pmid12124384-9] 1 2 Saito M, Ishikawa F (2002). “The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2”. J. Biol. Chem. 277 (38): 35434—9. DOI:10.1074/jbc.M203455200. PMID 12124384.

[pmid15456747-10] Jiang CL, Jin SG, Pfeifer GP (2004). “MBD3L1 is a transcriptional repressor that interacts with methyl-CpG-binding protein 2 (MBD2) and components of the NuRD complex”. J. Biol. Chem. 279 (50): 52456—64. DOI:10.1074/jbc.M409149200. PMID 15456747.