WikiSort.ru - Не сортированное

ClustalW/ClustalX
Тип	Биоинформатика
Автор	Desmond G. Higgins[d]
Разработчик	Gibson T. (EMBL), Thompson J. (CNRS), Higgins D. (UCD)
Написана на	C++
Операционная система	UNIX, Linux, Mac, Windows
Последняя версия	2.1 (17.11.2010)
Лицензия	GNU GPL 2
Сайт	clustal.org

Clustal Omega
Тип	Биоинформатика
Автор	Desmond G. Higgins[d]
Разработчик	Des Higgins, Fabian Sievers, David Dineen и Andreas Wilm (Conway Institute, UCD)
Написана на	C++
Операционная система	UNIX, Linux, Mac, Windows
Последняя версия	1.2.2 (1.07.2016)
Лицензия	GNU GPL 2
Сайт	clustal.org/omega/

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Clustal (англ. Cluster alignment) — одна из самых широко используемых компьютерных программ для множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей^[1].

Программа представлена в трех версиях:

ClustalW — с интерфейсом командной строки^[2].
ClustalX — с графическим интерфейсом^[3].
Clustal Omega — более современная версия программы, позволяющая выравнивать сотни последовательностей в течение нескольких часов и являющаяся одной из наиболее эффективных программ для множественного выравнивания по данным тестов производительности^[4]. В этой разновидности используется только интерфейс командной строки.

Примечания

↑ Frédéric Dardel, François Képès. Bioinformatics: Genomics and Post-Genomics. Wiley. 2006. p.54
↑ Larkin MA, Blackshields G, Brown NP, Chenna R, McGettigan PA, McWilliam H, Valentin F, Wallace IM, Wilm A, Lopez R, Thompson JD, Gibson TJ, Higgins DG (2007). “ClustalW and ClustalX version 2”. Bioinformatics. 23 (21): 2947—2948. DOI:10.1093/bioinformatics/btm404. PMID 17846036.
↑ Thompson JD, Gibson TJ, Plewniak F, Jeanmougin F, Higgins DG (1997). “The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools”. Nucleic Acids Research. 25 (24): 4876—4882. DOI:10.1093/nar/25.24.4876. PMC 147148. PMID 9396791.
↑ Sievers F, Wilm A, Dineen DG, Gibson TJ, Karplus K, Li W, Lopez R, McWilliam H, Remmert M, Söding J, Thompson JD, Higgins DG (2011). “Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega”. Mol Syst Biol 7. 7 (539). DOI:10.1038/msb.2011.75.

Ссылки

Clustal Homepage (free Unix/Linux, Mac, and Windows download)
Clustal Omega mirror at the EBI (free Unix/Linux, Mac, and Windows download)

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .

Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2024
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии

[1] Frédéric Dardel, François Képès. Bioinformatics: Genomics and Post-Genomics. Wiley. 2006. p.54

[2] Larkin MA, Blackshields G, Brown NP, Chenna R, McGettigan PA, McWilliam H, Valentin F, Wallace IM, Wilm A, Lopez R, Thompson JD, Gibson TJ, Higgins DG (2007). “ClustalW and ClustalX version 2”. Bioinformatics. 23 (21): 2947—2948. DOI:10.1093/bioinformatics/btm404. PMID 17846036.

[3] Thompson JD, Gibson TJ, Plewniak F, Jeanmougin F, Higgins DG (1997). “The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools”. Nucleic Acids Research. 25 (24): 4876—4882. DOI:10.1093/nar/25.24.4876. PMC 147148. PMID 9396791.

[4] Sievers F, Wilm A, Dineen DG, Gibson TJ, Karplus K, Li W, Lopez R, McWilliam H, Remmert M, Söding J, Thompson JD, Higgins DG (2011). “Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega”. Mol Syst Biol 7. 7 (539). DOI:10.1038/msb.2011.75.