WikiSort.ru - Не сортированное

Регулирующий интерферон фактор 6
Идентификаторы
Символ	IRF6 ; LPS; OFC6; PIT; PPS; PPS1; VWS; VWS1
Внешние ID	OMIM: 607199 MGI: 1859211 HomoloGene: 4479 GeneCards: IRF6 Gene
Генная онтология
Функция	• regulatory region DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • protein binding;
Компонент клетки	• nucleus; • cytoplasm; • cytosol;
Биологический процесс	• transcription, DNA-dependent; • cell cycle arrest; • negative regulation of cell proliferation; • cytokine-mediated signaling pathway; • keratinocyte differentiation; • skin development; • keratinocyte proliferation; • positive regulation of transcription, DNA-dependent; • cell development; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • type I interferon-mediated signaling pathway; • mammary gland epithelial cell differentiation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
	Шаблон: просмотр • обсуждение • править

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Регулирующий интерферон фактор 6 , известный также под именем IRF6 — белок, который у человека, кодируется геном IRF6.^[1]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства регуляторных факторов транскрипции интерферона (IRF). Членов семьи разделяют на высоко консервативный N-терминальный^[en] спираль-поворот-спираль связывающий ДНК домен и менее консервативный С-терминальный^[en] связывающий белки домен.^[2]

Функция IRF6 связана с образованием соединительной ткани, например, что в нёбе.^[3] Этот ген кодирует члена семейства регулирующих факторов транскрипции интерферона (МАФ).

Патология

Мутация в гене IRF6 может привести к аутосомно-доминантному синдрому Ван дер Вуда^[en](англ. Van der Woude syndrome) (VWS)^[4] или связанному с ним синдрому подколенного птеригиума^[en] (PPS).^[5]

Синдром Ван дер Вуда может включать расщепление губы и нёба, наряду с зубными аномалиями и свищами губ. Кроме того, общие аллели в IRF6 также связаны с случаями несиндромальных расщелин губы и/или нёба в исследованиях геномных ассоциаций и во многих исследованиях генов-кандидатов.^[6] Эти нарушения обусловлены мутациями в гене IRF6 и некоторыми из фенотипичных гетерогенностей различного типа мутаций IRF6.^[1] Одним из объяснений этой фенотипической вариации между синдромами базируется на основе дифференциального воздействия на структуру димеризованных мутантных белков. VWS мутации могут привести к гаплонедостаточности^[en] в то время как PPS мутации могут быть следствием отрицательного доминирования в природе.^[7] Спектр мутаций VWS и PPS был недавно объединён.^[8]

Как было показано, IRF6 играет важную роль в развитии кератиноцитов.^[9]^[10] Роль IRF6 в общих формах расщелины губы и нёба также была продемонстрирована^[11] и может объяснить ~ 20 % случаев заячьей губы.^[12] Варианты IRF6 дали убедительные доказательства ассоциации синдромальный щели губы и/или нёба в нескольких исследованиях. Исследование Бирнбаум и коллег в 2009 году подтвердило влияние этого гена на этиологию расщелины губы и/или неба и исследование GENEVA Cleft Consortium, который изучал семьи из нескольких популяций, подтвердили выводы, что мутации IRF6 тесно связаны с расщелиной губы и/или нёба. Роль IRF6 в результате заячьей губы и/или щели нёба подкрепляется анализом IRF6 у мутантных мышей, которые проявляют гиперпролиферативный эпидермис, не подвергаются терминальной дифференцировке, что приводит к нескольким эпителиальных спайкам, которые могут закупоривать полости рта и приводить к заячьей губе. Исследования на животных показывают, что IRF6 определяет пролиферацию кератиноцитов, а также играет ключевую роль в формировании оральной перидермы.

В последнее время, путём использования генетики мышей, анализа экспрессии генов, исследований иммунопреципитации хроматина и анализов люциферазы, было показано, что IRF6 является прямым объектом p63, который лежит в основе нескольких синдромов мальформаций, включающих особенности расщелины и p63 активизирует транскрипцию IRF6 за счет усилительного элемента IRF6. Изменение в усилительном элементе повышает восприимчивость только к заячьей губе. И заячья губа с или без волчьей пасти — эти особенности были замечены только в семьях с мутацией IRF6. Кроме того, различные типы расщелин можно разделить в пределах одного семейства.^[6]

