WikiSort.ru - Не сортированное

ПОИСК ПО САЙТУ | о проекте

Микрогомологичное соединение концов (МСК), также известное как альтернативное негомологичное соединение концов (Альт-НСК), является одним из путей репарации двунитевых разрывов в ДНК-цепи. Как рассмотрено Маквеем и Ли,[1] главным отличительным свойством МСК является использование микрогомологичных последовательностей, состоящих из 5-25 пар оснований (п.о.) МСК часто связано с хромосомными аномалиями, такими как делеции, транслокации, инверсии и другие сложные перестройки.

Существует два других вида репарации ДНК: гомологичная рекомбинация (ГР) и негомологичное соединение концов (НСК). Но только МСК в процессе починки использует микрогомологичные последовательности, необходимые для выравнивания участков молекулы по обеим сторонам от места разрыва до их непосредственного соединения. МСК использует Ku-белок и ДНК-ПК-зависимый механизм репарации (ДНК-ПК это ДНК-зависимая протеинкиназа, белок из класса трансфераз), а сама репарация происходит во время S-фазы клеточного цикла, в отличие от G0/G1- и ранней S- фаз во время НСК, и во время поздней S- и G- фаз во время ГР.

МСК работает посредством лигирования несовместимых нависающих участков ДНК-цепи, удаления соответствующих нуклеотидов и заполнения потерянных пар оснований. Когда происходит разрыв, гомология вышеупомянутых последовательностей длиной в 5-25 пар оснований используется в качестве базиса для выравнивания цепи по обе стороны от разрыва. После выравнивания любые выступающие участки цепи удаляются, а недостающие нуклеотиды вставляются. Поскольку этот путь репарации не учитывает утерянные пары оснований, а попросту вырезает поврежденные части и соединяет между собой цепи ДНК, он нередко приводит к делеции существенных участков ДНК.

Исходя из вышесказанного видно, что МСК - метод, подверженный ошибкам. Делеция участков ДНК может привести к появлению онкогенов и сыграть роль в развитии рака. В большинстве случаев клетка использует МСК только тогда, когда другие два способа репарации по какой-либо причине недоступны или нежелательны.

Необходимые для МСК гены

Биохимический анализ показывает, что существует по крайней мере 6 генов, необходимых для течения этого вида репарации:  FEN1, LIG3, MRE11, NBS1, PARP1 и XRCC1.[2] Все шесть этих генов активно экспрессируются во время течения нескольких видов рака.

МСК и рак

Работа FEN1 активно выражена в большинстве случаев рака молочной железы,[3] простаты,[4] желудка,[5][6] нейробластомы,[7] поджелудочной железы,[8] легких.[9]

LIG3 связан с хроническим миелолейкозом,[10] множественной миеломой[11] и раком молочной железы.[12]

MRE11 чрезмерно выражен при раке молочной железы.[13]

NBS1 выражен при раке предстательной железы,[14] , при опухолях головы и шеи,[15] а также вовремя плоскоклеточного рака полости рта.[16]

PARP1 активен при лейкемии, вызванной активностью тирозинкиназы BCR-ABL,[17] при нейробластоме,[18] при раке яичек и герминогенных опухолях[19] и при саркоме Юинга,[20]

XRCC1 чрезмерно экспрессируется во время немелкоклеточной легочной карциномы (НЛК),[21] и еще более сильнее в метастатических лимфатических узлах НЛК.[22]Возможно, еще более интересен дефицит экспрессии XRCC1, подавляющий рост опухоли, что было выявлено в ходе экспериментов по индуцированию трех видов рака у мышей (рак толстой кишки, меланома, рак молочной железы).[23]

МСК - мутагенный путь репарации, поскольку всегда приводит к небольшим делециям.[24] С этой точки зрения НСК и ГР намного более аккуратны и эффективны.[25] Какой именно метод будет избран клеткой для починки двухцепочечного разрыва в ДНК -- определяется множеством факторов. Когда гены FEN1, Ligase III, MRE11, NBS1, PARP1 or XRCC1 подвергаются чрезмерной экспрессии (с FEN1 это происходит потому, что его промотр гипометелирован) неточный МСК-метод может быть более предпочтителен как вызывающий высокий уровень мутаций и повышающий риск рака.

