WikiSort.ru - Не сортированное

Геликаза бокса DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) 5
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
	3FE2, 4A4D
Идентификаторы
Символ	DDX5 ; G17P1; HLR1; HUMP68; p68
Внешние ID	OMIM: 180630 MGI: 105037 HomoloGene: 6797 GeneCards: DDX5 Gene
номер EC	3.6.4.13
Генная онтология
Функция	• transcription coactivator activity; • RNA helicase activity; • ATP-dependent RNA helicase activity; • protein binding; • calmodulin binding; • ATP binding; • enzyme binding; • estrogen receptor binding; • pre-mRNA binding; • poly(A) RNA binding; • calcium-dependent protein binding; • androgen receptor binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleolus; • membrane; • ribonucleoprotein complex; • extracellular vesicular exosome; • catalytic step 2 spliceosome;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA splicing, via spliceosome; • in utero embryonic development; • ATP catabolic process; • transcription, DNA-templated; • circadian rhythm; • cell growth; • positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; • positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • regulation of viral genome replication; • regulation of osteoblast differentiation; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • regulation of androgen receptor signaling pathway; • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator; • regulation of skeletal muscle cell differentiation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи
	Шаблон: просмотр • обсуждение • править

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Предполагаемая АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX5, известная также как белок бокса DEAD 5 или РНК геликаза p68 — фермент, кодируемый у человека геном DDX5^[1].

Функция

Белки DEAD бокса^[en], характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), и предположительно являются РНК геликазами . Они участвуют во многих клеточных процессах, таких как изменения вторичной структуры РНК, инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, сборки рибосом и сплайсосом. Основываясь на характере их распространения, некоторые члены этого семейства, как полагается, участвует в эмбриогенезе, сперматогенезе а также клеточном росте и делении. Этот ген кодирует белок DEAD бокса, являющийся РНК-зависимой АТФазой, а также связанным с пролиферацией ядерным антигеном, специфически реагирующим на опухолевый антиген обезьяньего вируса 40. Этот ген состоит из 13 экзонов, есть несколько вариантов сплайсинга, содержащие последовательности интронов, но изоформы, кодируемые этими транскриптами, обнаружены не были^[1].

Взаимодействия

DDX5, как было выявлено, взаимодействует с:

AKAP8,^[2]
DDX17 (р72),^[3]
DHX9 (РНК геликазы),^[4]
ESR1,^[5]^[6]
Фибрилларин,^[7]
HDAC1,^[8]
NCOA1,^[9]
NCOA2,^[9]
NCOA3,^[9]
p53,^[10]
CTCF.^[11]

Примечания

1 2 Entrez Gene: DDX5 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (неопр.).
↑ Akileswaran L, Taraska JW, Sayer JA, Gettemy JM, Coghlan VM (May 2001). “A-kinase-anchoring protein AKAP95 is targeted to the nuclear matrix and associates with p68 RNA helicase”. J. Biol. Chem. 276 (20): 17448—54. DOI:10.1074/jbc.M101171200. PMID 11279182.
↑ Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV (March 2003). “The highly related DEAD box RNA helicases p68 and p72 exist as heterodimers in cells”. Nucleic Acids Res. 31 (5): 1470—80. DOI:10.1093/nar/gkg236. PMC 149829. PMID 12595555.
↑ Wilson BJ, Giguère V (2007). “Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis”. BMC Genomics. 8: 419. DOI:10.1186/1471-2164-8-419. PMID 18005418.
↑ Endoh H, Maruyama K, Masuhiro Y, Kobayashi Y, Goto M, Tai H, Yanagisawa J, Metzger D, Hashimoto S, Kato S (August 1999). “Purification and Identification of p68 RNA Helicase Acting as a Transcriptional Coactivator Specific for the Activation Function 1 of Human Estrogen Receptor α”. Mol. Cell. Biol. 19 (8): 5363—72. PMC 84379. PMID 10409727.
↑ Rossow KL, Janknecht R (January 2003). “Synergism between p68 RNA helicase and the transcriptional coactivators CBP and p300”. Oncogene. 22 (1): 151—6. DOI:10.1038/sj.onc.1206067. PMID 12527917.
↑ Nicol SM, Causevic M, Prescott AR, Fuller-Pace FV (June 2000). “The nuclear DEAD box RNA helicase p68 interacts with the nucleolar protein fibrillarin and colocalizes specifically in nascent nucleoli during telophase”. Exp. Cell Res. 257 (2): 272—80. DOI:10.1006/excr.2000.4886. PMID 10837141.
↑ Wilson BJ, Bates GJ, Nicol SM, Gregory DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV (August 2004). “The p68 and p72 DEAD box RNA helicases interact with HDAC1 and repress transcription in a promoter-specific manner”. BMC Mol. Biol. 5: 11. DOI:10.1186/1471-2199-5-11. PMC 514542. PMID 15298701.
1 2 3 Watanabe M, Yanagisawa J, Kitagawa H, Takeyama K, Ogawa S, Arao Y, Suzawa M, Kobayashi Y, Yano T, Yoshikawa H, Masuhiro Y, Kato S (March 2001). “A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor α coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA”. EMBO J. 20 (6): 1341—52. DOI:10.1093/emboj/20.6.1341. PMC 145523. PMID 11250900.
↑ Bates GJ, Nicol SM, Wilson BJ, Jacobs AM, Bourdon JC, Wardrop J, Gregory DJ, Lane DP, Perkins ND, Fuller-Pace FV (February 2005). “The DEAD box protein p68: a novel transcriptional coactivator of the p53 tumour suppressor”. EMBO J. 24 (3): 543—53. DOI:10.1038/sj.emboj.7600550. PMC 548656. PMID 15660129.
↑ Yao H, Brick K, Evrard Y, Xiao T, Camerini-Otero RD, Felsenfeld G (2010). “Mediation of CTCF transcriptional insulation by DEAD-box RNA-binding protein p68 and steroid receptor RNA activator SRA”. Genes Dev. 24 (22): 2543—2555. DOI:10.1101/gad.1967810. PMC 2975930. PMID 20966046.