Примечания

1 2 Kondo S, Schutte BC, Richardson RJ, Bjork BC, Knight AS, Watanabe Y, Howard E, de Lima RL, Daack-Hirsch S, Sander A, McDonald-McGinn DM, Zackai EH, Lammer EJ, Aylsworth AS, Ardinger HH, Lidral AC, Pober BR, Moreno L, Arcos-Burgos M, Valencia C, Houdayer C, Bahuau M, Moretti-Ferreira D, Richieri-Costa A, Dixon MJ, Murray JC (October 2002). “Mutations in IRF6 cause Van der Woude and popliteal pterygium syndromes”. Nat. Genet. 32 (2): 285—9. DOI:10.1038/ng985. PMC 3169431. PMID 12219090.
↑ Entrez Gene: IRF6 (неопр.).
↑ Blanton SH, Cortez A, Stal S, Mulliken JB, Finnell RH, Hecht JT (September 2005). “Variation in IRF6 contributes to nonsyndromic cleft lip and palate”. Am. J. Med. Genet. A. 137A (3): 259—62. DOI:10.1002/ajmg.a.30887. PMID 16096995.
↑ Van der Woude, A (June 1954). “Fistula labii inferioris congenita and its association with cleft lip and palate”. Am. J. Hum. Genet. 6 (2): 244—56. PMC 1716548. PMID 13158329.
↑ Gorlin RJ, Sedano HO, Cervenka J (February 1968). “Popliteal pterygium syndrome . A syndrome comprising cleft lip-palate, popliteal and intercrural pterygia, digital and genital anomalies”. Pediatrics. 41: 503—9. PMID 4384166. Неизвестный параметр |isssue= (справка)
1 2 Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (March 2011). “Cleft lip and palate: understanding genetic and environmental influences”. Nat. Rev. Genet. 12 (3): 167—78. DOI:10.1038/nrg2933. PMC 3086810. PMID 21331089.
↑ Little HJ, Rorick NK, Su LI, Baldock C, Malhotra S, Jowitt T, Gakhar L, Subramanian R, Schutte BC, Dixon MJ, Shore P (November 2008). “Missense mutations that cause Van der Woude syndrome and popliteal pterygium syndrome affect the DNA-binding and transcriptional activation functions of IRF6”. Hum. Mol. Genet. 18 (3): 535—45. DOI:10.1093/hmg/ddn381. PMC 2638798. PMID 19036739.
↑ de Lima RL, Hoper SA, Ghassibe M; et al. (April 2009). “Prevalence and non-random distribution of exonic mutations in Interferon Regulatory Factor 6 (IRF6) in 307 families with Van der Woude syndrome and 37 families with popliteal pterygium syndrome”. Genet. Med. 11 (4): 241—7. DOI:10.1097/GIM.0b013e318197a49a. PMC 2789395. PMID 19282774.
↑ Richardson RJ, Dixon J, Malhotra S, Hardman MJ, Knowles L, Boot-Handford RP, Shore P, Whitmarsh A, Dixon MJ (November 2006). “Irf6 is a key determinant of the keratinocyte proliferation-differentiation switch”. Nat. Genet. 38 (11): 1329—34. DOI:10.1038/ng1894. PMID 17041603.
↑ Ingraham CR, Kinoshita A, Kondo S, Yang B, Sajan S, Trout KJ, Malik MI, Dunnwald M, Goudy SL, Lovett M, Murray JC, Schutte BC (November 2006). “Abnormal skin, limb and craniofacial morphogenesis in mice deficient for interferon regulatory factor 6 (Irf6)”. Nat. Genet. 38 (11): 1335—40. DOI:10.1038/ng1903. PMC 2082114. PMID 17041601.
↑ Zucchero TM, Cooper ME, Maher BS, Daack-Hirsch S, Nepomuceno B, Ribeiro L, Caprau D, Christensen K, Suzuki Y, Machida J, Natsume N, Yoshiura K, Vieira AR, Orioli IM, Castilla EE, Moreno L, Arcos-Burgos M, Lidral AC, Field LL, Liu YE, Ray A, Goldstein TH, Schultz RE, Shi M, Johnson MK, Kondo S, Schutte BC, Marazita ML, Murray JC (August 20004). “Interferon regulatory factor 6 (IRF6) gene variants and the risk of isolated cleft lip or palate”. N. Engl. J. Med. 351 (8): 769—80. DOI:10.1056/NEJMoa032909. PMID 15317890. Проверьте дату в |date= (справка на английском)
↑ Rahimov F, Marazita ML, Visel A, Cooper ME, Hitchler MJ, Rubini M, Domann FE, Govil M, Christensen K, Bille C, Melbye M, Jugessur A, Lie RT, Wilcox AJ, Fitzpatrick DR, Green ED, Mossey PA, Little J, Steegers-Theunissen RP, Pennacchio LA, Schutte BC, Murray JC (November 2008). “Disruption of an AP-2α binding site in an IRF6 enhancer is strongly associated with cleft lip”. Nat. Genet. 40 (11): 1341—7. DOI:10.1038/ng.242. PMC 2691688. PMID 18836445.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[pmid12219090-1] 1 2 Kondo S, Schutte BC, Richardson RJ, Bjork BC, Knight AS, Watanabe Y, Howard E, de Lima RL, Daack-Hirsch S, Sander A, McDonald-McGinn DM, Zackai EH, Lammer EJ, Aylsworth AS, Ardinger HH, Lidral AC, Pober BR, Moreno L, Arcos-Burgos M, Valencia C, Houdayer C, Bahuau M, Moretti-Ferreira D, Richieri-Costa A, Dixon MJ, Murray JC (October 2002). “Mutations in IRF6 cause Van der Woude and popliteal pterygium syndromes”. Nat. Genet. 32 (2): 285—9. DOI:10.1038/ng985. PMC 3169431. PMID 12219090.