При опухолях часто отмечается недостаточная экспрессия одного или нескольких генов репарации ДНК, однако чрезмерная экспрессия генов репарации ДНК менее распространена. Например, по крайней мере 36 ферментов репарации ДНК, когда они мутационно дефективны в клетках зародышевой линии, вызывают повышенный риск развития рака (hereditary cancer syndromes).[26] (см. также DNA repair-deficiency disorder.) Аналогичным образом, экспрессия по меньшей мере 12 генов репарации ДНК часто оказывается эпигенетически подавлена во время некоторых раковых заболеваний. (См. также Epigenetically reduced DNA repair and cancer.) Как правило, недостаточная экспрессия репарационных генов приводит к увеличению количества повреждений в цепи ДНК, а значит увеличивает вероятность развития рака, однако если используется МСК-путь репарации ДНК, уже чрезмерная экспрессия генов FEN1, LIGIII, MRE1, PARP1, NBS1 и XRCC1 может привести к раку, поскольку, как уже говорилось, МСК достаточно мутагенный метод. Это подтверждается наблюдениями, во время которых подавление работы мутагенного белка XRCC1 (вовлеченного в процесс репарации ДНК и составляющего комплекс с белком LIGIII) приводило к снижению прогрессирования рака.

Ссылки

  1. McVey M, Lee SE (2008). “MMEJ repair of double-strand breaks (director's cut): deleted sequences and alternative endings”. Trends Genet. 24 (11): 529—38. DOI:10.1016/j.tig.2008.08.007. PMID 18809224.
  2. Sharma S, Javadekar SM, Pandey M, Srivastava M, Kumari R, Raghavan SC (2015). “Homology and enzymatic requirements of microhomology-dependent alternative end joining”. Cell Death Dis. 6: e1697. DOI:10.1038/cddis.2015.58. PMC 4385936. PMID 25789972.
  3. Singh P, Yang M, Dai H, Yu D, Huang Q, Tan W, Kernstine KH, Lin D, Shen B (2008). “Overexpression and hypomethylation of flap endonuclease 1 gene in breast and other cancers”. Mol. Cancer Res. 6 (11): 1710—7. DOI:10.1158/1541-7786.MCR-08-0269. PMC 2948671. PMID 19010819.
  4. Lam JS, Seligson DB, Yu H, Li A, Eeva M, Pantuck AJ, Zeng G, Horvath S, Belldegrun AS (2006). “Flap endonuclease 1 is overexpressed in prostate cancer and is associated with a high Gleason score”. BJU Int. 98 (2): 445—51. DOI:10.1111/j.1464-410X.2006.06224.x. PMID 16879693.
  5. Kim JM, Sohn HY, Yoon SY, Oh JH, Yang JO, Kim JH, Song KS, Rho SM, Yoo HS, Yoo HS, Kim YS, Kim JG, Kim NS (2005). “Identification of gastric cancer-related genes using a cDNA microarray containing novel expressed sequence tags expressed in gastric cancer cells”. Clin. Cancer Res. 11 (2 Pt 1): 473—82. PMID 15701830.
  6. Wang K, Xie C, Chen D (2014). “Flap endonuclease 1 is a promising candidate biomarker in gastric cancer and is involved in cell proliferation and apoptosis”. Int. J. Mol. Med. 33 (5): 1268—74. DOI:10.3892/ijmm.2014.1682. PMID 24590400.
  7. Krause A, Combaret V, Iacono I, Lacroix B, Compagnon C, Bergeron C, Valsesia-Wittmann S, Leissner P, Mougin B, Puisieux A (2005). “Genome-wide analysis of gene expression in neuroblastomas detected by mass screening”. Cancer Lett. 225 (1): 111—20. DOI:10.1016/j.canlet.2004.10.035. PMID 15922863.