Литература

Iggo RD, Jamieson DJ, MacNeill SA; et al. (1991). “p68 RNA helicase: identification of a nucleolar form and cloning of related genes containing a conserved intron in yeasts”. Mol. Cell. Biol. 11 (3): 1326—33. PMC 369403. PMID 1996094.
Hloch P, Schiedner G, Stahl H (1990). “Complete cDNA sequence of the human p68 protein”. Nucleic Acids Res. 18 (10): 3045. DOI:10.1093/nar/18.10.3045. PMC 330836. PMID 2349099.
Ford MJ, Anton IA, Lane DP (1988). “Nuclear protein with sequence homology to translation initiation factor eIF-4A”. Nature. 332 (6166): 736—8. DOI:10.1038/332736a0. PMID 2451786.
Iggo R, Gough A, Xu W; et al. (1989). “Chromosome mapping of the human gene encoding the 68-kDa nuclear antigen (p68) by using the polymerase chain reaction”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (16): 6211—4. DOI:10.1073/pnas.86.16.6211. PMC 297807. PMID 2762324.
Buelt MK, Glidden BJ, Storm DR (1994). “Regulation of p68 RNA helicase by calmodulin and protein kinase C”. J. Biol. Chem. 269 (47): 29367—70. PMID 7525583.
Brody LC, Abel KJ, Castilla LH; et al. (1995). “Construction of a transcription map surrounding the BRCA1 locus of human chromosome 17”. Genomics. 25 (1): 238—47. DOI:10.1016/0888-7543(95)80131-5. PMID 7774924.
Endoh H, Maruyama K, Masuhiro Y; et al. (1999). “Purification and Identification of p68 RNA Helicase Acting as a Transcriptional Coactivator Specific for the Activation Function 1 of Human Estrogen Receptor α”. Mol. Cell. Biol. 19 (8): 5363—72. PMC 84379. PMID 10409727.
Rössler OG, Hloch P, Schütz N; et al. (2000). “Structure and expression of the human p68 RNA helicase gene”. Nucleic Acids Res. 28 (4): 932—9. DOI:10.1093/nar/28.4.932. PMC 102575. PMID 10648785.
Nicol SM, Causevic M, Prescott AR, Fuller-Pace FV (2000). “The nuclear DEAD box RNA helicase p68 interacts with the nucleolar protein fibrillarin and colocalizes specifically in nascent nucleoli during telophase”. Exp. Cell Res. 257 (2): 272—80. DOI:10.1006/excr.2000.4886. PMID 10837141.
Watanabe M, Yanagisawa J, Kitagawa H; et al. (2001). “A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor α coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA”. EMBO J. 20 (6): 1341—52. DOI:10.1093/emboj/20.6.1341. PMC 145523. PMID 11250900.
Akileswaran L, Taraska JW, Sayer JA; et al. (2001). “A-kinase-anchoring protein AKAP95 is targeted to the nuclear matrix and associates with p68 RNA helicase”. J. Biol. Chem. 276 (20): 17448—54. DOI:10.1074/jbc.M101171200. PMID 11279182.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH; et al. (2002). “Directed proteomic analysis of the human nucleolus”. Curr. Biol. 12 (1): 1—11. DOI:10.1016/S0960-9822(01)00650-9. PMID 11790298.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR; et al. (2002). “Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis”. RNA. 8 (4): 426—39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Liu ZR (2002). “p68 RNA Helicase Is an Essential Human Splicing Factor That Acts at the U1 snRNA-5′ Splice Site Duplex”. Mol. Cell. Biol. 22 (15): 5443—50. DOI:10.1128/MCB.22.15.5443-5450.2002. PMC 133941. PMID 12101238.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH; et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Rossow KL, Janknecht R (2003). “Synergism between p68 RNA helicase and the transcriptional coactivators CBP and p300”. Oncogene. 22 (1): 151—6. DOI:10.1038/sj.onc.1206067. PMID 12527917.
Guil S, Gattoni R, Carrascal M; et al. (2003). “Roles of hnRNP A1, SR Proteins, and p68 Helicase in c-H-ras Alternative Splicing Regulation”. Mol. Cell. Biol. 23 (8): 2927—41. DOI:10.1128/MCB.23.8.2927-2941.2003. PMC 152554. PMID 12665590.
Fujita T, Kobayashi Y, Wada O; et al. (2003). “Full activation of estrogen receptor alpha activation function-1 induces proliferation of breast cancer cells”. J. Biol. Chem. 278 (29): 26704—14. DOI:10.1074/jbc.M301031200. PMID 12738788.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T; et al. (2004). “Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40—5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[entrez-1] 1 2 Entrez Gene: DDX5 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (неопр.).