[entrez-2] Entrez Gene: IRF6 (неопр.).

[pmid16096995-3] Blanton SH, Cortez A, Stal S, Mulliken JB, Finnell RH, Hecht JT (September 2005). “Variation in IRF6 contributes to nonsyndromic cleft lip and palate”. Am. J. Med. Genet. A. 137A (3): 259—62. DOI:10.1002/ajmg.a.30887. PMID 16096995.

[pmid13158329-4] Van der Woude, A (June 1954). “Fistula labii inferioris congenita and its association with cleft lip and palate”. Am. J. Hum. Genet. 6 (2): 244—56. PMC 1716548. PMID 13158329.

[pmid4384166-5] Gorlin RJ, Sedano HO, Cervenka J (February 1968). “Popliteal pterygium syndrome . A syndrome comprising cleft lip-palate, popliteal and intercrural pterygia, digital and genital anomalies”. Pediatrics. 41: 503—9. PMID 4384166. Неизвестный параметр |isssue= (справка)

[pmid21331089-6] 1 2 Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (March 2011). “Cleft lip and palate: understanding genetic and environmental influences”. Nat. Rev. Genet. 12 (3): 167—78. DOI:10.1038/nrg2933. PMC 3086810. PMID 21331089.

[pmid19036739-7] Little HJ, Rorick NK, Su LI, Baldock C, Malhotra S, Jowitt T, Gakhar L, Subramanian R, Schutte BC, Dixon MJ, Shore P (November 2008). “Missense mutations that cause Van der Woude syndrome and popliteal pterygium syndrome affect the DNA-binding and transcriptional activation functions of IRF6”. Hum. Mol. Genet. 18 (3): 535—45. DOI:10.1093/hmg/ddn381. PMC 2638798. PMID 19036739.

[pmid19282774-8] Lima RL, Hoper SA, Ghassibe M; et al. (April 2009). “Prevalence and non-random distribution of exonic mutations in Interferon Regulatory Factor 6 (IRF6) in 307 families with Van der Woude syndrome and 37 families with popliteal pterygium syndrome”. Genet. Med. 11 (4): 241—7. DOI:10.1097/GIM.0b013e318197a49a. PMC 2789395. PMID 19282774.

[pmid17041603-9] Richardson RJ, Dixon J, Malhotra S, Hardman MJ, Knowles L, Boot-Handford RP, Shore P, Whitmarsh A, Dixon MJ (November 2006). “Irf6 is a key determinant of the keratinocyte proliferation-differentiation switch”. Nat. Genet. 38 (11): 1329—34. DOI:10.1038/ng1894. PMID 17041603.

[pmid17041601-10] Ingraham CR, Kinoshita A, Kondo S, Yang B, Sajan S, Trout KJ, Malik MI, Dunnwald M, Goudy SL, Lovett M, Murray JC, Schutte BC (November 2006). “Abnormal skin, limb and craniofacial morphogenesis in mice deficient for interferon regulatory factor 6 (Irf6)”. Nat. Genet. 38 (11): 1335—40. DOI:10.1038/ng1903. PMC 2082114. PMID 17041601.

[pmid15317890-11] Zucchero TM, Cooper ME, Maher BS, Daack-Hirsch S, Nepomuceno B, Ribeiro L, Caprau D, Christensen K, Suzuki Y, Machida J, Natsume N, Yoshiura K, Vieira AR, Orioli IM, Castilla EE, Moreno L, Arcos-Burgos M, Lidral AC, Field LL, Liu YE, Ray A, Goldstein TH, Schultz RE, Shi M, Johnson MK, Kondo S, Schutte BC, Marazita ML, Murray JC (August 20004). “Interferon regulatory factor 6 (IRF6) gene variants and the risk of isolated cleft lip or palate”. N. Engl. J. Med. 351 (8): 769—80. DOI:10.1056/NEJMoa032909. PMID 15317890. Проверьте дату в |date= (справка на английском)

[pmid18836445-12] Rahimov F, Marazita ML, Visel A, Cooper ME, Hitchler MJ, Rubini M, Domann FE, Govil M, Christensen K, Bille C, Melbye M, Jugessur A, Lie RT, Wilcox AJ, Fitzpatrick DR, Green ED, Mossey PA, Little J, Steegers-Theunissen RP, Pennacchio LA, Schutte BC, Murray JC (November 2008). “Disruption of an AP-2α binding site in an IRF6 enhancer is strongly associated with cleft lip”. Nat. Genet. 40 (11): 1341—7. DOI:10.1038/ng.242. PMC 2691688. PMID 18836445.