  8. Iacobuzio-Donahue CA, Maitra A, Olsen M, Lowe AW, van Heek NT, Rosty C, Walter K, Sato N, Parker A, Ashfaq R, Jaffee E, Ryu B, Jones J, Eshleman JR, Yeo CJ, Cameron JL, Kern SE, Hruban RH, Brown PO, Goggins M (2003). “Exploration of global gene expression patterns in pancreatic adenocarcinoma using cDNA microarrays”. Am. J. Pathol. 162 (4): 1151—62. DOI:10.1016/S0002-9440(10)63911-9. PMC 1851213. PMID 12651607.
  9. Nikolova T, Christmann M, Kaina B (2009). “FEN1 is overexpressed in testis, lung and brain tumors”. Anticancer Res. 29 (7): 2453—9. PMID 19596913.
  10. Sallmyr A, Tomkinson AE, Rassool FV (2008). “Up-regulation of WRN and DNA ligase IIIalpha in chronic myeloid leukemia: consequences for the repair of DNA double-strand breaks”. Blood. 112 (4): 1413—23. DOI:10.1182/blood-2007-07-104257. PMC 2967309. PMID 18524993.
  11. Herrero AB, San Miguel J, Gutierrez NC (2015). “Deregulation of DNA double-strand break repair in multiple myeloma: implications for genome stability”. PLoS ONE. 10 (3): e0121581. DOI:10.1371/journal.pone.0121581. PMC 4366222. PMID 25790254.
  12. Tobin LA, Robert C, Nagaria P, Chumsri S, Twaddell W, Ioffe OB, Greco GE, Brodie AH, Tomkinson AE, Rassool FV (2012). “Targeting abnormal DNA repair in therapy-resistant breast cancers”. Mol. Cancer Res. 10 (1): 96—107. DOI:10.1158/1541-7786.MCR-11-0255. PMC 3319138. PMID 22112941.
  13. Yuan SS, Hou MF, Hsieh YC, Huang CY, Lee YC, Chen YJ, Lo S (2012). “Role of MRE11 in cell proliferation, tumor invasion, and DNA repair in breast cancer”. J. Natl. Cancer Inst. 104 (19): 1485—502. DOI:10.1093/jnci/djs355. PMID 22914783.
  14. Berlin A, Lalonde E, Sykes J, Zafarana G, Chu KC, Ramnarine VR, Ishkanian A, Sendorek DH, Pasic I, Lam WL, Jurisica I, van der Kwast T, Milosevic M, Boutros PC, Bristow RG (2014). “NBN gain is predictive for adverse outcome following image-guided radiotherapy for localized prostate cancer”. Oncotarget. 5 (22): 11081—90. DOI:10.18632/oncotarget.2404. PMC 4294365. PMID 25415046.
  15. Yang MH, Chiang WC, Chou TY, Chang SY, Chen PM, Teng SC, Wu KJ (2006). “Increased NBS1 expression is a marker of aggressive head and neck cancer and overexpression of NBS1 contributes to transformation”. Clin. Cancer Res. 12 (2): 507—15. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-1231. PMID 16428493.
  16. Hsu DS, Chang SY, Liu CJ, Tzeng CH, Wu KJ, Kao JY, Yang MH (2010). “Identification of increased NBS1 expression as a prognostic marker of squamous cell carcinoma of the oral cavity”. Cancer Sci. 101 (4): 1029—37. DOI:10.1111/j.1349-7006.2009.01471.x. PMID 20175780.
  17. Muvarak N, Kelley S, Robert C, Baer MR, Perrotti D, Gambacorti-Passerini C, Civin C, Scheibner K, Rassool FV (2015). “c-MYC Generates Repair Errors via Increased Transcription of Alternative-NHEJ Factors, LIG3 and PARP1, in Tyrosine Kinase-Activated Leukemias”. Mol. Cancer Res. 13 (4): 699—712. DOI:10.1158/1541-7786.MCR-14-0422. PMC 4398615. PMID 25828893.