[pmid11279182-2] Akileswaran L, Taraska JW, Sayer JA, Gettemy JM, Coghlan VM (May 2001). “A-kinase-anchoring protein AKAP95 is targeted to the nuclear matrix and associates with p68 RNA helicase”. J. Biol. Chem. 276 (20): 17448—54. DOI:10.1074/jbc.M101171200. PMID 11279182.

[pmid12595555-3] Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV (March 2003). “The highly related DEAD box RNA helicases p68 and p72 exist as heterodimers in cells”. Nucleic Acids Res. 31 (5): 1470—80. DOI:10.1093/nar/gkg236. PMC 149829. PMID 12595555.

[pmid18005418-4] Wilson BJ, Giguère V (2007). “Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis”. BMC Genomics. 8: 419. DOI:10.1186/1471-2164-8-419. PMID 18005418.

[pmid10409727-5] Endoh H, Maruyama K, Masuhiro Y, Kobayashi Y, Goto M, Tai H, Yanagisawa J, Metzger D, Hashimoto S, Kato S (August 1999). “Purification and Identification of p68 RNA Helicase Acting as a Transcriptional Coactivator Specific for the Activation Function 1 of Human Estrogen Receptor α”. Mol. Cell. Biol. 19 (8): 5363—72. PMC 84379. PMID 10409727.

[pmid12527917-6] Rossow KL, Janknecht R (January 2003). “Synergism between p68 RNA helicase and the transcriptional coactivators CBP and p300”. Oncogene. 22 (1): 151—6. DOI:10.1038/sj.onc.1206067. PMID 12527917.

[pmid10837141-7] Nicol SM, Causevic M, Prescott AR, Fuller-Pace FV (June 2000). “The nuclear DEAD box RNA helicase p68 interacts with the nucleolar protein fibrillarin and colocalizes specifically in nascent nucleoli during telophase”. Exp. Cell Res. 257 (2): 272—80. DOI:10.1006/excr.2000.4886. PMID 10837141.

[pmid15298701-8] Wilson BJ, Bates GJ, Nicol SM, Gregory DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV (August 2004). “The p68 and p72 DEAD box RNA helicases interact with HDAC1 and repress transcription in a promoter-specific manner”. BMC Mol. Biol. 5: 11. DOI:10.1186/1471-2199-5-11. PMC 514542. PMID 15298701.

[pmid11250900-9] 1 2 3 Watanabe M, Yanagisawa J, Kitagawa H, Takeyama K, Ogawa S, Arao Y, Suzawa M, Kobayashi Y, Yano T, Yoshikawa H, Masuhiro Y, Kato S (March 2001). “A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor α coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA”. EMBO J. 20 (6): 1341—52. DOI:10.1093/emboj/20.6.1341. PMC 145523. PMID 11250900.

[pmid15660129-10] Bates GJ, Nicol SM, Wilson BJ, Jacobs AM, Bourdon JC, Wardrop J, Gregory DJ, Lane DP, Perkins ND, Fuller-Pace FV (February 2005). “The DEAD box protein p68: a novel transcriptional coactivator of the p53 tumour suppressor”. EMBO J. 24 (3): 543—53. DOI:10.1038/sj.emboj.7600550. PMC 548656. PMID 15660129.

[pmid20966046-11] Yao H, Brick K, Evrard Y, Xiao T, Camerini-Otero RD, Felsenfeld G (2010). “Mediation of CTCF transcriptional insulation by DEAD-box RNA-binding protein p68 and steroid receptor RNA activator SRA”. Genes Dev. 24 (22): 2543—2555. DOI:10.1101/gad.1967810. PMC 2975930. PMID 20966046.