  18. Newman EA, Lu F, Bashllari D, Wang L, Opipari AW, Castle VP (2015). “Alternative NHEJ Pathway Components Are Therapeutic Targets in High-Risk Neuroblastoma”. Mol. Cancer Res. 13 (3): 470—82. DOI:10.1158/1541-7786.MCR-14-0337. PMID 25563294.
  19. Mego M, Cierna Z, Svetlovska D, Macak D, Machalekova K, Miskovska V, Chovanec M, Usakova V, Obertova J, Babal P, Mardiak J (2013). “PARP expression in germ cell tumours”. J. Clin. Pathol. 66 (7): 607—12. DOI:10.1136/jclinpath-2012-201088. PMID 23486608.
  20. Newman RE, Soldatenkov VA, Dritschilo A, Notario V (2002). “Poly(ADP-ribose) polymerase turnover alterations do not contribute to PARP overexpression in Ewing's sarcoma cells”. Oncol. Rep. 9 (3): 529—32. DOI:10.3892/or.9.3.529. PMID 11956622.
  21. Kang CH, Jang BG, Kim DW, Chung DH, Kim YT, Jheon S, Sung SW, Kim JH (2010). “The prognostic significance of ERCC1, BRCA1, XRCC1, and betaIII-tubulin expression in patients with non-small cell lung cancer treated by platinum- and taxane-based neoadjuvant chemotherapy and surgical resection”. Lung Cancer. 68 (3): 478—83. DOI:10.1016/j.lungcan.2009.07.004. PMID 19683826.
  22. Kang CH, Jang BG, Kim DW, Chung DH, Kim YT, Jheon S, Sung SW, Kim JH (2009). “Differences in the expression profiles of excision repair crosscomplementation group 1, x-ray repair crosscomplementation group 1, and betaIII-tubulin between primary non-small cell lung cancer and metastatic lymph nodes and the significance in mid-term survival”. J Thorac Oncol. 4 (11): 1307—12. DOI:10.1097/JTO.0b013e3181b9f236. PMID 19745766.
  23. Pettan-Brewer C, Morton J, Cullen S, Enns L, Kehrli KR, Sidorova J, Goh J, Coil R, Ladiges WC (2012). “Tumor growth is suppressed in mice expressing a truncated XRCC1 protein”. Am J Cancer Res. 2 (2): 168—77. PMC 3304571. PMID 22432057.
  24. Liang L, Deng L, Chen Y, Li GC, Shao C, Tischfield JA (2005). “Modulation of DNA end joining by nuclear proteins”. J. Biol. Chem. 280 (36): 31442—9. DOI:10.1074/jbc.M503776200. PMID 16012167.
  25. Ottaviani D, LeCain M, Sheer D (2014). “The role of microhomology in genomic structural variation”. Trends Genet. 30 (3): 85—94. DOI:10.1016/j.tig.2014.01.001. PMID 24503142.
  26. Bernstein C, Prasad AR, Nfonsam V, Bernstein H. (2013).

Ссылки

Данная страница на сайте WikiSort.ru содержит текст со страницы сайта "Википедия".

Если Вы хотите её отредактировать, то можете сделать это на странице редактирования в Википедии.

Если сделанные Вами правки не будут кем-нибудь удалены, то через несколько дней они появятся на сайте WikiSort.ru .




Текст в блоке "Читать" взят с сайта "Википедия" и доступен по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike; в отдельных случаях могут действовать дополнительные условия.

Другой контент может иметь иную лицензию. Перед использованием материалов сайта WikiSort.ru внимательно изучите правила лицензирования конкретных элементов наполнения сайта.

2019-2025
WikiSort.ru - проект по пересортировке и дополнению контента Википедии